adenosine 5′-indole-3-propionic adenylate

• 分子结构分类: 有机化合物 - 核苷、核苷酸和类似物 - 嘌呤核苷酸
• 英文名称: adenosine 5′-indole-3-propionic adenylate
• 英文别名: AIPA；[[(2R,3S,4R,5R)-5-(6-aminopurin-9-yl)-3,4-dihydroxyoxolan-2-yl]methoxy-hydroxyphosphoryl] 3-(1H-indol-3-yl)propanoate
• 化学式: C₂₁H₂₃N₆O₈P
• 分子量: 518.423
• InChiKey: MQGWYMCEYWHMAE-HAXDFEGKSA-N

计算性质

• 辛醇/水分配系数(LogP)：
  -0.9
• 重原子数：
  36
• 可旋转键数：
  9
• 环数：
  5.0
• sp3杂化的碳原子比例：
  0.33
• 拓扑面积：
  208
• 氢给体数：
  5
• 氢受体数：
  12

反应信息

• 作为反应物：
  描述：

  adenosine 5′-indole-3-propionic adenylate 以 aq. phosphate buffer 为溶剂， 生成 3-吲哚丙酸 、 5'-腺嘌呤核苷酸
  参考文献：
  名称：

  人组氨酸三联体核苷酸结合蛋白 1 的动力学机制

  摘要：

  人组氨酸三联体核苷酸结合蛋白 1 (hHint1) 是组氨酸三联体蛋白超家族普遍存在的古老分支的成员。hHint1 是一种同源二聚体蛋白，可高效催化模型底物、氨基磷酸酯和酰基腺苷酸的水解。最近，催化失活的 hHint1 已被确定为遗传性周围神经病变的原因 [Zimon, M., et al. (2012) 国家。基因。44, 1080–1083]。我们对 hHint1 进行了第一次详细的动力学机理研究，发现反应机制与双置换机制一致，其中活性位点亲核试剂 His112 首先被底物腺苷酸化，然后水解 AMP-酶中间体. 来自停流荧光测定的瞬时爆发阶段和线性阶段表明酶腺苷酸化比随后的中间水解和产物释放更快。溶剂粘度实验表明，化学转化和扩散敏感事件（产品释放或蛋白质构象变化）都会限制整体周转。催化捕获实验和数据模拟表明，真正的k off最终产品AMP率不太可能控制整体k猫。因此，与产品释放相关的蛋白质构象变化可能是限速的。此外，发现

  DOI：

  10.1021/bi301616c

文献信息

• Kinetic Mechanism of Human Histidine Triad Nucleotide Binding Protein 1
  作者：Xin Zhou、Tsui-Fen Chou、Brandon E. Aubol、Chin Ju Park、Richard Wolfenden、Joseph Adams、Carston R. Wagner

  DOI：10.1021/bi301616c

  日期：2013.5.21

  for the pKa of the active site nucleophile His112. In comparison to the uncatalyzed rates, hHint1 was shown to enhance acyl-AMP and AMP phosphoramidate hydrolysis by 106–108-fold. Taken together, our analysis indicates that hHint1 catalyzes the hydrolysis of phosphoramidate and acyl adenylate with high efficiency, through a mechanism that relies on rapid adenylylation of the active residue, His112, while

  人组氨酸三联体核苷酸结合蛋白 1 (hHint1) 是组氨酸三联体蛋白超家族普遍存在的古老分支的成员。hHint1 是一种同源二聚体蛋白，可高效催化模型底物、氨基磷酸酯和酰基腺苷酸的水解。最近，催化失活的 hHint1 已被确定为遗传性周围神经病变的原因 [Zimon, M., et al. (2012) 国家。基因。44, 1080–1083]。我们对 hHint1 进行了第一次详细的动力学机理研究，发现反应机制与双置换机制一致，其中活性位点亲核试剂 His112 首先被底物腺苷酸化，然后水解 AMP-酶中间体. 来自停流荧光测定的瞬时爆发阶段和线性阶段表明酶腺苷酸化比随后的中间水解和产物释放更快。溶剂粘度实验表明，化学转化和扩散敏感事件（产品释放或蛋白质构象变化）都会限制整体周转。催化捕获实验和数据模拟表明，真正的k off最终产品AMP率不太可能控制整体k猫。因此，与产品释放相关的蛋白质构象变化可能是限速的。此外，发现