1-[5-O-[二(4-甲氧基苯基)苯甲基]-2-脱氧-2-氟-beta-D-阿拉伯呋喃糖基]-2,4(1H,3H)-嘧啶二酮 | 144822-63-9

• 分子结构分类: 有机化合物 - 苯类化合物 - 三苯基化合物
• 中文名称: 1-[5-O-[二(4-甲氧基苯基)苯甲基]-2-脱氧-2-氟-beta-D-阿拉伯呋喃糖基]-2,4(1H,3H)-嘧啶二酮
• 英文名称: 1-((2R,3S,4R,5R)-5-((bis(4-methoxyphenyl)(phenyl)methoxy)methyl)-3-fluoro-4-hydroxytetrahydrofuran-2-yl)pyrimidine-2,4(1H,3H)-dione
• 英文别名: 1-[5-O-[Bis(4-methoxyphenyl)phenylmethyl]-2-deoxy-2-fluoro-beta-D-arabinofuranosyl]-2,4(1H,3H)-pyrimidinedione；1-[(2R,3S,4R,5R)-5-[[bis(4-methoxyphenyl)-phenylmethoxy]methyl]-3-fluoro-4-hydroxyoxolan-2-yl]pyrimidine-2,4-dione
• CAS: 144822-63-9
• 化学式: C₃₀H₂₉FN₂O₇
• 分子量: 548.568
• InChiKey: CSSFZSSZXOCCJB-KCPYNUOSSA-N

物化性质

• 密度：
  1.38

计算性质

• 辛醇/水分配系数(LogP)：
  3.6
• 重原子数：
  40
• 可旋转键数：
  9
• 环数：
  5.0
• sp3杂化的碳原子比例：
  0.27
• 拓扑面积：
  107
• 氢给体数：
  2
• 氢受体数：
  8

安全信息

• 储存条件：
  2-8℃

制备方法与用途

5'-O-DDMT-2'-脱氧-2'-氟-β-D-阿糖胞苷是一种尿苷类似物。尿苷本身具有潜在的抗癫痫作用，其类似物可用来研究抗惊厥和抗焦虑活性，并且可能用于开发新的抗高血压药物。

反应信息

• 作为反应物：
  描述：

  1-[5-O-[二(4-甲氧基苯基)苯甲基]-2-脱氧-2-氟-beta-D-阿拉伯呋喃糖基]-2,4(1H,3H)-嘧啶二酮 、 叔丁基二甲基氯硅烷 在 咪唑 作用下， 以 二氯甲烷 为溶剂， 反应 5.0h， 生成
  参考文献：
  名称：

  2'-脱氧-2'-氟-4'-C-乙炔基核苷类似物的合成和抗HIV活性

  摘要：

  基于 4'-取代核苷的良好抗病毒特性，新型 1-(2'-deoxy-2'-fluoro-4'- C - ethynyl -β- d - arabinofuranosyl)-uracil ( 1a ), -thymine ( 1b) ) 和 -胞嘧啶 ( 2 ) 类似物被合成。化合物1b和2表现出有效的抗 HIV-1 活性，IC 50值分别为 86 和 1.34 nM，没有显着的细胞毒性。化合物2对野生型病毒的效力是 AZT 的 35 倍，并且还保留了对耐药株、NL4-3 (K101E) 和 RTMDR 的纳摩尔级抗病毒活性。因此，2作为一种新型 NRTI 药物值得进一步开发。

  DOI：

  10.1016/j.bmcl.2010.05.090
• 作为产物：
  描述：

  1-(3,5-二-O-苯甲酰基-2-脱氧-2-氟-beta-D-阿拉伯呋喃糖基)-2,4(1H,3H)-嘧啶二酮 在 吡啶 、 甲醇 、 氨 作用下， 反应 29.0h， 生成 1-[5-O-[二(4-甲氧基苯基)苯甲基]-2-脱氧-2-氟-beta-D-阿拉伯呋喃糖基]-2,4(1H,3H)-嘧啶二酮
  参考文献：
  名称：

  嘧啶核苷类药物在制备预防或治疗冠状病毒感染性疾病药物中的用途

  摘要：

  本发明属药物化学领域，公开了一类嘧啶核苷类药物在制备预防或治疗冠状病毒药物中的用途。其具有式（I）所示的通式，所述式（I）化合物在体外试验中表现出显著的抑制冠状病毒复制的活性，而且在测试的剂量范围没有明显的细胞毒性。

  公开号：

  CN114288313A

文献信息

• Synthesis and anti-HCV activity of 3′,4′-oxetane nucleosides
  作者：Wonsuk Chang、Jinfa Du、Suguna Rachakonda、Bruce S. Ross、Serge Convers-Reignier、Wei T. Yau、Jean-Francois Pons、Eisuke Murakami、Haiying Bao、Holly Micolochick Steuer、Phillip A. Furman、Michael J. Otto、Michael J. Sofia

  DOI：10.1016/j.bmcl.2010.06.025

  日期：2010.8

  treat this disease. Our first generation nucleoside HCV inhibitor, RG7128 has already established proof-of-concept in the clinic and is currently in phase IIb clinical trials. As part of our continuing efforts to discover novel anti-HCV agents, 3′,4′-oxetane cytidine and adenosine nucleosides were prepared as inhibitors of HCV RNA replication. These nucleosides were shown not to be inhibitors of HCV

  丙型肝炎病毒折磨着全世界大约 1.8 亿人，目前没有可用于治疗这种疾病的直接作用的抗病毒药物。我们的第一代核苷 HCV 抑制剂 RG7128 已经在临床上建立了概念验证，目前处于 IIb 期临床试验中。作为我们不断努力发现新型抗 HCV 药物的一部分，我们制备了 3',4'-氧杂环丁烷胞苷和腺苷核苷作为 HCV RNA 复制的抑制剂。如在全细胞亚基因组复制子测定中所确定的，这些核苷显示不是HCV的抑制剂。然而，2'-单/二氟类似物4、5和6很容易被脱氧胞苷激酶磷酸化为它们的单磷酸盐代谢物，并且它们的三磷酸盐衍生物在体外被证明是 HCV NS5B 聚合酶的抑制剂。复制子测定中缺乏抗 HCV 活性可能是由于单磷酸盐不能转化为其相应的二磷酸盐。
• METHOD FOR LIQUID-PHASE SYNTHESIS OF NUCLEIC ACID
  申请人：Takeda Pharmaceutical Company Limited

  公开号：EP2921499A1

  公开（公告）日：2015-09-23

  In this method, an oligonucleotide is prepared by using, as a synthesis unit, a novel nucleoside monomer compound represented by formula (I) [wherein X, R1, Y, Base, Z, Ar, R2, R3 and n are each as defined in Claim 1]. The novel nucleoside monomer compound is a nucleoside, the base moiety of which is substituted with an aromatic-hydrocarbon-ring-carbonyl or -thiocarbonyl group having at least one hydrophobic group. The method can dispense with column-chromatographic purification in every reaction, and enables base elongation not only in the 3'-direction but also in the 5'-direction, thus attaining efficient liquid-phase mass synthesis of an oligonucleotide.

  在该方法中，通过使用由式(I)代表的新型核苷单体化合物作为合成单元来制备寡核苷酸[其中 X、R1、Y、碱基、Z、Ar、R2、R3 和 n 均如权利要求 1 中所定义]。新型核苷单体化合物是一种核苷，其碱基被具有至少一个疏水基团的芳香-烃环-羰基或-硫代羰基取代。该方法在每个反应中都无需柱色谱纯化，不仅可以在 3'- 方向进行碱基延伸，还可以在 5'- 方向进行碱基延伸，从而实现寡核苷酸的高效液相大规模合成。
• Method for liquid-phase synthesis of nucleic acid
  申请人：TAKEDA PHARMACEUTICAL COMPANY LIMITED

  公开号：US10730904B2

  公开（公告）日：2020-08-04

  In this method, an oligonucleotide represented by formula (II) [wherein Y1, Q, Base, r and r′ are each as defined in claim 1] is prepared by using, as a synthesis unit, a novel nucleoside monomer compound represented by formula (I) [wherein X, R1, Y, Base, Z, Ar, R2, R3 and n are each as defined in claim 1]. The novel nucleoside monomer compound is a nucleoside, the base moiety of which is substituted with an aromatic-hydrocarbon-ring-carbonyl or -thiocarbonyl group having at least one hydrophobic group. The method can dispense with column-chromatographic purification in every reaction, and enables base elongation not only in the 3′-direction but also in the 5′-direction, thus attaining efficient liquid-phase mass synthesis of an oligonucleotide.

  在该方法中，使用式(I)代表的新型核苷单体化合物[其中X、R1、Y、Base、Z、Ar、R2、R3和n各自如权利要求1中定义]作为合成单元，制备式(II)代表的寡核苷酸[其中Y1、Q、Base、r和r′各自如权利要求1中定义]。新型核苷单体化合物是一种核苷，其碱基被具有至少一个疏水基团的芳香-烃环-羰基或-硫代羰基取代。该方法在每个反应中都无需柱色谱纯化，不仅可以在 3′方向上进行碱基延伸，还可以在 5′方向上进行碱基延伸，从而实现寡核苷酸的高效液相大规模合成。
• METHOD FOR LIQUID-PHASE SYNTHESIS OF NUCLEIC ACIDS
  申请人：Takeda Pharmaceutical Company Limited

  公开号：EP2921499B1

  公开（公告）日：2020-01-22