4-[3-[(2R,3R,4R,5R)-3,4-bis(phenylmethoxy)-5-(phenylmethoxymethyl)oxolan-2-yl]imidazol-4-yl]-1H-pyrimidin-6-one | 437614-57-8

• 分子结构分类: 有机化合物 - 核苷、核苷酸和类似物 - 咪唑核糖核苷和核糖核苷酸
• 英文名称: 4-[3-[(2R,3R,4R,5R)-3,4-bis(phenylmethoxy)-5-(phenylmethoxymethyl)oxolan-2-yl]imidazol-4-yl]-1H-pyrimidin-6-one
• CAS: 437614-57-8
• 化学式: C₃₃H₃₂N₄O₅
• 分子量: 564.641
• InChiKey: JQFMRUSYCJSOFP-WXQJYUTRSA-N

计算性质

• 辛醇/水分配系数(LogP)：
  3
• 重原子数：
  42
• 可旋转键数：
  12
• 环数：
  6.0
• sp3杂化的碳原子比例：
  0.24
• 拓扑面积：
  96.2
• 氢给体数：
  1
• 氢受体数：
  7

反应信息

• 作为反应物：
  描述：

  4-[3-[(2R,3R,4R,5R)-3,4-bis(phenylmethoxy)-5-(phenylmethoxymethyl)oxolan-2-yl]imidazol-4-yl]-1H-pyrimidin-6-one 在 10percent Pd/C ammonium formate 作用下， 以 甲醇 为溶剂， 以92%的产率得到4-[3-[(2R,3R,4S,5R)-3,4-dihydroxy-5-(hydroxymethyl)oxolan-2-yl]imidazol-4-yl]-1H-pyrimidin-6-one
  参考文献：
  名称：

  “弹性工具”。一类新型形状修饰的核苷的设计与合成（1）。

  摘要：

  引入了一类新的形状修饰的核苷。这些新颖的“挠性分子”具有腺嘌呤，肌苷和鸟苷的嘌呤环系统，分为各自的咪唑和嘧啶组分（如1-3所示）。这种结构修饰用于将柔韧性引入核苷，同时仍保留识别所必需的元素。结果，这些新颖的挠性基团应该被用作研究探针-辅酶结合位点以及核酸和蛋白质相互作用的生物探针。描述了它们的设计和综合。

  DOI：

  10.1021/jo0255476
• 作为产物：
  描述：

  6-Amino-1-((2R,3R,4R,5R)-3,4-bis-benzyloxy-5-benzyloxymethyl-tetrahydro-furan-2-yl)-1H-thieno[2,3-d]imidazole-5-carboxylic acid amide 在 镍 乙酸酐 作用下， 以 甲醇 为溶剂， 反应 3.0h， 生成 4-[3-[(2R,3R,4R,5R)-3,4-bis(phenylmethoxy)-5-(phenylmethoxymethyl)oxolan-2-yl]imidazol-4-yl]-1H-pyrimidin-6-one
  参考文献：
  名称：

  “弹性工具”。一类新型形状修饰的核苷的设计与合成（1）。

  摘要：

  引入了一类新的形状修饰的核苷。这些新颖的“挠性分子”具有腺嘌呤，肌苷和鸟苷的嘌呤环系统，分为各自的咪唑和嘧啶组分（如1-3所示）。这种结构修饰用于将柔韧性引入核苷，同时仍保留识别所必需的元素。结果，这些新颖的挠性基团应该被用作研究探针-辅酶结合位点以及核酸和蛋白质相互作用的生物探针。描述了它们的设计和综合。

  DOI：

  10.1021/jo0255476

文献信息

• “Fleximers”. Design and Synthesis of a New Class of Novel Shape-Modified Nucleosides¹
  作者：Katherine L. Seley、Liang Zhang、Asmerom Hagos、Stephen Quirk

  DOI：10.1021/jo0255476

  日期：2002.5.1

  A new class of shape-modified nucleosides is introduced. These novel "fleximers" feature the purine ring systems of adenosine, inosine, and guanosine split into their individual imidazole and pyrimidine components (as in 1-3). This structural modification serves to introduce flexibility into the nucleoside while still retaining the elements essential for recognition. As a consequence, these novel fleximers

  引入了一类新的形状修饰的核苷。这些新颖的“挠性分子”具有腺嘌呤，肌苷和鸟苷的嘌呤环系统，分为各自的咪唑和嘧啶组分（如1-3所示）。这种结构修饰用于将柔韧性引入核苷，同时仍保留识别所必需的元素。结果，这些新颖的挠性基团应该被用作研究探针-辅酶结合位点以及核酸和蛋白质相互作用的生物探针。描述了它们的设计和综合。