4'-DMTBS-5'-O-(4,4'-二甲氧基三苯甲基)-N6-苯甲酰基腺苷 | 81256-88-4

• 分子结构分类: 有机化合物 - 苯类化合物 - 三苯基化合物
• 中文名称: 4'-DMTBS-5'-O-(4,4'-二甲氧基三苯甲基)-N6-苯甲酰基腺苷
• 英文名称: N-(9-((2R,3R,4S,5R)-5-((bis(4-methoxyphenyl)(phenyl)methoxy)methyl)-4-((tert-butyldimethylsilyl)oxy)-3-hydroxytetrahydrofuran-2-yl)-9H-purin-6-yl)benzamide
• 英文别名: 5'-DMT-3'-TBDMS-Bz-rA；N-[9-[(2R,3R,4S,5R)-5-[[bis(4-methoxyphenyl)-phenylmethoxy]methyl]-4-[tert-butyl(dimethyl)silyl]oxy-3-hydroxyoxolan-2-yl]purin-6-yl]benzamide
• CAS: 81256-88-4
• 化学式: C₄₄H₄₉N₅O₇Si
• 分子量: 787.988
• InChiKey: QNPRMZLAAWKAPQ-GNECSJIWSA-N

物化性质

• 溶解度：
  二甲基亚砜：100 mg/mL（126.91 mM）

计算性质

• 辛醇/水分配系数(LogP)：
  7.75
• 重原子数：
  57
• 可旋转键数：
  14
• 环数：
  7.0
• sp3杂化的碳原子比例：
  0.32
• 拓扑面积：
  139
• 氢给体数：
  2
• 氢受体数：
  10

安全信息

• 危险性防范说明：
  P261,P280,P305+P351+P338
• 危险性描述：
  H302,H315,H319,H332,H335

制备方法与用途

生物活性的5'-DMT-3'-TBDMS-Bz-rA是一种兼具保护和修饰功能的核苷。

反应信息

• 作为反应物：
  描述：

  4'-DMTBS-5'-O-(4,4'-二甲氧基三苯甲基)-N6-苯甲酰基腺苷 在 四氮唑 、 sulfur 作用下， 以 二氯甲烷 为溶剂， 反应 17.3h， 生成 N⁶-benzoyl-5'-O-DMT-3'-O-TBDMS-adenosine 2'-O-(2-thiono-1,3,2-oxathiaphospholane)
  参考文献：
  名称：

  Di，Tri和Tetra [腺苷（2'，5'）硫代磷酸酯] s的第一个立体控制固相合成。

  摘要：

  DOI：

  10.1021/jo980522l
• 作为产物：
  描述：

  N6-苯甲酰基腺苷 在 吡啶 、 4-二甲氨基吡啶 、 silver nitrate 作用下， 以 四氢呋喃 为溶剂， 反应 32.0h， 生成 4'-DMTBS-5'-O-(4,4'-二甲氧基三苯甲基)-N6-苯甲酰基腺苷
  参考文献：
  名称：

  [EN] CYCLIC DINUCLEOTIDES AS AGONISTS OF STIMULATOR OF INTERFERON GENE DEPENDENT SIGNALLING
  [FR] DINUCLÉOTIDES CYCLIQUES UTILISÉS EN TANT QU'AGONISTES DU STIMULATEUR DE LA SIGNALISATION DÉPENDANTE DU GÈNE DE L'INTERFÉRON

  摘要：

  本文披露了新的环二核苷酸化合物和组合物，以及它们作为药物治疗疾病的应用。还提供了调节免疫应答以及诱导干扰素基因激活剂（STING）依赖型I干扰素在人类或动物受试者中产生和共调控基因的方法，用于治疗癌症、尤其是转移性实体瘤和淋巴瘤、炎症、过敏和自身免疫疾病、传染病，以及作为抗病毒剂和疫苗佐剂的用途。

  公开号：

  WO2018156625A1

文献信息

• Spectroscopic and enzymatic characterization of 2′–5′ and 3′–5′ RNA hexamers AACCUU synthesised by phosphotriester approach in solution using 2′-t-butyldimethylsilyl protection
  作者：Vidhya Gopalakrishnan、K.N. Ganesh、Anita Gunjal、S.M. Likhite

  DOI：10.1016/s0040-4020(01)80945-5

  日期：1991.1

  identical base sequence (AACCUU) but are regioisomeric at the internucleotide phosphate linkages (2′–t′, 3′–5′ and their covalent hybrid) are presented. The 31P NMR results revealed significant differences in local phosphate backbone conformation among these isomers, with 2′–5′ isomer exhibiting maximum heterogeneity as compared to the 3′–5′ isomer, the analogous DNA hexamer and the covalent hybrid hexamer

  比较的1 H，31 P NMR和CD光谱结果以及具有相同碱基序列（AACCUU）但在核苷酸间磷酸酯键（2'–t'，3'–5'和它们的共价键是区域异构的单链RNA六聚体的酶促裂解混合）。在31P NMR结果显示这些异构体之间的局部磷酸酯主链构象存在显着差异，与3'-5'异构体，类似的DNA六聚体和共价杂合六聚体相比，2'-5'异构体表现出最大的异质性。与此相反，从2'-5'和3'-5'异构体的CD光谱中可以看出，总体的碱基-碱基堆积没有明显的差异。通过溶液相磷酸三酯化学合成所有的RNA六聚体，其中叔丁基二甲基甲硅烷基（TBDMS）作为2'-O-保护基。完全保护的低聚物通过两个步骤脱保护：（i）饱和无水MeOH = NH 3进行磷酸和氨基脱保护，（ii）TBAF去除2'-O-TBDMS基团。使用坐。MeOHNH 3（而不是水溶液。NH 3）可防止2'–3'核苷酸间磷酸酯迁移，链断裂和邻近基团
• Modified phosphotriester method for chemical synthesis of ribooligonucleotides. Part I. Synthesis of riboundecaadenylate and two fragments constituting the sequence of R-17 translation control signal
  作者：Wing L. Sung、Saran A. Narang

  DOI：10.1139/v82-021

  日期：1982.1.15

  A modified phosphotriester method has been successfully applied for the chemical synthesis of ribooligonucleotides. The starting material is a fully protected ribomononucleoside containing a 3′-phosphotriester group 5. The coupling reaction is performed using mesitylenesulfonyl tetrazole and purification of the product achieved using reversed phase column chromatography. The effectiveness of this method has been demonstrated by achieving an efficient and rapid synthesis of r-A₇, r-A₁₁, r5′-AAACAUGAGGA-3′, and r5′-UUACCCAUGU-3′ (R-17, translation control sequence).

  一种改良的磷酸三酯方法已成功应用于核糖寡核苷酸的化学合成。起始物是含有3'-磷酸三酯基团的完全保护的核糖单核苷酸。偶联反应使用二甲苯磺酰四唑进行，并通过反相柱层析纯化产物。该方法的有效性已通过成功合成r-A₇、r-A₁₁、r5′-AAACAUGAGGA-3′和r5′-UUACCCAUGU-3′（R-17，翻译控制序列）来证明。
• Design, synthesis and systematic evaluation of all possible cyclic dinucleotides (CDNs) that activate human stimulator of interferon genes (STING) variants
  作者：Zheng-Hua Wang、Can-Can Zhao、Qiang-Zhe Zhang、Chuan-Lin Wang、Hang Zhang、De-Jun Ma、Da-Wei Wang、Xin Wen、Lu-Yuan Li、Zhen Xi

  DOI：10.1007/s11426-019-9662-5

  日期：2020.4

  activate stimulator of interferon genes (STING) and induce type I interferon responses, therefor possess great potentials to be of immunotherapeutic value for cancers and infectious diseases. However, the existence of different single nucleotide polymorphism (SNP) of human STING (hSTING) gene poses an obstacle to achieve broad-spectrum activation by CDNs. We reported here the design and synthesis of a

  摘要 已知环二核苷酸（CDN）可激活干扰素基因的刺激物（STING）并诱导I型干扰素应答，因此具有巨大的潜力，对癌症和传染病具有免疫治疗价值。然而，人类STING（hSTING）基因的不同单核苷酸多态性（SNP）的存在构成了通过CDN实现广谱激活的障碍。我们在这里报告了总共36个CDN的设计和合成，这些CDN代表所有结构变异，其中包含四个碱基（A，G，C，U）和两个链接方向（2'-5'-链接和3'-5'） -连接的磷酸二酯）。通过双萤光素酶报告基因检测系统评估IFN-β诱导，我们发现野生型hSTING和两个同工型（HAQ和AQ）表现出强烈的反应，而hSTING-R232H和R293Q表现出对CDNs刺激的相对较弱的反应。首次，我们发现c [G（2'，5'）U（2'，5'）]对所有五个hSTING变体均表现出优异的活性，甚至等同于内源性配体c [G（2'，5 ′）A（3′，5′）]。此外，我
• CYCLIC DINUCLEOTIDES AS ANTICANCER AGENTS
  申请人：BRISTOL-MYERS SQUIBB COMPANY

  公开号：US20190030057A1

  公开（公告）日：2019-01-31

  The present invention is directed to compounds of the formulae I, II and III as shown below wherein all substituents are defined herein, as well as pharmaceutically acceptable compositions comprising compounds of the invention and methods of using said compositions in the treatment of various disorders.

  本发明涉及以下式I、II和III的化合物，其中所有取代基如本文所定义，以及包括本发明化合物的药用可接受组合物和使用该组合物治疗各种疾病的方法。
• CYCLIC DINUCLEOTIDE COMPOUND AND USES THEREOF
  申请人：SHANGHAI JEMINCARE PHARMACEUTICALS CO., LTD.

  公开号：US20210340169A1

  公开（公告）日：2021-11-04

  Provided are a compound of formula (I), an optical isomer thereof, a pharmaceutically acceptable salt thereof, uses of said compound acting as a STING agonist.

  提供的是化合物（I）的化学式，其光学异构体，其药用盐，以及作为STING激动剂的该化合物的用途。