dADP trianion | 914806-27-2

• 分子结构分类: 有机化合物 - 核苷、核苷酸和类似物 - 嘌呤核苷酸
• 英文名称: dADP trianion
• 英文别名: [[(2R,3S,5R)-5-(6-aminopurin-9-yl)-3-hydroxyoxolan-2-yl]methoxy-oxidophosphoryl] phosphate
• CAS: 914806-27-2
• 化学式: C10H12N5O9P2-3
• 分子量: 408.18
• InChiKey: DAEAPNUQQAICNR-RRKCRQDMSA-K

计算性质

• 辛醇/水分配系数(LogP)：
  -3.5
• 重原子数：
  26
• 可旋转键数：
  5
• 环数：
  3.0
• sp3杂化的碳原子比例：
  0.5
• 拓扑面积：
  221
• 氢给体数：
  2
• 氢受体数：
  13

反应信息

• 作为反应物：
  描述：

  adenosine 5'-triphosphate 、 dADP trianion 生成 adenosine 5'-diphosphate 、 dATP
  参考文献：
  名称：

  酿酒酵母核苷二磷酸激酶：纯化，鉴定和底物特异性。

  摘要：

  核苷二磷酸激酶是一种酶，可将核苷二磷酸磷酸化为相应的三磷酸以进行核酸生物合成。在本交流中，我们描述了酵母中核苷二磷酸激酶的纯化和表征。通过十二烷基硫酸钠-聚丙烯酰胺凝胶分析，纯化的蛋白质似乎是均质的，分子量约为17,000-18,000。快速蛋白质液相色谱Superose 12凝胶过滤的估算结果表明，其天然分子量约为68,000至70,000。结果表明，酵母核苷二磷酸激酶由四个亚基组成。底物特异性研究表明，核苷二磷酸酯（NDP）作为磷酸盐受体的相对活性为dTDP大于CDP大于UDP大于dUDP大于GDP大于或等于dGDP大于dCDP大于dADP大于ADP ; 三磷酸供体的相对活性的顺序为：UTP大于dTTP大于CTP大于dCTP大于dATP大于ATP大于或等于dGTP大于GTP。已确定dTDP，dGDP，dCDP，dUDP，CDP和UDP的Km和Vm。速率常数研究表明，纯化的NDP激酶在较小程度上更喜欢使用dTDP（约800

  DOI：

  10.1016/0003-9861(91)90129-7
• 作为产物：
  描述：

  adenosine 5'-triphosphate 、 2’-deoxyadenosine-5’-monophosphate 生成 adenosine 5'-diphosphate 、 dADP trianion
  参考文献：
  名称：

  人腺苷酸激酶9是核苷单磷酸和二磷酸激酶。

  摘要：

  腺苷酸激酶调节腺嘌呤核苷酸水平，并存在于不同的细胞内区室中。这些酶也参与药理活性核苷和核苷酸类似物的活化。我们在本研究中鉴定了酶的腺苷酸激酶家族的第九个同工型，因此将其命名为蛋白腺苷酸激酶9（AK9）。最初，鉴定了包含预测的腺苷酸激酶结构域的假设蛋白的全长cDNA，随后在大肠杆菌中克隆和表达。重组蛋白的底物特异性表明，该酶以ATP为磷酸盐供体，催化AMP，dAMP，CMP和dCMP的磷酸化，而当GTP为磷酸盐供体时，只有AMP和CMP被磷酸化。以ATP为磷酸盐供体，确定AMP，dAMP和CMP AK9的动力学参数。有趣的是，除了二磷酸酯产物之外，还存在核苷二磷酸激酶（NDPK）活性，随后形成了三磷酸酯。用ATP或GTP作为磷酸盐供体，可以检测到相应的二磷酸盐底物作为酶促产物的ATP，CTP，GTP，UTP，dATP，dCTP，dGTP和TTP的产生。还测试了许多先前表征的腺苷酸激酶，发现它

  DOI：

  10.1016/j.biocel.2013.02.004

文献信息

• Chemical and enzymatic characterization of recombinant rabbit muscle pyruvate kinase
  作者：Christian Boehme、Frank Bieber、Julia Linnemann、Reinhard Breitling、Stefan Lorkowski、Siegmund Reissmann

  DOI：10.1515/hsz-2012-0334

  日期：2013.5.1

  synthesis of TTP via an enzymatic cascade reaction. The metalloenzyme PK shows pronounced promiscuity and therefore fits well to the conditions of this reaction. PK commonly used today is isolated from rabbit muscle. We cloned and expressed the respective open reading frame in Escherichia coli, purified, and characterized the His-tagged recombinant enzyme. The enzyme has an activity optimum at 37°C and

  摘要 胸苷三磷酸 (TTP) 的逐步合成在最后一步需要激酶进行磷酸化。因为使用磷酸烯醇式丙酮酸 (PEP) 作为底物的丙酮酸激酶 (PK) 可以再生三磷酸腺苷和磷酸化胸苷二磷酸，我们选择这种酶通过酶促级联反应合成 TTP。金属酶 PK 表现出明显的混杂性，因此非常适合该反应的条件。今天常用的PK是从兔肌肉中分离出来的。我们在大肠杆菌中克隆并表达了各自的开放阅读框，纯化并表征了带有 His 标签的重组酶。该酶在 37°C 和 7.4 至 7.8 的 pH 范围内具有最佳活性。Km 常数与分离的二磷酸腺苷 (ADP) 天然酶一致，为 0.37±0。02 毫米，PEP 为 0.07±0.01 毫米。重组酶在其底物特异性方面表现出以下范围：ADP>dADP>dGDP>dCDP>胸苷二磷酸(TDP)。它允许以高产率（高达 95%）将 TDP 磷酸化为 TTP。金属离子 Mg2+ 和 K+ 是完全酶活性所必需的。添加过渡金属离子如
• Gene <i>ytkD</i> of <i>Bacillus subtilis</i> Encodes an Atypical Nucleoside Triphosphatase Member of the Nudix Hydrolase Superfamily
  作者：WenLian Xu、Candice R. Jones、Christopher A. Dunn、Maurice J. Bessman

  DOI：10.1128/jb.186.24.8380-8384.2004

  日期：2004.12.15

  Gene ytkD of Bacillus subtilis , a member of the Nudix hydrolase superfamily, has been cloned and expressed in Escherichia coli . The purified protein has been characterized as a nucleoside triphosphatase active on all of the canonical ribo- and deoxyribonucleoside triphosphates. Whereas all other nucleoside triphosphatase members of the superfamily release inorganic pyrophosphate and the cognate nucleoside monophosphate, YtkD hydrolyses nucleoside triphosphates in a stepwise fashion through the diphosphate to the monophosphate, releasing two molecules of inorganic orthophosphate. Contrary to a previous report, our enzymological and genetic studies indicate that ytkD is not an orthologue of E. coli mutT .

  摘要 基因 ytkD 的 基因 ytkD 是 Nudix水解酶超家族的成员，已被克隆并在 大肠杆菌 .纯化后的蛋白质被鉴定为一种核苷三磷酸酶，对所有典型的核糖核苷和脱氧核糖核苷三磷酸酶都有活性。该超家族的所有其他核苷三磷酸酶成员都会释放出无机焦磷酸和同源的核苷单磷酸，而 YtkD 则以逐步的方式从二磷酸水解到单磷酸，释放出两分子无机正磷酸盐。与之前的报告相反，我们的酶学和遗传学研究表明 ytkD 不是 大肠杆菌 mutT .
• A widespread pathway for substitution of adenine by diaminopurine in phage genomes
  作者：Yan Zhou、Xuexia Xu、Yifeng Wei、Yu Cheng、Yu Guo、Ivan Khudyakov、Fuli Liu、Ping He、Zhangyue Song、Zhi Li、Yan Gao、Ee Lui Ang、Huimin Zhao、Yan Zhang、Suwen Zhao

  DOI：10.1126/science.abe4882

  日期：2021.4.30

  DNA modifications vary in form and function but generally do not alter Watson-Crick base pairing. Diaminopurine (Z) is an exception because it completely replaces adenine and forms three hydrogen bonds with thymine in cyanophage S-2L genomic DNA. However, the biosynthesis, prevalence, and importance of Z genomes remain unexplored. Here, we report a multienzyme system that supports Z-genome synthesis

  DNA修饰的形式和功能各不相同，但通常不会改变Watson-Crick碱基配对。二氨基嘌呤（Z）是一个例外，因为它可以完全取代腺嘌呤，并在蓝藻S-2L基因组DNA中与胸腺嘧啶形成三个氢键。但是，Z基因组的生物合成，普遍性和重要性仍待探索。在这里，我们报告了一种支持Z基因组合成的多酶系统。我们鉴定了数十种带有这种酶的全球噬菌体，并进一步验证了其中一种噬菌体不动杆菌的Z基因组噬菌体SH-Ab 15497，通过使用具有紫外和质谱的液相色谱法。Z基因组赋予噬菌体逃避宿主限制性内切酶攻击的进化优势，其生物合成途径的表征使Z-DNA大规模生产，可用于多种应用。
• Enzymic synthesis of guanosine and cytidine triphosphates: A note on the nucleotide specificity of the pyruvate phosphokinase reaction
  作者：Jack L. Strominger

  DOI：10.1016/0006-3002(55)90302-4

  日期：1955.1
• KORNBERG A.; PRICER W.E. Jr., J Biol Chem, 1951, 0021-9258, 481-95
  作者：KORNBERG A.、PRICER W.E. Jr.

  DOI：——

  日期：——