4-(cyclopentylamino)-6-(morpholin-4-yl)-1,3,5-triazine-2-carbonitrile

• 分子结构分类: 有机化合物 - 有机杂环化合物 - 三嗪类
• 英文名称: 4-(cyclopentylamino)-6-(morpholin-4-yl)-1,3,5-triazine-2-carbonitrile
• 英文别名: 4-(cyclopentylamino)-6-(4-morpholinyl)-1,3,5-triazine-2-carbonitrile；4-(Cyclopentylamino)-6-morpholin-4-yl-1,3,5-triazine-2-carbonitrile
• 化学式: C₁₃H₁₈N₆O
• 分子量: 274.326
• InChiKey: UILULYCVLAQUNY-UHFFFAOYSA-N

计算性质

• 辛醇/水分配系数(LogP)：
  1.7
• 重原子数：
  20
• 可旋转键数：
  3
• 环数：
  3.0
• sp3杂化的碳原子比例：
  0.69
• 拓扑面积：
  87
• 氢给体数：
  1
• 氢受体数：
  7

反应信息

• 作为反应物：
  描述：

  8-溴甲基喹啉 、 4-(cyclopentylamino)-6-(morpholin-4-yl)-1,3,5-triazine-2-carbonitrile 在 sodium hydride 作用下， 以 N,N-二甲基甲酰胺 为溶剂， 以26%的产率得到4-{cyclopentyl(quinolin-8-yl)methylamino}-6-(morpholin-4-yl)-1,3,5-triazine-2-carbonitrile
  参考文献：
  名称：

  三嗪腈对半胱氨酸蛋白酶人类组织蛋白酶L的抑制作用：酰胺S3口袋中的酰胺····杂芳烃π-堆积相互作用和硫属元素键合。

  摘要：

  我们报道了半胱氨酸蛋白酶人组织蛋白酶L（hCatL）的三嗪腈配体的广泛的“杂芳烃扫描”，以研究S3口袋入口处的肽酰胺键Gly67–Gly68上的π堆积。杂芳基·····肽键的堆叠由咪唑并吡啶配体与hCatL的共晶体结构支持。抑制常数（ķ我）受到杂环的多样性和与S3口袋局部环境的特定相互作用的强烈影响。结合亲和力变化三个数量级。与烃类似物相比，所有杂芳族配体均具有增强的结合力。从杂芳烃和肽键的局部偶极矩的方向预测的能量贡献无法得到证实。分子间的C-S⋅⋅⋅O= C相互作用（硫族元素键）与Asn66的主链C = O增强了苯并噻吩基（K i = 4 n m）和苯并噻唑基（K i = 17 n m）配体的结合。 S3口袋。还测试了配体的相关酶罗德沙星。

  DOI：

  10.1002/cmdc.201600563
• 作为产物：
  描述：

  环戊胺 在 三乙烯二胺 、 N,N-二异丙基乙胺 作用下， 以 二氯甲烷 、 水 、 二甲基亚砜 为溶剂， 反应 19.0h， 生成 4-(cyclopentylamino)-6-(morpholin-4-yl)-1,3,5-triazine-2-carbonitrile
  参考文献：
  名称：

  半胱氨酸蛋白酶人类组织蛋白酶L抑制剂的氟扫描：氟化酰胺环在肽酰胺键上的π堆积中的偶极和四极效应。

  摘要：

  使用包括酶-配体结合研究和高级量子化学计算在内的双重方法，研究了蛋白质主链酰胺基上的氟化苯环的π-堆积。在实验研究中，系统组织地氟化了人类组织蛋白酶L（hCatL）的三嗪腈抑制剂的苯基取代基，该苯基堆叠在S3口袋入口处的肽酰胺键Gly67-Gly68上，并测定了抑制力的差异。荧光测定。亲和力受亲脂性的影响（c log  P），氟化环的偶极矩和四极矩，而且还可以通过引入的氟原子与腔的局部环境的其他相互作用来实现。通常，氟化度越高，结合亲和力越好。气相计算强有力地支持了氟化苯环的分子四极矩对与肽键的π堆积相互作用的贡献。这些发现为增强蛋白酰胺片段上的π堆积提供了有用的指导。

  DOI：

  10.1002/cmdc.201600132

文献信息

• [EN] 2-CYANO-1,3,5-TRIAZINE-4,6-DIAMINE DERIVATIVES<br/>[FR] DERIVES 2-CYANO-1,3,5-TRIAZINE-4,6-DIAMINES
  申请人：AKZO NOBEL NV

  公开号：WO2005011703A1

  公开（公告）日：2005-02-10

  The invention relates to the use of a 2-cyano-1,3,5-triazine -4,6-diamine derivative having general formula (I), wherein R1 is (C1-6)alkyl, (C3-8)cycloalkyl, aryl, aryl(C1-4)alkyl, aryloxy(C1-4)alkyl, heteroaryl or heteroaryloxy(C1-4)alkyl; R2 is H or (C1-4)alkyl; or R1 and R2 together with the nitrogen to which they are bound form a 4-8 membered heterocyclic ring, optionally further comprising 1 or more heteroatoms selected from O, S or NR5, which ring may be substituted with (C1-4)alkyl, (C3-8)cycloalkyl, aryl, aryl(C1-4)alkyl or NR6R7,and which ring may be fused to a benzene ring; R3 is (C1-6)alkyl, (C3-8) cycloalkyl (optionally comprising 1 or more heteroatoms selected from O, S or NR8), aryl, aryl(C1-4)alkyl or heteroaryl; R4 is H or (C1-4)alkyl; or R3 and R4 together with the nitrogen to which they are bound form a 4-8 membered heterocyclic ring, optionally further comprising 1 or more heteroatoms selected from O, S or NR9; R5, R8 and R9 are independently H, (C1-4)alkyl, (C3-8) cycloalkyl, aryl or aryl(C1-4)alkyl; R6 and R7 are independently H or (C1-4)alkyl; or R6 and R7 form together with the nitrogen to which they are bound a 4-8 membered heterocyclic ring; or a pharmaceutically acceptable salt thereof, for the preparation of a medicament for the treatment of osteoporosis and atherosclerosis.

  该发明涉及使用具有通式（I）的2-氰基-1,3,5-三嗪-4,6-二胺衍生物，其中R1为（C1-6）烷基，（C3-8）环烷基，芳基，芳基（C1-4）烷基，芳氧基（C1-4）烷基，杂芳基或杂芳氧基（C1-4）烷基；R2为H或（C1-4）烷基；或R1和R2与它们结合的氮一起形成一个4-8元杂环，可进一步包括1个或多个来自O、S或NR5的杂原子，该环可能被（C1-4）烷基，（C3-8）环烷基，芳基，芳基（C1-4）烷基或NR6R7取代，并且该环可能与苯环融合；R3为（C1-6）烷基，（C3-8）环烷基（可包括来自O、S或NR8的1个或多个杂原子），芳基，芳基（C1-4）烷基或杂芳基；R4为H或（C1-4）烷基；或R3和R4与它们结合的氮一起形成一个4-8元杂环，可进一步包括1个或多个来自O、S或NR9的杂原子；R5、R8和R9独立地为H，（C1-4）烷基，（C3-8）环烷基，芳基或芳基（C1-4）烷基；R6和R7独立地为H或（C1-4）烷基；或R6和R7与它们结合的氮一起形成一个4-8元杂环；或其药学上可接受的盐，用于制备治疗骨质疏松症和动脉粥样硬化的药物。
• Inhibition of the Cysteine Protease Human Cathepsin L by Triazine Nitriles: Amide⋅⋅⋅Heteroarene π-Stacking Interactions and Chalcogen Bonding in the S3 Pocket
  作者：Maude Giroud、Jakov Ivkovic、Mara Martignoni、Marianne Fleuti、Nils Trapp、Wolfgang Haap、Andreas Kuglstatter、Jörg Benz、Bernd Kuhn、Tanja Schirmeister、François Diederich

  DOI：10.1002/cmdc.201600563

  日期：2017.2.3

  We report an extensive “heteroarene scan” of triazine nitrile ligands of the cysteine protease human cathepsin L (hCatL) to investigate π‐stacking on the peptide amide bond Gly67–Gly68 at the entrance of the S3 pocket. This heteroarene⋅⋅⋅peptide bond stacking was supported by a co‐crystal structure of an imidazopyridine ligand with hCatL. Inhibitory constants (Ki) are strongly influenced by the diverse

  我们报道了半胱氨酸蛋白酶人组织蛋白酶L（hCatL）的三嗪腈配体的广泛的“杂芳烃扫描”，以研究S3口袋入口处的肽酰胺键Gly67–Gly68上的π堆积。杂芳基·····肽键的堆叠由咪唑并吡啶配体与hCatL的共晶体结构支持。抑制常数（ķ我）受到杂环的多样性和与S3口袋局部环境的特定相互作用的强烈影响。结合亲和力变化三个数量级。与烃类似物相比，所有杂芳族配体均具有增强的结合力。从杂芳烃和肽键的局部偶极矩的方向预测的能量贡献无法得到证实。分子间的C-S⋅⋅⋅O= C相互作用（硫族元素键）与Asn66的主链C = O增强了苯并噻吩基（K i = 4 n m）和苯并噻唑基（K i = 17 n m）配体的结合。 S3口袋。还测试了配体的相关酶罗德沙星。
• Fluorine Scan of Inhibitors of the Cysteine Protease Human Cathepsin L: Dipolar and Quadrupolar Effects in the π-Stacking of Fluorinated Phenyl Rings on Peptide Amide Bonds
  作者：Maude Giroud、Michael Harder、Bernd Kuhn、Wolfgang Haap、Nils Trapp、W. Bernd Schweizer、Tanja Schirmeister、François Diederich

  DOI：10.1002/cmdc.201600132

  日期：2016.5.19

  the S3 pocket, was systematically fluorinated, and differences in inhibitory potency were measured in a fluorimetric assay. Binding affinity is influenced by lipophilicity (clog P), the dipole and quadrupole moments of the fluorinated rings, but also by additional interactions of the introduced fluorine atoms with the local environment of the pocket. Generally, the higher the degree of fluorination

  使用包括酶-配体结合研究和高级量子化学计算在内的双重方法，研究了蛋白质主链酰胺基上的氟化苯环的π-堆积。在实验研究中，系统组织地氟化了人类组织蛋白酶L（hCatL）的三嗪腈抑制剂的苯基取代基，该苯基堆叠在S3口袋入口处的肽酰胺键Gly67-Gly68上，并测定了抑制力的差异。荧光测定。亲和力受亲脂性的影响（c log  P），氟化环的偶极矩和四极矩，而且还可以通过引入的氟原子与腔的局部环境的其他相互作用来实现。通常，氟化度越高，结合亲和力越好。气相计算强有力地支持了氟化苯环的分子四极矩对与肽键的π堆积相互作用的贡献。这些发现为增强蛋白酰胺片段上的π堆积提供了有用的指导。