cyclophellitol aziridine

• 分子结构分类: 有机化合物 - 有机杂环化合物 - 氮杂环庚烷
• 英文名称: cyclophellitol aziridine
• 英文别名: Cyclophellitol aziridine；(1R,2S,3S,4R,5R,6R)-5-(hydroxymethyl)-7-azabicyclo[4.1.0]heptane-2,3,4-triol
• 化学式: C₇H₁₃NO₄
• 分子量: 175.185
• InChiKey: GPIFFOGPRPKRHS-DRYVTRLFSA-N

计算性质

• 辛醇/水分配系数(LogP)：
  -2.3
• 重原子数：
  12
• 可旋转键数：
  1
• 环数：
  2.0
• sp3杂化的碳原子比例：
  1.0
• 拓扑面积：
  103
• 氢给体数：
  5
• 氢受体数：
  5

反应信息

• 作为反应物：
  描述：

  cyclophellitol aziridine 在 copper(II) sulfate 、 sodium ascorbate 作用下， 以 水 、 N,N-二甲基甲酰胺 为溶剂， 反应 19.25h， 生成
  参考文献：
  名称：

  新颖的基于活动的探针，用于在原位和体内保留β-外切葡糖苷酶的广谱分析

  摘要：

  高端标签：环糊精氮丙啶类基于活性的探针可对哺乳动物β-葡萄糖苷酶（GBA1，GBA2，GBA3和LPH）以及几种非哺乳动物的β-葡萄糖苷酶（见图）进行超灵敏的可视化。这些探针提供了研究β-外切葡糖苷酶的新方法，并且环磷脂醇氮丙啶核的构型异构体可能会提供针对其他保留糖苷酶家族的基于活性的探针。

  DOI：

  10.1002/anie.201207771
• 作为产物：
  描述：

  (1R,2R,3R,4S,5S,6R)-4,5-bis(benzyloxy)-2-(hydroxymethyl)-7-azabicyclo[4.1.0]heptan-3-ol 在 氨 、 lithium 作用下， 以 四氢呋喃 、 水 为溶剂， 反应 0.5h， 生成 cyclophellitol aziridine
  参考文献：
  名称：

  新颖的基于活动的探针，用于在原位和体内保留β-外切葡糖苷酶的广谱分析

  摘要：

  高端标签：环糊精氮丙啶类基于活性的探针可对哺乳动物β-葡萄糖苷酶（GBA1，GBA2，GBA3和LPH）以及几种非哺乳动物的β-葡萄糖苷酶（见图）进行超灵敏的可视化。这些探针提供了研究β-外切葡糖苷酶的新方法，并且环磷脂醇氮丙啶核的构型异构体可能会提供针对其他保留糖苷酶家族的基于活性的探针。

  DOI：

  10.1002/anie.201207771

文献信息

• Hydrophobic Interactions Contribute to Conformational Stabilization of Endoglycoceramidase II by Mechanism-Based Probes
  作者：Fredj Ben Bdira、Jianbing Jiang、Wouter Kallemeijn、Annett de Haan、Bogdan I. Florea、Boris Bleijlevens、Rolf Boot、Herman S. Overkleeft、Johannes M. Aerts、Marcellus Ubbink

  DOI：10.1021/acs.biochem.6b00363

  日期：2016.8.30

  in Gaucher disease. We demonstrate that established β-glucoside-configured cyclophellitol-type activity-based probes (ABPs) for GBA also are effective, mechanism-based, and irreversible inhibitors of EGCII. The stability of EGCII is markedly enhanced by formation of covalent complexes with cyclophellitol ABPs substituted with hydrophobic moieties, as evidenced by an increased melting temperature, resistance

  小型化合物活性位点相互作用子因其积极影响糖苷酶折叠的能力而备受关注。红球菌的糖苷内切酶II（EGCII）sp。是内切-β-葡糖苷酶，其从鞘糖脂中的神经酰胺中释放出完整的聚糖。葡萄糖和神经酰胺之间的β-糖苷键的裂解也被葡萄糖脑苷脂酶（GBA）催化，GBA是一种缺席于高雪氏病的外-β-葡萄糖苷酶。我们证明为GBA建立的β-葡萄糖苷配置的环磷脂醇型基于活性的探针（ABP）也是有效，基于机理和不可逆的EGCII抑制剂。熔融温度升高，抗胰蛋白酶消化，15 N– 1 H横向弛豫优化[ 15]N] Leu标记的酶，以及通过8-苯胺基-1-萘磺酸荧光测定的相对疏水性。EGCII构象的稳定与ABP取代基的形状和疏水性有关。我们得出的结论是，具有脂肪族部分的两亲性活性位点粘合剂在柔性EGCII蛋白结构上充当“疏水性拉链”。
• Exploring functional cyclophellitol analogues as human retaining beta-glucosidase inhibitors
  作者：Kah-Yee Li、Jianbing Jiang、Martin D. Witte、Wouter W. Kallemeijn、Wilma E. Donker-Koopman、Rolf G. Boot、Johannes M. F. G. Aerts、Jeroen D. C. Codée、Gijsbert A. van der Marel、Herman S. Overkleeft

  DOI：10.1039/c4ob01611d

  日期：——

  The natural product, cyclophellitol and its aziridine analogue are potent mechanism-based retaining β-glucosidase inhibitors. In this paper we explore the inhibitory potency of a number of cyclophellitol analogues against the three human retaining β-glucosidases, GBA, GBA2 and GBA3. We demonstrate that N-alkyl cyclophellitol aziridine is at least equally potent in inhibiting the enzymes evaluated as

  天然产物环丙醇及其氮丙啶类似物是有效的基于机理的保留β-葡萄糖苷酶抑制剂。在本文中，我们探索了许多环糖醇类似物对三种人类保留的β-葡萄糖苷酶GBA，GBA2和GBA3的抑制作用。我们证明，N-烷基环磷脂醇氮丙啶至少在抑制被评估为其N-酰基同类物的酶方面具有同等效力，而N-磺酰基类似物则是相当弱的抑制剂。我们的研究结果补充了有关环糖醇类似物抑制能力的文献，并为将来在生理介质中稳定探针设计出更有效的基于活性的糖苷酶探针提供了希望。
• A Fluorescence Polarization Activity-Based Protein Profiling Assay in the Discovery of Potent, Selective Inhibitors for Human Nonlysosomal Glucosylceramidase
  作者：Daniël Lahav、Bing Liu、Richard J. B. H. N. van den Berg、Adrianus M. C. H. van den Nieuwendijk、Tom Wennekes、Amar T. Ghisaidoobe、Imogen Breen、Maria J. Ferraz、Chi-Lin Kuo、Liang Wu、Paul P. Geurink、Huib Ovaa、Gijsbert A. van der Marel、Mario van der Stelt、Rolf G. Boot、Gideon J. Davies、Johannes M. F. G. Aerts、Herman S. Overkleeft

  DOI：10.1021/jacs.7b07352

  日期：2017.10.11

  assessed on GBA2 selectivity offset against the other glucosylceramide metabolizing enzymes, glucosylceramide synthase (GCS), lysosomal glucosylceramidase (GBA), and the cytosolic retaining β-glucosidase, GBA3. Our work, yielding potent and selective GBA2 inhibitors, also provides a roadmap for the development of high-throughput assays for identifying retaining glycosidase inhibitors by FluoPol-ABPP

  人非溶酶体葡萄糖基神经酰胺酶（GBA2）是控制糖脂水平的几种酶之一，其活性与几种人类疾病状态相关。迫切需要设计或发现选择性的GBA2抑制剂作为化学工具和潜在的治疗剂。在这里，我们描述了基于荧光偏振活性的蛋白质谱分析（FluoPol-ABPP）测定法的发展，该测定法可从350多种亚氨基糖文库中快速鉴定GBA2抑制剂。基于FluoPol-ABPP筛选的线索生成聚焦库，并针对与其他葡糖神经酰胺代谢酶，葡糖神经酰胺合酶（GCS），溶酶体葡糖神经酰胺酶（GBA）和胞质保留β-葡糖苷酶GBA3的GBA2选择性偏移进行评估。我们的工作产生了有效的和选择性的GBA2抑制剂，
• ACTIVITY BASED PROBES (ABPs) INTERACTING WITH GLYCOSIDASES
  申请人：Aerts Johannes Maria Franciscus Gerardus

  公开号：US20130143228A1

  公开（公告）日：2013-06-06

  An activity based probe (ABP) comprising a glycosidase inhibitor, and a detection-group. The ABPs of the inventions are used for diagnosing storage disorder for screening of compounds suitable for preventing and/or treating a storage disorder, for monitoring of therapeutic enzymes for lysosomal storage disorders, and for ultra-sensitive visualization of glycosidase-fusion proteins in molecular imaging.

  一种基于活性的探针（ABP），包含一个糖苷酶抑制剂和一个检测基团。这些发明的ABP用于诊断储存障碍，筛选适合预防和/或治疗储存障碍的化合物，监测溶酶体储存疾病的治疗酶，以及在分子成像中对糖苷酶融合蛋白进行超灵敏可视化。
• Synthesis of Cyclophellitol, Cyclophellitol Aziridine, and Their Tagged Derivatives
  作者：Kah-Yee Li、Jianbing Jiang、Martin D. Witte、Wouter W. Kallemeijn、Hans van den Elst、Chung-Sing Wong、Sharina D. Chander、Sascha Hoogendoorn、Thomas J. M. Beenakker、Jeroen D. C. Codée、Johannes M. F. G. Aerts、Gijs A. van der Marel、Herman S. Overkleeft

  DOI：10.1002/ejoc.201402588

  日期：2014.9

  epoxides and aziridines are potent and selective irreversible inhibitors of retaining glycosidases. We have previously reported on our studies on the use of activity-based probes derived from cyclophellitol and from its aziridine analogue for activity-based profiling of retaining -glucosidases in vitro, in situ, and in some examples also in vivo. In this work we disclose full details of the synthesis, purification

  环醇环氧化物和氮丙啶是保留糖苷酶的有效且选择性的不可逆抑制剂。我们之前已经报道了我们关于使用衍生自环酚醇及其氮丙啶类似物的基于活性的探针在体外、原位以及在一些例子中也在体内对保留葡糖苷酶进行基于活性的分析的研究。在这项工作中，我们公开了合成、纯化和分析全面的环酚醇类似物的全部细节，所有类似物都具有 - 葡萄糖构型，并被设计为选择性抑制和/或人类酸性葡萄糖神经酰胺酶（环氧化物）成像的工具或广泛的- 用于保留 - 葡萄糖苷酶（氮丙啶）的光谱探针。