(S)-1-<2-(2-aminoethoxy)-3-(4,4'-dimethoxytrityloxy)propyl>thymine | 168772-58-5

• 分子结构分类: 有机化合物 - 苯类化合物 - 三苯基化合物
• 英文名称: (S)-1-<2-(2-aminoethoxy)-3-(4,4'-dimethoxytrityloxy)propyl>thymine
• CAS: 168772-58-5
• 化学式: C₃₁H₃₅N₃O₆
• 分子量: 545.635
• InChiKey: MIYQSBOBVWOANA-NDEPHWFRSA-N

计算性质

• 辛醇/水分配系数(LogP)：
  3.21
• 重原子数：
  40.0
• 可旋转键数：
  13.0
• 环数：
  4.0
• sp3杂化的碳原子比例：
  0.29
• 拓扑面积：
  117.8
• 氢给体数：
  2.0
• 氢受体数：
  8.0

反应信息

• 作为反应物：
  描述：

  (S)-1-<2-(2-aminoethoxy)-3-(4,4'-dimethoxytrityloxy)propyl>thymine 在 二苯基磷酸 、 三乙胺 、 N,N-二异丙基乙胺 作用下， 以 二氯甲烷 、 N,N-二甲基甲酰胺 为溶剂， 反应 4.0h， 生成
  参考文献：
  名称：

  Synthesis of a Carboxamide Linked T∗T Dimer with an Acyclic Nucleoside Unit and Its Incorporation in Oligodeoxynucleotides

  摘要：

  A T*T dimer with * representing a 2'-OCH2CH2NHC(O)-4' linkage connecting two nucleoside units was prepared by condensation of (S)-1-[2-(2-aminoethoxy)-3-(4,4'-dimethoxytrityloxy)propyl]thymine with 1,2-dideoxy-1-thyminyl-beta-D-erythro-pentofuranuronic acid. The T*T dimer was incorporated in oligodeoxynucleotides and investigated for hybridization to DNA.

  DOI：

  10.1080/15257779508010713
• 作为产物：
  描述：

  胸腺嘧啶 在 4-二甲氨基吡啶 、 氢氧化钾 、 sodium hydride 、 溶剂黄146 作用下， 以 1,4-二氧六环 、 吡啶 、 苯 为溶剂， 反应 33.5h， 生成 (S)-1-<2-(2-aminoethoxy)-3-(4,4'-dimethoxytrityloxy)propyl>thymine
  参考文献：
  名称：

  Synthesis of a Carboxamide Linked T∗T Dimer with an Acyclic Nucleoside Unit and Its Incorporation in Oligodeoxynucleotides

  摘要：

  A T*T dimer with * representing a 2'-OCH2CH2NHC(O)-4' linkage connecting two nucleoside units was prepared by condensation of (S)-1-[2-(2-aminoethoxy)-3-(4,4'-dimethoxytrityloxy)propyl]thymine with 1,2-dideoxy-1-thyminyl-beta-D-erythro-pentofuranuronic acid. The T*T dimer was incorporated in oligodeoxynucleotides and investigated for hybridization to DNA.

  DOI：

  10.1080/15257779508010713

文献信息

• Evaluation of Oligonucleotides with Novel Modifications
  作者：Erik Larsen、Krzysztof Danel、Abdel-Aleem Abdel-Aleem、Poul Niclsen、Jesper Wengel、Erik Pedersen

  DOI：10.1080/15257779508012543

  日期：1995.5.1

  Oligodeoxynucleotides modified with carboxamide linked dimeric nucleotides and an acyclic nucleoside were prepared and investigated for their hybridization properties toward DNA.