3'-benzoyl-5'-O-(4,4'-dimethoxytrityl)-2'-deoxyuridine | 153275-52-6

• 分子结构分类: 有机化合物 - 苯类化合物 - 三苯基化合物
• 英文名称: 3'-benzoyl-5'-O-(4,4'-dimethoxytrityl)-2'-deoxyuridine
• 英文别名: 3'-O-benzoyl-5'-O-DMT-2-deoxyuridine
• CAS: 153275-52-6
• 化学式: C₃₇H₃₄N₂O₈
• 分子量: 634.686
• InChiKey: KQGBHULKZHTUMW-VOTWKOMSSA-N

计算性质

• 辛醇/水分配系数(LogP)：
  5.08
• 重原子数：
  47.0
• 可旋转键数：
  11.0
• 环数：
  6.0
• sp3杂化的碳原子比例：
  0.22
• 拓扑面积：
  118.08
• 氢给体数：
  1.0
• 氢受体数：
  9.0

反应信息

• 作为反应物：
  描述：

  3'-benzoyl-5'-O-(4,4'-dimethoxytrityl)-2'-deoxyuridine 在 hydroxide 、 N,N-二异丙基乙胺 作用下， 以 乙腈 为溶剂， 生成
  参考文献：
  名称：

  5′-5′ tethered oligonucleotides via nucleic bases: A potential new set of compounds for alternate strand triple-helix formation

  摘要：

  The solid-phase synthesis of 5'-5'-linked oligonucleotides tethered via nucleic bases and with opposite polarities has been performed using a modified dinucleoside bearing a phosphoramidite group at the 3'-position of one nucleoside and a dimethoxytrityl group at the 3'-position of the second nucleoside.

  DOI：

  10.1016/s0040-4039(00)77068-7
• 作为产物：
  描述：

  三氯化苄 在 aluminum (III) chloride 作用下， 以 二氯甲烷 为溶剂， 反应 6.5h， 生成 3'-benzoyl-5'-O-(4,4'-dimethoxytrityl)-2'-deoxyuridine
  参考文献：
  名称：

  可再生的amberlyst-15催化糖基二醇的高度区域选择性三苯甲基化和脱保护

  摘要：

  摘要在4,4'-二甲氧基三苯甲基醇（DMTrOH）的温和条件下，Amberlyst-15催化了糖基二醇的高区域选择性三苯甲基化反应。通过向质子溶剂的变化也建立了相应的DMTr基团的脱保护。同时，均相催化剂Amberlyst-15循环使用了3次，保持了令人满意的催化活性，证明了其在工业中的潜在应用。

  DOI：

  10.1080/07328303.2018.1487974

文献信息

• [EN] NUCLEIC ACID-POLYPEPTIDE COMPOSITIONS AND USES THEREOF<br/>[FR] COMPOSITIONS D'ACIDE NUCLÉIQUE-POLYPEPTIDE ET UTILISATIONS DE CELLES-CI
  申请人：AVIDITY BIOSCIENCES LLC

  公开号：WO2019071028A1

  公开（公告）日：2019-04-11

  Disclosed herein are compositions and pharmaceutical formulations that comprise a binding moiety conjugated to a modified polynucleic acid molecule and a polymer. Also described herein include methods for treating a cancer which utilize a composition or a pharmaceutical formulation comprising a binding moiety conjugated to a polynucleic acid molecule and a polymer.

  本文披露了包含与修饰的多核苷酸分子和聚合物结合基团的组合物和药物配方。本文还描述了利用包含与多核苷酸分子和聚合物结合基团共轭的组合物或药物配方治疗癌症的方法。
• Synthesis of stable azide and alkyne functionalized phosphoramidite nucleosides
  作者：Suresh Lingala、Lars Ulrik Nordstrøm、Prabodhika R. Mallikaratchy

  DOI：10.1016/j.tetlet.2018.12.018

  日期：2019.1

  stabilize oligonucleotides has been limited by the incompatibility of azides with the phosphoramidites used in automated oligonucleotide synthesis. Herein we report optimized reaction conditions to synthesize azide derivatives of thymidine and cytidine phosphoramidites. Investigation of the stability of the novel phosphoramidites using 31P NMR at room temperature showed less than 10% degradation after 6 hours

  叠氮化物与用于自动寡核苷酸合成的亚磷酰胺的不相容性限制了使用CuAAC化学交联和稳定寡核苷酸的方法。在本文中，我们报道了优化的反应条件以合成胸苷和胞苷亚磷酰胺的叠氮化物衍生物。在室温下使用31 P NMR对新型亚磷酰胺的稳定性进行研究，结果表明6小时后降解率不到10％。叠氮化物修饰的胸苷已成功地用作DNA序列标准亚磷酰胺合成中的内部修饰剂。嘧啶的合成的叠氮化物和炔烃衍生物将允许叠氮化物和炔烃点击对有效地掺入核酸，因此拓宽了点击化学在研究核酸化学中的适用性。
• Oligodeoxyribonucleotides Covalently Linked via Nucleic Bases with 3'-5' and 5'-5' Polarities
  作者：Ulysse Asseline、N. T. Thuong

  DOI：10.1080/15257779508012496

  日期：1995.5.1

  The solid-phase preparation of oligodeoxyribonucleotides covalently linked via nucleic bases with normal (3'-5') or inverted (5'-5') polarities is reported. The key-step of these syntheses is the preparation of the tethered dimers.
• Holletz, Torsten; Moeller, Uwe; Knaf, Andrea, Liebigs Annalen der Chemie, 1993, # 10, p. 1051 - 1056
  作者：Holletz, Torsten、Moeller, Uwe、Knaf, Andrea、Reinhardt, Richard、Cech, Dieter

  DOI：——

  日期：——