N-(1-{(2R,3R,4R,5R)-5-[Bis-(4-methoxy-phenyl)-phenyl-methoxymethyl]-4-hydroxy-3-methoxy-tetrahydro-furan-2-yl}-5-methyl-2-oxo-1,2-dihydro-pyrimidin-4-yl)-benzamide | 741725-57-5

• 分子结构分类: 有机化合物 - 苯类化合物 - 三苯基化合物
• 英文名称: N-(1-{(2R,3R,4R,5R)-5-[Bis-(4-methoxy-phenyl)-phenyl-methoxymethyl]-4-hydroxy-3-methoxy-tetrahydro-furan-2-yl}-5-methyl-2-oxo-1,2-dihydro-pyrimidin-4-yl)-benzamide
• 英文别名: N-[1-[(2R,3R,4R,5R)-5-[[bis(4-methoxyphenyl)-phenylmethoxy]methyl]-4-hydroxy-3-methoxyoxolan-2-yl]-5-methyl-2-oxopyrimidin-4-yl]benzamide
• CAS: 741725-57-5
• 化学式: C₃₉H₃₉N₃O₈
• 分子量: 677.754
• InChiKey: BUUDDUQHVVDKLA-TUDCZORBSA-N

物化性质

• 密度：
  1.26±0.1 g/cm3(Predicted)

计算性质

• 辛醇/水分配系数(LogP)：
  4.7
• 重原子数：
  50
• 可旋转键数：
  12
• 环数：
  6.0
• sp3杂化的碳原子比例：
  0.26
• 拓扑面积：
  128
• 氢给体数：
  2
• 氢受体数：
  8

反应信息

• 作为反应物：
  描述：

  N-(1-{(2R,3R,4R,5R)-5-[Bis-(4-methoxy-phenyl)-phenyl-methoxymethyl]-4-hydroxy-3-methoxy-tetrahydro-furan-2-yl}-5-methyl-2-oxo-1,2-dihydro-pyrimidin-4-yl)-benzamide 在 4-二甲氨基吡啶 、 对甲苯磺酸 、 N,N'-二环己基碳二亚胺 作用下， 以 四氢呋喃 、 二氯甲烷 为溶剂， 反应 12.5h， 生成
  参考文献：
  名称：

  [EN] S-ANTIGEN TRANSPORT INHIBITING OLIGONUCLEOTIDE POLYMERS AND METHODS
  [FR] POLYMÈRES OLIGONUCLÉOTIDIQUES INHIBANT LE TRANSPORT DE L'ANTIGÈNE S ET MÉTHODES

  摘要：

  各种实施方式提供了STOPS™聚合物，这些聚合物是S-抗原转运抑制寡核苷酸聚合物，提供了制备它们的方法以及使用它们治疗疾病和症状的方法。在某些实施方式中，STOPS™修饰的寡核苷酸包括至少部分磷硫酸酯化的交替A和C单元序列，具有如本文所述的修饰。通过HBsAg分泌测定确定的STOPS™修饰的寡核苷酸对乙型肝炎的序列无关抗病毒活性，其EC50小于100 nM。

  公开号：

  WO2021119325A1
• 作为产物：
  描述：

  N-[1-[(6aR,8R,9R,9aR)-9-methoxy-2,2,4,4-tetra(propan-2-yl)-6a,8,9,9a-tetrahydro-6H-furo[3,2-f][1,3,5,2,4]trioxadisilocin-8-yl]-5-methyl-2-oxopyrimidin-4-yl]benzamide 在 吡啶 、 四丁基氟化铵 作用下， 以 四氢呋喃 为溶剂， 生成 N-(1-{(2R,3R,4R,5R)-5-[Bis-(4-methoxy-phenyl)-phenyl-methoxymethyl]-4-hydroxy-3-methoxy-tetrahydro-furan-2-yl}-5-methyl-2-oxo-1,2-dihydro-pyrimidin-4-yl)-benzamide
  参考文献：
  名称：

  Efficient synthesis of 2′-O-alkyl ribonucleosides using trichloroacetimidate d-ribofuranosides as ribosyl donors

  摘要：

  Trichloroacetimidate-2-O-alkyl-3, 5-O-TIPS-beta-D-ribofuranoside glycosylates silylated nucleobases in a fast high-yielding and stereoselective reaction promoted by trimethylsilyl trifluoromethanesulfonate. This method has been applied to the synthesis of 2'-O-alkyl ribonucleosides further transformed to building blocks ready for oligo(2'-O-alkyl)ribonucleotide construction.

  DOI：

  10.1016/s0040-4039(00)75987-9

文献信息

• Oligonucleotides comprising a modified or non-natural nucleobase
  申请人：Manoharan Muthiah

  公开号：US20060035254A1

  公开（公告）日：2006-02-16

  One aspect of the present invention relates to a double-stranded oligonucleotide comprising at least one non-natural nucleobase. In certain embodiments, the non-natural nucleobase is difluorotolyl, nitroindolyl, nitropyrrolyl, or nitroimidazolyl. In a preferred embodiment, the non-natural nucleobase is difluorotolyl. In certain embodiments, only one of the two oligonucleotide strands comprising the double-stranded oligonucleotide contains a non-natural nucleobase. In certain embodiments, both of the oligonucleotide strands comprising the double-stranded oligonucleotide independently contain a non-natural nucleobase. In certain embodiments, the oligonucleotide strands comprise at least one modified sugar moiety. Another aspect of the present invention relates to a single-stranded oligonucleotide comprising at least one non-natural nucleobase. In a preferred embodiment, the non-natural nucleobase is difluorotolyl. In certain embodiments, the ribose sugar moiety that occurs naturally in nucleosides is replaced with a hexose sugar, polycyclic heteroalkyl ring, or cyclohexenyl group. In certain embodiments, at least one phosphate linkage in the oligonucleotide has been replaced with a phosphorothioate linkage.

  本发明的一个方面涉及含有至少一个非自然碱基的双链寡核苷酸。在某些实施例中，非自然碱基可以是二氟基甲苯基、硝基吲哚基、硝基吡咯基或硝基咪唑基。在一个首选实施例中，非自然碱基是二氟基甲苯基。在某些实施例中，双链寡核苷酸中的两个寡核苷酸链中只有一个含有非自然碱基。在某些实施例中，双链寡核苷酸中的两个寡核苷酸链都独立地含有非自然碱基。在某些实施例中，寡核苷酸链包含至少一个修饰的糖基。本发明的另一个方面涉及含有至少一个非自然碱基的单链寡核苷酸。在一个首选实施例中，非自然碱基是二氟基甲苯基。在某些实施例中，取代了核苷中天然存在的核糖糖基的是己糖糖基、多环杂烷基环或环己烯基团。在某些实施例中，寡核苷酸中的至少一个磷酸酯键被磷酸硫酯键取代。
• WO2020097342A5
  申请人：——

  公开号：WO2020097342A5

  公开（公告）日：2022-11-11
• US7579451B2
  申请人：——

  公开号：US7579451B2

  公开（公告）日：2009-08-25
• US7772387B2
  申请人：——

  公开号：US7772387B2

  公开（公告）日：2010-08-10