8-oxo-adenosine-5'-triphosphate | 68745-44-8

• 分子结构分类: 有机化合物 - 核苷、核苷酸和类似物 - 嘌呤核苷酸
• 英文名称: 8-oxo-adenosine-5'-triphosphate
• 英文别名: [[(2R,3S,4R,5R)-5-(6-amino-8-oxo-7H-purin-9-yl)-3,4-dihydroxyoxolan-2-yl]methoxy-hydroxyphosphoryl] phosphono hydrogen phosphate
• CAS: 68745-44-8
• 化学式: C₁₀H₁₆N₅O₁₄P₃
• 分子量: 523.183
• InChiKey: CAIHKAFUTAIAPY-UUOKFMHZSA-N

计算性质

• 辛醇/水分配系数(LogP)：
  -6.3
• 重原子数：
  32
• 可旋转键数：
  8
• 环数：
  3.0
• sp3杂化的碳原子比例：
  0.5
• 拓扑面积：
  294
• 氢给体数：
  8
• 氢受体数：
  17

反应信息

• 作为反应物：
  描述：

  8-oxo-adenosine-5'-triphosphate 、 Guanosine 5'-triphosphate 在 human cyclic GMP−AMP synthase 、 magnesium chloride 作用下， 以 aq. buffer 为溶剂， 反应 16.0h， 生成 6-amino-9-[(1R,6R,8R,9R,10S,15R,17R,18R)-17-(2-amino-6-oxo-1H-purin-9-yl)-3,9,12,18-tetrahydroxy-3,12-dioxo-2,4,7,11,13,16-hexaoxa-3lambda5,12lambda5-diphosphatricyclo[13.2.1.06,10]octadecan-8-yl]-7H-purin-8-one
  参考文献：
  名称：

  2'-5'，3'-5'-环二核苷酸的酶法制备，它们与干扰素基因衔接子蛋白刺激物的结合特性以及结构/活性相关性。

  摘要：

  环状二核苷酸是环状GMP-AMP合酶（cGAS）-干扰素基因刺激（STING）途径的第二信使，在识别肿瘤细胞和病毒或细菌感染中起着重要作用。它们与STING衔接蛋白结合并通过TANK结合激酶1（TBK1）/干扰素调节因子3（IRF3）和核因子-κB（IκB）激酶（IKK）/核因子-κB（NFκB）抑制剂触发细胞因子的表达信号级联。在这项工作中，我们描述了使用人，小鼠和鸡的环状GMP-AMP合成酶（cGAS）酶法制备2'-5'，3'-5'-环二核苷酸（2'3'CDNs）的方法。我们通过使用一个小的核苷酸5'-三磷酸（NTP）类似物文库来分析这些酶的底物特异性，并使用它们来制备33个2'3'CDN。我们还确定了这些CDN对基于细胞和生化分析的五种不同STING单倍型的亲和力，并描述了它们对所有STING单倍型的最佳活性所需的特性。接下来，我们研究它们对人外周血单核细胞（PBMC）诱导的细胞因子

  DOI：

  10.1021/acs.jmedchem.9b01062

文献信息

• Modified Diguanylate Cyclase-Phosphodiesterase and Method for Enzymatic Production of Cyclic-diGMP
  申请人：NESBITT Natasha M.

  公开号：US20140170689A1

  公开（公告）日：2014-06-19

  The present invention provides a recombinant polypeptide comprising a first portion and a second portion, wherein the sequence of the first portion is fully identical to amino acids 1 to 248 of the sequence set forth as SEQ ID NO:1 and the sequence of the second portion is other than amino acids 249 to 511 of the sequence set forth as SEQ ID NO:1.
• Enzymatic Preparation of 2′–5′,3′–5′-Cyclic Dinucleotides, Their Binding Properties to Stimulator of Interferon Genes Adaptor Protein, and Structure/Activity Correlations
  作者：Barbora Novotná、Lenka Vaneková、Martin Zavřel、Miloš Buděšínský、Milan Dejmek、Miroslav Smola、Ondrej Gutten、Zahra Aliakbar Tehrani、Markéta Pimková Polidarová、Andrea Brázdová、Radek Liboska、Ivan Štěpánek、Zdeněk Vavřina、Tomáš Jandušík、Radim Nencka、Lubomír Rulíšek、Evžen Bouřa、Jiří Brynda、Ondřej Páv、Gabriel Birkuš

  DOI：10.1021/acs.jmedchem.9b01062

  日期：2019.12.12

  (NFκB) signaling cascades. In this work, we describe an enzymatic preparation of 2′–5′,3′–5′-cyclic dinucleotides (2′3′CDNs) with use of cyclic GMP–AMP synthases (cGAS) from human, mouse, and chicken. We profile substrate specificity of these enzymes by employing a small library of nucleotide-5′-triphosphate (NTP) analogues and use them to prepare 33 2′3′CDNs. We also determine affinity of these CDNs to

  环状二核苷酸是环状GMP-AMP合酶（cGAS）-干扰素基因刺激（STING）途径的第二信使，在识别肿瘤细胞和病毒或细菌感染中起着重要作用。它们与STING衔接蛋白结合并通过TANK结合激酶1（TBK1）/干扰素调节因子3（IRF3）和核因子-κB（IκB）激酶（IKK）/核因子-κB（NFκB）抑制剂触发细胞因子的表达信号级联。在这项工作中，我们描述了使用人，小鼠和鸡的环状GMP-AMP合成酶（cGAS）酶法制备2'-5'，3'-5'-环二核苷酸（2'3'CDNs）的方法。我们通过使用一个小的核苷酸5'-三磷酸（NTP）类似物文库来分析这些酶的底物特异性，并使用它们来制备33个2'3'CDN。我们还确定了这些CDN对基于细胞和生化分析的五种不同STING单倍型的亲和力，并描述了它们对所有STING单倍型的最佳活性所需的特性。接下来，我们研究它们对人外周血单核细胞（PBMC）诱导的细胞因子