1-[(2R,4S,5R)-4-[bis(4-methoxyphenyl)-phenylmethoxy]-5-[[[(2R,3S,5R)-2-[[bis(4-methoxyphenyl)-phenylmethoxy]methyl]-5-(5-methyl-2,4-dioxopyrimidin-1-yl)oxolan-3-yl]oxy-hydroxyphosphinothioyl]oxymethyl]oxolan-2-yl]-5-methylpyrimidine-2,4-dione

• 分子结构分类: 有机化合物 - 苯类化合物 - 三苯基化合物
• 英文名称: 1-[(2R,4S,5R)-4-[bis(4-methoxyphenyl)-phenylmethoxy]-5-[[[(2R,3S,5R)-2-[[bis(4-methoxyphenyl)-phenylmethoxy]methyl]-5-(5-methyl-2,4-dioxopyrimidin-1-yl)oxolan-3-yl]oxy-hydroxyphosphinothioyl]oxymethyl]oxolan-2-yl]-5-methylpyrimidine-2,4-dione
• 化学式: C₆₂H₆₃N₄O₁₅PS
• 分子量: 1167.24
• InChiKey: XNIIOIPPVMYLBN-IXEZTIBHSA-N

计算性质

• 辛醇/水分配系数(LogP)：
  8.9
• 重原子数：
  83
• 可旋转键数：
  22
• 环数：
  10.0
• sp3杂化的碳原子比例：
  0.29
• 拓扑面积：
  243
• 氢给体数：
  3
• 氢受体数：
  16

反应信息

• 作为反应物：
  描述：

  1-[(2R,4S,5R)-4-[bis(4-methoxyphenyl)-phenylmethoxy]-5-[[[(2R,3S,5R)-2-[[bis(4-methoxyphenyl)-phenylmethoxy]methyl]-5-(5-methyl-2,4-dioxopyrimidin-1-yl)oxolan-3-yl]oxy-hydroxyphosphinothioyl]oxymethyl]oxolan-2-yl]-5-methylpyrimidine-2,4-dione 在 triethylamine tris(hydrofluoride) 、 碘 、 三乙胺 作用下， 以 乙腈 为溶剂， 反应 0.17h， 生成 3',5'-O,O-bis(dimethoxytrityl)-dithymidilyl-3',5'-phosphorofluoridate
  参考文献：
  名称：

  A new method for the formation of the P–F bond

  摘要：

  在三乙胺三（氢氟化物）（TAF）存在下，碘促进硫代磷酸酯和二硫代磷酸酯的脱硫反应，快速定量地生成相应的氟代磷酸酯和硫代磷酸酯；在反应条件下，硒代磷酸酯和硫代磷酸酯发生脱硒反应，分别生成氟代磷酸酯和硫代磷酸酯。

  DOI：

  10.1039/a701728f
• 作为产物：
  描述：

  1-[(2R,4S,5R)-5-[[benzoyl-[(2R,3S,5R)-2-[[bis(4-methoxyphenyl)-phenylmethoxy]methyl]-5-(5-methyl-2,4-dioxopyrimidin-1-yl)oxolan-3-yl]oxyphosphoryl]oxymethyl]-4-[bis(4-methoxyphenyl)-phenylmethoxy]oxolan-2-yl]-5-methylpyrimidine-2,4-dione 在 sulfur 、 1,8-二氮杂双环[5.4.0]十一碳-7-烯 、 正丁胺 作用下， 以 吡啶 为溶剂， 反应 1.0h， 以95%的产率得到1-[(2R,4S,5R)-4-[bis(4-methoxyphenyl)-phenylmethoxy]-5-[[[(2R,3S,5R)-2-[[bis(4-methoxyphenyl)-phenylmethoxy]methyl]-5-(5-methyl-2,4-dioxopyrimidin-1-yl)oxolan-3-yl]oxy-hydroxyphosphinothioyl]oxymethyl]oxolan-2-yl]-5-methylpyrimidine-2,4-dione
  参考文献：
  名称：

  酰基膦酸酯：通过酰基膦酸酯中间体立体定向和立体选择性生成二脱氧核糖核苷硫代磷酸酯的新方法

  摘要：

  通过二脱氧核糖核苷2,2,2-三氯乙氧基羰基膦酸酯和芳酰基膦酸酯通过新方法合成了脱氧核糖核苷硫代磷酸酯。通过用Me 3 SiCl-Zn-乙酰丙酮处理，将双脱氧核糖核苷2,2,2-三氯乙氧基羰基膦酸酯转化为双脱氧核糖核苷三甲基甲硅烷基亚磷酸酯，在磷处具有保留构型。通过用硫原位处理将亚磷酸甲硅烷基酯中间体转化为硫代磷酸酯。通过n-BuNH 2的作用，很容易将芳酰基从8-11上除去，并通过单质硫处理原位转化为双脱氧核糖核苷硫代磷酸酯中的仅一种非对映异构体（Rp-构型）。

  DOI：

  10.1016/s0040-4020(01)81630-6

文献信息

• Nucleoside H-phosphonates. Part 19: Efficient entry to novel nucleotide analogues with 2-pyridyl- and 4-pyridylphosphonothioate internucleotide linkages
  作者：Tommy Johansson、Jacek Stawinski

  DOI：10.1016/j.tet.2003.11.010

  日期：2004.1

  Synthetic and P-31 NMR spectroscopy studies resulted in the development of efficient protocols for the stereospecific synthesis of a novel type of nucleotide analogues, 2-pyridyl- and 4-pyridylphosphonothioates. The underlying chemistry involves formation of the P-C bond via a base-promoted reaction of suitably protected dithymidine H-phosphonothioates with N-methoxypyridinium tosylate in acetonitrile, or with trityl chloride in pyridine, to produce high yields of nucleotide analogues with a 2-pyridyl- or 4-pyridyl moiety directly bound to the phosphorus centre. (C) 2003 Elsevier Ltd. All rights reserved.
• FUJII, MITSUO;OZAKI, KOUJI;SEKINE, MITSUO;HATA, TSUJIAKI, TETRAHEDRON, 43,(1987) N 15, 3395-3407
  作者：FUJII, MITSUO、OZAKI, KOUJI、SEKINE, MITSUO、HATA, TSUJIAKI

  DOI：——

  日期：——
• Acylphosphonates
  作者：Mitsuo Fujii、Kouji Ozaki、Mitsuo Sekine、Tsujiaki Hata

  DOI：10.1016/s0040-4020(01)81630-6

  日期：1987.1

  synthesized by a new method via dideoxyribonucleoside 2,2,2-trichloroethoxycarbonylphosphonates and aroylphosphonates. The conversion of dideoxyribonucleoside 2,2,2-trichloroethoxycarbonylphosphonates to dideoxyribonucleoside trimethylsilyl phosphites by treatment with Me3SiCl-Zn-acetylacetone proceeded with retention configuration at phosphorus. The silyl phosphite intermediates were converted to the phosphorothioates

  通过二脱氧核糖核苷2,2,2-三氯乙氧基羰基膦酸酯和芳酰基膦酸酯通过新方法合成了脱氧核糖核苷硫代磷酸酯。通过用Me 3 SiCl-Zn-乙酰丙酮处理，将双脱氧核糖核苷2,2,2-三氯乙氧基羰基膦酸酯转化为双脱氧核糖核苷三甲基甲硅烷基亚磷酸酯，在磷处具有保留构型。通过用硫原位处理将亚磷酸甲硅烷基酯中间体转化为硫代磷酸酯。通过n-BuNH 2的作用，很容易将芳酰基从8-11上除去，并通过单质硫处理原位转化为双脱氧核糖核苷硫代磷酸酯中的仅一种非对映异构体（Rp-构型）。
• A new method for the formation of the P–F bond
  作者：Martin Bollmark、Jacek Stawinski

  DOI：10.1039/a701728f

  日期：——

  Iodine-promoted desulfurization of phosphorothioate and phosphorodithioate diesters in the presence of triethylamine tris(hydrofluoride) (TAF) furnish a rapid and quantitative formation of the corresponding phosphorofluoridates and phosphorofluoridothioates; under the reaction conditions phosphoroselenoate and phosphoroselenothioate diesters undergo deselenization affording the phosphorofluoridate and phosphorofluoridothioate diesters, respectively.

  在三乙胺三（氢氟化物）（TAF）存在下，碘促进硫代磷酸酯和二硫代磷酸酯的脱硫反应，快速定量地生成相应的氟代磷酸酯和硫代磷酸酯；在反应条件下，硒代磷酸酯和硫代磷酸酯发生脱硒反应，分别生成氟代磷酸酯和硫代磷酸酯。