1-<2'-deoxy-5'-O-(4,4'-dimethoxytrityl)-β-D-ribofuranosyl>-5-<<2,2,6,6-tetramethyl-1-(oxyl)piperidin-4-yl>amino>pyrimidine-2,4(1H,3H)-dione 3'<(2-chlorophenyl) triethylammonium phosphate> | 136136-29-3

• 分子结构分类: 有机化合物 - 苯类化合物 - 三苯基化合物
• 英文名称: 1-<2'-deoxy-5'-O-(4,4'-dimethoxytrityl)-β-D-ribofuranosyl>-5-<<2,2,6,6-tetramethyl-1-(oxyl)piperidin-4-yl>amino>pyrimidine-2,4(1H,3H)-dione 3'<(2-chlorophenyl) triethylammonium phosphate>
• 英文别名: triethylammonium 5-<(1-oxyl-2,2,6,6-tetramethyl-4-piperidinyl)amino>-5'-O-dimethoxytrityl-2'-deoxyuridine-3'-(o-chlorophenyl phosphate)；triethylammonium 5-[(1-oxyl-2,2,6,6-tetramethyl-4-piperidinyl)amino]-5'-O-dimethoxytrityl-2'-deoxyuridine-3'-(o-chlorophenyl phosphate)
• CAS: 136136-29-3
• 化学式: C₆H₁₅N*C₄₅H₅₁ClN₄O₁₁P
• 分子量: 991.539
• InChiKey: XSNFAIQCWAJBNQ-QUNQLKTMSA-N

计算性质

• 辛醇/水分配系数(LogP)：
  9.2
• 重原子数：
  69.0
• 可旋转键数：
  18.0
• 环数：
  7.0
• sp3杂化的碳原子比例：
  0.45
• 拓扑面积：
  185.95
• 氢给体数：
  3.0
• 氢受体数：
  13.0

反应信息

• 作为产物：
  描述：

  2-脱氧尿苷 在 吡啶 、 1H-1,2,4-三唑 、 硫酸 作用下， 以 水 为溶剂， 反应 18.0h， 生成 1-<2'-deoxy-5'-O-(4,4'-dimethoxytrityl)-β-D-ribofuranosyl>-5-<<2,2,6,6-tetramethyl-1-(oxyl)piperidin-4-yl>amino>pyrimidine-2,4(1H,3H)-dione 3'<(2-chlorophenyl) triethylammonium phosphate>
  参考文献：
  名称：

  磷酸三酯化学法对寡聚胸苷酸酯进行序列特异性自旋标记

  摘要：

  通过磷酸三酯法合成了具有序列特异性结合的单原子束缚的C（5）-一氧化二氮标记的核苷1的寡胸苷酸（oligo（dT））。需要对协议进行一些修改，以解决一氧化氮的化学反应性，在合成过程中通过电子顺磁共振（EPR）光谱监测了其稳定性。测定了经FPLC纯化的一氧化氮标记的低聚物的EPR比活性（A EPR），发现该酶活性与酶法制备的自旋标记核酸一致。将氮氧化物标记的oligo（dT）退火至（dA）n 或oligo（dA）导致不同的EPR线形变化，表明短束缚的一氧化氮与全局大分子运动之间存在强耦合。

  DOI：

  10.1002/hlca.19910740407

文献信息

• A Comparative Study of the Phosphotriester Versus the Phosphoramidite Approach to Nitroxide Labeled Oligo dT
  作者：R. A. Persichetti、R. R. Sinden、J.-L. Duh、A. M. Bobst

  DOI：10.1080/00397919108019790

  日期：1991.4

  Abstract Deoxyuridine labeled in C-5 with a one-atom-tehered 6-memberedring mitroxide (DUTA) was incorporated into the oligomer d(T)7(DUTA)d(T)7 by either the phosphotriester or phosphoramidite method. While the EPR specific activity (AEPR) of the phosphotriester product concurs with EPR data of nucleic acids spin labeled enzymatically, a lower AEPR is observed with the phosphoramidite product. The

  摘要 通过磷酸三酯或亚磷酰胺方法将在 C-5 中用单原子连接的 6 元二氧化氮 (DUTA) 标记的脱氧尿苷结合到低聚物 d(T)7(DUTA)d(T)7 中。虽然磷酸三酯产物的 EPR 比活性 (AEPR) 与酶促自旋标记的核酸的 EPR 数据一致，但观察到亚磷酰胺产物的 AEPR 较低。DUTA 标签的化学性质更苛刻的亚磷酰胺条件的影响对这些结果负责。