(S)-3-((tert-butoxycarbonyl)amino)-3-(2-fluorophenyl)propanoic acid

• 分子结构分类: 有机化合物 - 苯丙烷和聚酮 - 苯丙酸
• 英文名称: (S)-3-((tert-butoxycarbonyl)amino)-3-(2-fluorophenyl)propanoic acid
• 英文别名: (3S)-3-(2-fluorophenyl)-3-[(2-methylpropan-2-yl)oxycarbonylamino]propanoic acid
• 化学式: C₁₄H₁₈FNO₄
• 分子量: 283.3
• InChiKey: RJWRQSGZCKYLML-NSHDSACASA-N

计算性质

• 辛醇/水分配系数(LogP)：
  2.1
• 重原子数：
  20
• 可旋转键数：
  6
• 环数：
  1.0
• sp3杂化的碳原子比例：
  0.43
• 拓扑面积：
  75.6
• 氢给体数：
  2
• 氢受体数：
  5

反应信息

• 作为反应物：
  描述：

  (S)-3-((tert-butoxycarbonyl)amino)-3-(2-fluorophenyl)propanoic acid 在 盐酸 、 氯化铵 、 盐酸-N-乙基-Nˊ-(3-二甲氨基丙基)碳二亚胺 、 N,N-二异丙基乙胺 作用下， 以 1,4-二氧六环 、 二氯甲烷 为溶剂， 反应 18.0h， 生成 (S)-3-amino-3-(2-fluorophenyl)propanamide hydrochloride
  参考文献：
  名称：

  纳摩尔 DCAF1 小分子配体的发现

  摘要：

  DCAF1 是两种不同 E3 连接酶（CRL4 DCAF1和 EDVP）的底物受体，在蛋白质降解中发挥着关键的生理作用，被认为是多种癌症的药物靶点。 DCAF1 拮抗剂可用于开发癌症和病毒治疗疗法。我们使用 DCAF1 的 WDR 结构域筛选包含 1140 亿个化合物的 DNA 编码库 (DEL)，并使用相似性搜索和机器学习识别候选化合物。由此发现了一种 SPR KD为11 μM 的化合物 (Z1391232269)。结构引导的命中优化导致 OICR-8268 ( 26e ) 的发现，通过细胞热位移测定 (CETSA) 测量，其 SPR K D为 38 nM，细胞靶标结合 EC 50为 10 μM。 OICR-8268 是一种出色的工具化合物，可用于开发用于癌症治疗的下一代 DCAF1 配体、进一步研究 DCAF1 在细胞中的功能以及开发基于 DCAF1 的 PROTAC。

  DOI：

  10.1021/acs.jmedchem.2c02132
• 作为产物：
  描述：

  二碳酸二叔丁酯 、 (S)-3-氨基-3-(2-氟苯基)-丙酸 在 N,N-二异丙基乙胺 作用下， 以 二氯甲烷 为溶剂， 以67 %的产率得到(S)-3-((tert-butoxycarbonyl)amino)-3-(2-fluorophenyl)propanoic acid
  参考文献：
  名称：

  纳摩尔 DCAF1 小分子配体的发现

  摘要：

  DCAF1 是两种不同 E3 连接酶（CRL4 DCAF1和 EDVP）的底物受体，在蛋白质降解中发挥着关键的生理作用，被认为是多种癌症的药物靶点。 DCAF1 拮抗剂可用于开发癌症和病毒治疗疗法。我们使用 DCAF1 的 WDR 结构域筛选包含 1140 亿个化合物的 DNA 编码库 (DEL)，并使用相似性搜索和机器学习识别候选化合物。由此发现了一种 SPR KD为11 μM 的化合物 (Z1391232269)。结构引导的命中优化导致 OICR-8268 ( 26e ) 的发现，通过细胞热位移测定 (CETSA) 测量，其 SPR K D为 38 nM，细胞靶标结合 EC 50为 10 μM。 OICR-8268 是一种出色的工具化合物，可用于开发用于癌症治疗的下一代 DCAF1 配体、进一步研究 DCAF1 在细胞中的功能以及开发基于 DCAF1 的 PROTAC。

  DOI：

  10.1021/acs.jmedchem.2c02132

文献信息

• Discovery of Nanomolar DCAF1 Small Molecule Ligands
  作者：Alice Shi Ming Li、Serah Kimani、Brian Wilson、Mahmoud Noureldin、Héctor González-Álvarez、Ahmed Mamai、Laurent Hoffer、John P. Guilinger、Ying Zhang、Moritz von Rechenberg、Jeremy S. Disch、Christopher J. Mulhern、Belinda L. Slakman、John W. Cuozzo、Aiping Dong、Gennady Poda、Mohammed Mohammed、Punit Saraon、Manish Mittal、Pratik Modh、Vaibhavi Rathod、Bhashant Patel、Suzanne Ackloo、Vijayaratnam Santhakumar、Magdalena M Szewczyk、Dalia Barsyte-Lovejoy、Cheryl H. Arrowsmith、Richard Marcellus、Marie-Aude Guié、Anthony D. Keefe、Peter J. Brown、Levon Halabelian、Rima Al-awar、Masoud Vedadi

  DOI：10.1021/acs.jmedchem.2c02132

  日期：——

  learning. This led to the discovery of a compound (Z1391232269) with an SPR KD of 11 μM. Structure-guided hit optimization led to the discovery of OICR-8268 (26e) with an SPR KD of 38 nM and cellular target engagement with EC50 of 10 μM as measured by cellular thermal shift assay (CETSA). OICR-8268 is an excellent tool compound to enable the development of next-generation DCAF1 ligands toward cancer therapeutics

  DCAF1 是两种不同 E3 连接酶（CRL4 DCAF1和 EDVP）的底物受体，在蛋白质降解中发挥着关键的生理作用，被认为是多种癌症的药物靶点。 DCAF1 拮抗剂可用于开发癌症和病毒治疗疗法。我们使用 DCAF1 的 WDR 结构域筛选包含 1140 亿个化合物的 DNA 编码库 (DEL)，并使用相似性搜索和机器学习识别候选化合物。由此发现了一种 SPR KD为11 μM 的化合物 (Z1391232269)。结构引导的命中优化导致 OICR-8268 ( 26e ) 的发现，通过细胞热位移测定 (CETSA) 测量，其 SPR K D为 38 nM，细胞靶标结合 EC 50为 10 μM。 OICR-8268 是一种出色的工具化合物，可用于开发用于癌症治疗的下一代 DCAF1 配体、进一步研究 DCAF1 在细胞中的功能以及开发基于 DCAF1 的 PROTAC。