Conformational Features of Thioamide-Containing Dipeptoids and Peptoid–Peptide Hybrids—Computational and Experimental Approaches
作者:Magdalena M. Zimnicka
DOI:10.1021/acs.jpca.8b05456
日期:2018.10.4
making the αD isomer prevalent. The nX → σN′C–H* interaction is an additional source of stability of the trans-C7β form relevant for the underivatized dipeptoid model and its C-terminal thioamide counterpart. In the peptoid–peptide hybrid, the trans preference is perturbed by subtle differences in the H-bond donor–acceptor abilities between the thioxo and oxo groups. The cis isomer becomes more populated
讨论了硫酰胺掺入N,N-二甲基-2-(N-甲基乙酰胺基)乙酰胺和N-甲基-2-(N-甲基乙酰胺基)乙酰胺作为二肽结构和类肽-肽杂化物的最简单模型的影响。通过自然键轨道(NBO)分析增强的计算以及使用NMR光谱通过动力学和平衡测量进行的实验,检查了模型化合物的溶剂调节构象特征。通过NBO分析所支持的计算表明主要的那内在稳定性的反式异构体(α d和C 7β的dipeptoid模型结果的形式)从间接Ñ→π*相互作用,发生在羰基氧孤对(n)和相邻的酰胺羰基的π*轨道通过C–H反键(σ*)之间。n →π*直接相互作用对反式稳定作用的贡献可忽略不计。N-末端硫代取代增加了这种间接电子离域,使得α d异构体普遍。所述Ñ X →σ N'C-H *相互作用是的稳定性的额外来源的反式-C 7β形成相关的未衍生dipeptoid模型和其C末端硫代酰胺对应物。在类肽-肽杂种中,反式巯基和羰基之间氢键供体-受体能力