N-{7-{(2R,4S,5R)-5-[Bis-(4-methoxy-phenyl)-phenyl-methoxymethyl]-4-hydroxy-tetrahydro-furan-2-yl}-4-oxo-5-[5-(2,2,2-trifluoro-acetylamino)-pent-1-ynyl]-4,7-dihydro-3H-pyrrolo[2,3-d]pyrimidin-2-yl}-isobutyramide | 196925-94-7

• 分子结构分类: 有机化合物 - 苯类化合物 - 三苯基化合物
• 英文名称: N-{7-{(2R,4S,5R)-5-[Bis-(4-methoxy-phenyl)-phenyl-methoxymethyl]-4-hydroxy-tetrahydro-furan-2-yl}-4-oxo-5-[5-(2,2,2-trifluoro-acetylamino)-pent-1-ynyl]-4,7-dihydro-3H-pyrrolo[2,3-d]pyrimidin-2-yl}-isobutyramide
• 英文别名: N-[7-[(2R,4S,5R)-5-[[bis(4-methoxyphenyl)-phenylmethoxy]methyl]-4-hydroxyoxolan-2-yl]-4-oxo-5-[5-[(2,2,2-trifluoroacetyl)amino]pent-1-ynyl]-3H-pyrrolo[2,3-d]pyrimidin-2-yl]-2-methylpropanamide
• CAS: 196925-94-7
• 化学式: C₄₃H₄₄F₃N₅O₈
• 分子量: 815.846
• InChiKey: SLLBCRGFQATIPX-BMPTZRATSA-N

计算性质

• 辛醇/水分配系数(LogP)：
  5.8
• 重原子数：
  59
• 可旋转键数：
  15
• 环数：
  6.0
• sp3杂化的碳原子比例：
  0.35
• 拓扑面积：
  162
• 氢给体数：
  4
• 氢受体数：
  12

反应信息

• 作为反应物：
  描述：

  N-{7-{(2R,4S,5R)-5-[Bis-(4-methoxy-phenyl)-phenyl-methoxymethyl]-4-hydroxy-tetrahydro-furan-2-yl}-4-oxo-5-[5-(2,2,2-trifluoro-acetylamino)-pent-1-ynyl]-4,7-dihydro-3H-pyrrolo[2,3-d]pyrimidin-2-yl}-isobutyramide 、 2'-脱氧胞嘧啶核苷 生成
  参考文献：
  名称：

  7-脱氮鸟嘌呤DNA：具有疏水或阳离子侧链的寡核苷酸†

  摘要：

  亚磷酰胺6b和9以及衍生自7-（己-1-炔基）-和7- [5-（三氟乙酰胺基）戊-1-炔基]取代的7-脱氮基2'-脱氧鸟苷1和2的膦酸酯6a。分别准备了10个（方案1）。它们用于交替八聚体d（hxy 7 c 7 G-C）4（12），d（C-hxy 7 c 7 G）4（13）和d（npey 7 c 7 G-C）的固相寡聚脱氧核苷酸合成中。4（15），以及其他的寡核苷酸（见22 - 25 ;表2 ; HXY =己-1-炔基，npey = 5-氨基戊-1-炔基）。确定了T m值和双链体形成的热力学数据，并将其与DNA片段的主要凹槽修饰相关。发现引入到7-脱氮鸟嘌呤残基的7-位的己炔基侧链（参见1）适合没有任何突出的主要凹槽。将（5-氨基戊-1-炔基）修饰的7-deaza-2'-deoxyguanosine 2掺入24和25型单链低聚物中与亲本寡核苷酸相比，没有导致双链体稳定性的改变。具有交替的npey

  DOI：

  10.1002/hlca.19970800605
• 作为产物：
  描述：

  7-iodo-7-deaza-2'-deoxyguanosine 在 copper(l) iodide 、 四(三苯基膦)钯 、 三甲基氯硅烷 作用下， 以 吡啶 、 三乙胺 、 N,N-二甲基甲酰胺 为溶剂， 生成 N-{7-{(2R,4S,5R)-5-[Bis-(4-methoxy-phenyl)-phenyl-methoxymethyl]-4-hydroxy-tetrahydro-furan-2-yl}-4-oxo-5-[5-(2,2,2-trifluoro-acetylamino)-pent-1-ynyl]-4,7-dihydro-3H-pyrrolo[2,3-d]pyrimidin-2-yl}-isobutyramide
  参考文献：
  名称：

  Duplex Stability of Oligonucleotides Containing 7-Substituted 7-Deaza- and 8-Aza-7-Deazapurine Nucleosides

  摘要：

  The synthesis of 7-substituted 7-deaza- and 8-aza-7-deazapurine 2'-deoxyribonucleosides, their incorporation into oligonucleotides, and the stability of corresponding duplexes is described.

  DOI：

  10.1080/07328319708006116