1-O-[(4-methoxyphenyl)diphenylmethyl]-2,2-bis-[(thymin-1-yl)methyl]-1,3-propanediol | 650619-75-3

• 分子结构分类: 有机化合物 - 苯类化合物 - 三苯基化合物
• 英文名称: 1-O-[(4-methoxyphenyl)diphenylmethyl]-2,2-bis-[(thymin-1-yl)methyl]-1,3-propanediol
• 英文别名: 1-[2-(Hydroxymethyl)-2-[[(4-methoxyphenyl)-diphenylmethoxy]methyl]-3-(5-methyl-2,4-dioxopyrimidin-1-yl)propyl]-5-methylpyrimidine-2,4-dione；1-[2-(hydroxymethyl)-2-[[(4-methoxyphenyl)-diphenylmethoxy]methyl]-3-(5-methyl-2,4-dioxopyrimidin-1-yl)propyl]-5-methylpyrimidine-2,4-dione
• CAS: 650619-75-3
• 化学式: C₃₅H₃₆N₄O₇
• 分子量: 624.693
• InChiKey: SPPMHWKWXIQOIT-UHFFFAOYSA-N

物化性质

• 密度：
  1.272±0.06 g/cm3(Predicted)

计算性质

• 辛醇/水分配系数(LogP)：
  2.9
• 重原子数：
  46
• 可旋转键数：
  12
• 环数：
  5.0
• sp3杂化的碳原子比例：
  0.26
• 拓扑面积：
  138
• 氢给体数：
  3
• 氢受体数：
  7

反应信息

• 作为反应物：
  描述：

  2-氰乙基N,N-二异丙基氯亚磷酰胺 、 1-O-[(4-methoxyphenyl)diphenylmethyl]-2,2-bis-[(thymin-1-yl)methyl]-1,3-propanediol 在 N,N-二异丙基乙胺 作用下， 以 二氯甲烷 为溶剂， 反应 3.0h， 以80%的产率得到1-O-[(4-methoxyphenyl)diphenylmethyl]-2,2-bis-[(thymin-1-yl)methyl]-3-O-(P-β-cyanoethyl-N,N-diisopropylaminophosphinyl)-1,3-propanediol
  参考文献：
  名称：

  包含具有两个碱基部分的无环非手性核苷类似物的寡核苷酸的合成和稳定性。

  摘要：

  [结构：见正文]合成了具有两个碱基部分的核苷酸构件，并将其掺入寡核苷酸中。两个碱基之一参与双螺旋内的碱基配对，而另一个碱基则伸出小凹槽。该系统可以用于在螺旋线的外部呈现序列信息。

  DOI：

  10.1021/ol0360647
• 作为产物：
  描述：

  N-3-benzoylthymine 在 吡啶 、 氨 、 三苯基膦 、 三氟乙酸 、 偶氮二甲酸二乙酯 作用下， 以 四氢呋喃 、 甲醇 、 水 为溶剂， 反应 2.0h， 生成 1-O-[(4-methoxyphenyl)diphenylmethyl]-2,2-bis-[(thymin-1-yl)methyl]-1,3-propanediol
  参考文献：
  名称：

  包含具有两个碱基部分的无环非手性核苷类似物的寡核苷酸的合成和稳定性。

  摘要：

  [结构：见正文]合成了具有两个碱基部分的核苷酸构件，并将其掺入寡核苷酸中。两个碱基之一参与双螺旋内的碱基配对，而另一个碱基则伸出小凹槽。该系统可以用于在螺旋线的外部呈现序列信息。

  DOI：

  10.1021/ol0360647

文献信息

• Synthesis and Stability of Oligonucleotides Containing Acyclic Achiral Nucleoside Analogues with Two Base Moieties
  作者：Tongfei Wu、Matheus Froeyen、Guy Schepers、Kristof Mullens、Jef Rozenski、Roger Busson、Arthur Van Aerschot、Piet Herdewijn

  DOI：10.1021/ol0360647

  日期：2004.1.1

  [structure: see text] Nucleotide building blocks with two base moieties were synthesized and incorporated into oligonucleotides. One of the two bases is involved in base pairing within the double helix, while the other base is sticking out of the minor groove. This system may be used for presenting sequence information at the outside of the helix.

  [结构：见正文]合成了具有两个碱基部分的核苷酸构件，并将其掺入寡核苷酸中。两个碱基之一参与双螺旋内的碱基配对，而另一个碱基则伸出小凹槽。该系统可以用于在螺旋线的外部呈现序列信息。