6-(2-(((9H-fluoren-9-yl)methoxy)carbonylamino)-3-(allyloxy)-3-oxopropoxy)-2-(acetoxymethyl)-5-(2-tritylmercaptoacetamido)tetrahydro-2H-pyran-3,4-diyl diacetate | 888788-10-1

• 分子结构分类: 有机化合物 - 苯类化合物 - 三苯基化合物
• 英文名称: 6-(2-(((9H-fluoren-9-yl)methoxy)carbonylamino)-3-(allyloxy)-3-oxopropoxy)-2-(acetoxymethyl)-5-(2-tritylmercaptoacetamido)tetrahydro-2H-pyran-3,4-diyl diacetate
• CAS: 888788-10-1
• 化学式: C₅₄H₅₄N₂O₁₃S
• 分子量: 971.094
• InChiKey: FBZIKVKGKBECHA-ZRTYGHDTSA-N

计算性质

• 辛醇/水分配系数(LogP)：
  7.0
• 重原子数：
  70.0
• 可旋转键数：
  20.0
• 环数：
  7.0
• sp3杂化的碳原子比例：
  0.3
• 拓扑面积：
  191.09
• 氢给体数：
  2.0
• 氢受体数：
  14.0

反应信息

• 作为反应物：
  描述：

  6-(2-(((9H-fluoren-9-yl)methoxy)carbonylamino)-3-(allyloxy)-3-oxopropoxy)-2-(acetoxymethyl)-5-(2-tritylmercaptoacetamido)tetrahydro-2H-pyran-3,4-diyl diacetate 在 哌啶 、 1-羟基苯并三唑 、 O-(1H-benzotriazol-1-yl)-N,N,N',N'-tetramethyluronium hexafluorophosphate 、 N,N-二异丙基乙胺 作用下， 以 N,N-二甲基甲酰胺 为溶剂， 反应 2.75h， 生成 (S)-2-(2-tert-Butoxycarbonylamino-acetylamino)-3-[(2R,3R,4R,5S,6R)-4,5-diacetoxy-6-acetoxymethyl-3-(2-tritylsulfanyl-acetylamino)-tetrahydro-pyran-2-yloxy]-propionic acid allyl ester
  参考文献：
  名称：

  METHOD OF PREPARING GLYCOPEPTIDES

  摘要：

  公开号：

  EP1996609B1
• 作为产物：
  描述：

  N-(9-fluorenylmethoxycarbonyl)-L-serine allyl ester 在 MS (AW-300) 、 O-(1H-benzotriazol-1-yl)-N,N,N',N'-tetramethyluronium hexafluorophosphate 、 N,N-二异丙基乙胺 作用下， 以 二氯甲烷 、 N,N-二甲基甲酰胺 为溶剂， 反应 12.5h， 生成 6-(2-(((9H-fluoren-9-yl)methoxy)carbonylamino)-3-(allyloxy)-3-oxopropoxy)-2-(acetoxymethyl)-5-(2-tritylmercaptoacetamido)tetrahydro-2H-pyran-3,4-diyl diacetate
  参考文献：
  名称：

  糖辅助糖肽连接

  摘要：

  从现成的材料中化学合成糖肽和糖蛋白为获得用于结构和功能研究的均质产品提供了一条有吸引力的途径。基于天然化学连接的糖肽和糖蛋白的化学合成代表了合成天然糖肽结构的有用方法之一。在这里，我们描述了一种允许从不含半胱氨酸的肽合成糖肽的方法。该方法使用肽硫酯和糖肽，其中糖部分在 C-2 位置用硫醇手柄修饰。连接反应完成后，硫醇手柄可以用 H2/金属还原为乙酰胺部分，提供未修饰的糖肽。一起，

  DOI：

  10.1021/ja061165w

文献信息

• Extended Sugar-Assisted Glycopeptide Ligations:  Development, Scope, and Applications
  作者：Richard J. Payne、Simon Ficht、Sishi Tang、Ashraf Brik、Yu-Ying Yang、David A. Case、Chi-Huey Wong

  DOI：10.1021/ja073653p

  日期：2007.11.1

  of the method we report here the development of an extended SAL method. Glycopeptides containing up to six amino acid extensions N-terminal to the glycosylated residue were shown to facilitate ligation reactions with peptide thioesters, and these products were isolated in good yields. Kinetic analysis was used to show that as glycopeptides were extended by further amino acid residues, ligation reactions

  最近，我们报道了糖辅助连接 (SAL) 的发展，这是一种用于合成糖肽的新型肽连接方法。在对糖蛋白数据库中的大量糖蛋白序列进行筛选后，很明显，很大比例（约 53%）的 O-糖基化位点包含不会发生 SAL 反应的氨基酸残基。为了克服这些固有的局限性并扩大我们在此报告的扩展 SAL 方法的开发范围。糖基化残基 N 端最多含有 6 个氨基酸延伸的糖肽显示出促进与肽硫酯的连接反应，并且这些产物以良好的产率分离。动力学分析表明，随着糖肽被更多氨基酸残基延伸，连接反应变得更慢。这一发现通过使用 AMBER9 的分子动力学模拟得到了合理化。这些研究表明了一个普遍趋势，即硫酯中间体（N 端胺和硫酯的羰基碳）的反应位点之间的近端距离随着糖肽的延长而增加，从而减慢了连接速度。每种扩展的 SAL 方法都对连接点处的许多不同氨基酸组合显示出广泛的耐受性。对糖蛋白数据库的重新评估表明，现在可以利用 95% 的 O-连接糖基化位点来促进