5'-O-(4,4'-dimethoxytrityl)-5-(N-heptyl)carbamoylmethyl-2'-deoxyuridine | 384817-44-1

• 分子结构分类: 有机化合物 - 苯类化合物 - 三苯基化合物
• 英文名称: 5'-O-(4,4'-dimethoxytrityl)-5-(N-heptyl)carbamoylmethyl-2'-deoxyuridine
• CAS: 384817-44-1
• 化学式: C₃₉H₄₇N₃O₈
• 分子量: 685.817
• InChiKey: MRIUIBNRUTUMCX-GABYNLOESA-N

物化性质

• 密度：
  1.209±0.06 g/cm3(Predicted)

计算性质

• 辛醇/水分配系数(LogP)：
  4.84
• 重原子数：
  50.0
• 可旋转键数：
  17.0
• 环数：
  5.0
• sp3杂化的碳原子比例：
  0.41
• 拓扑面积：
  141.11
• 氢给体数：
  3.0
• 氢受体数：
  9.0

反应信息

• 作为反应物：
  描述：

  2-氰乙基N,N-二异丙基氯亚磷酰胺 、 5'-O-(4,4'-dimethoxytrityl)-5-(N-heptyl)carbamoylmethyl-2'-deoxyuridine 在 N,N-二异丙基乙胺 作用下， 以 二氯甲烷 为溶剂， 以64.9%的产率得到3'-O-[(2-cyanoethyl)(diisopropylamino)]phosphino-5'-O-(4,4'-dimethoxytrityl)-5-(N-heptyl)carbamoylmethyl-2'-deoxyuridine
  参考文献：
  名称：

  接头臂的末端氨基基团及其在嘧啶核苷C5位置的长度对DNA双链体的热稳定性的影响。

  摘要：

  合成了在C5-位带有取代基的2'-脱氧尿苷衍生物，其具有不同的链长和不同的官能团（甲基或氨基），并掺入到寡脱氧核糖核苷酸中。通过紫外熔融实验研究了主凹槽中取代基对双链体稳定性的影响。发现末端氨基对这些双链体的稳定取决于连接臂的长度。

  DOI：

  10.1006/bioo.2001.1212
• 作为产物：
  描述：

  3',5'-di-O-acetyl-5-(methoxycarbonylmethyl)-2'-deoxyuridine 在 吡啶 、 4-二甲氨基吡啶 、 lithium hydroxide 、 二苯基膦叠氮化物 、 sodium methylate 、 三乙胺 作用下， 以 甲醇 、 水 、 N,N-二甲基甲酰胺 为溶剂， 反应 88.0h， 生成 5'-O-(4,4'-dimethoxytrityl)-5-(N-heptyl)carbamoylmethyl-2'-deoxyuridine
  参考文献：
  名称：

  接头臂的末端氨基基团及其在嘧啶核苷C5位置的长度对DNA双链体的热稳定性的影响。

  摘要：

  合成了在C5-位带有取代基的2'-脱氧尿苷衍生物，其具有不同的链长和不同的官能团（甲基或氨基），并掺入到寡脱氧核糖核苷酸中。通过紫外熔融实验研究了主凹槽中取代基对双链体稳定性的影响。发现末端氨基对这些双链体的稳定取决于连接臂的长度。

  DOI：

  10.1006/bioo.2001.1212