Host Perturbation in a β-Hydroquinone Clathrate Studied by Combined X-ray/Neutron Charge-Density Analysis: Implications for Molecular Inclusion in Supramolecular Entities
作者:Henrik F. Clausen、Mads R. V. Jørgensen、Simone Cenedese、Mette S. Schmøkel、Mogens Christensen、Yu-Sheng Chen、George Koutsantonis、Jacob Overgaard、Mark A. Spackman、Bo B. Iversen
DOI:10.1002/chem.201400129
日期:2014.6.23
the increased polarization is inclusion of the acetonitrile molecule, whereas the change in geometry of the HQ host structure following inclusion of the guest has very little effect on the electrostatic potential. The fact that guest inclusion has a profound effect on the electrostatic potential suggests that nonpolarizable force fields may be unsuitable for molecular dynamics simulations of host–guest
在非常低的温度(15 K)下测得的X射线/中子(X / N)衍射数据与从头算的理论计算一起用于对苯二酚(HQ)主体-客体配合物的晶体电荷密度(CD)进行建模和乙腈。由于伪对称性,关于HQ腔内乙腈分子有序的信息仅存在于几乎灭绝的,非常弱的衍射数据中,即使使用最明亮的X射线和中子源,也无法以足够的精度进行测量。客体分子的CD模型最终基于理论计算。另一方面,HQ宿主结构的CD由实验数据很好地确定。中子衍射数据提供了氢各向异性的热参数和位置,这对于为这种仅光原子的晶体获得可靠的CD至关重要。独立于X射线和中子衍射数据获得的原子位移参数与|Δ表现出极好的一致性U | 的0.00058的值2指示未完成的数据质量。与空的HQ脱辅基宿主晶体结构中的HQ分子相比,CD和特别是派生的静电特性清楚地表明,宿主-客体复合物中的HQ分子极化增加。发现增加极化的根源是乙腈分子的包含,而在包含客体之后HQ主体结构的几何