1-((2R,4S,5R)-5-((bis(4-methoxyphenyl)(phenyl)methoxy)methyl)-4-hydroxytetrahydrofuran-2-yl)-1H-benzo[d]imidazol-2(3H)-one | 1493792-37-2

• 分子结构分类: 有机化合物 - 苯类化合物 - 三苯基化合物
• 英文名称: 1-((2R,4S,5R)-5-((bis(4-methoxyphenyl)(phenyl)methoxy)methyl)-4-hydroxytetrahydrofuran-2-yl)-1H-benzo[d]imidazol-2(3H)-one
• 英文别名: 3-[(2R,4S,5R)-5-[[bis(4-methoxyphenyl)-phenylmethoxy]methyl]-4-hydroxyoxolan-2-yl]-1H-benzimidazol-2-one
• CAS: 1493792-37-2
• 化学式: C₃₃H₃₂N₂O₆
• 分子量: 552.627
• InChiKey: WXPXGYATBPSXAM-OJDZSJEKSA-N

计算性质

• 辛醇/水分配系数(LogP)：
  5.0
• 重原子数：
  41.0
• 可旋转键数：
  9.0
• 环数：
  6.0
• sp3杂化的碳原子比例：
  0.24
• 拓扑面积：
  94.94
• 氢给体数：
  2.0
• 氢受体数：
  7.0

反应信息

• 作为反应物：
  描述：

  1-((2R,4S,5R)-5-((bis(4-methoxyphenyl)(phenyl)methoxy)methyl)-4-hydroxytetrahydrofuran-2-yl)-1H-benzo[d]imidazol-2(3H)-one 在 吡啶 、 sodium iodide 作用下， 以 乙二醇二甲醚 为溶剂， 生成
  参考文献：
  名称：

  人工核苷酸在基于聚合酶的致癌性O 6-烷基鸟嘌呤DNA加合物识别中的应用

  摘要：

  用于在DNA中以单碱基分辨率定位烷基化加合物的酶学方法可以使新技术能够理解致癌作用并支持个性化化学疗法。专门与烷基化碱基配对的人工核苷酸为识别和扩增加合物的DNA提供了一种可能的策略，并且通过DNA聚合酶已经证明了模型DNA加合物O 6-苄基鸟嘌呤的加合物模板化人工核苷酸的掺入。在这项研究中，具有生物相关性的DNA加合物O 6-甲基鸟嘌呤（O 6 -MeG）和O 6-羧甲基鸟嘌呤（O 6-CMG）被表征为通过工程化的KlenTaq DNA聚合酶掺入苯并咪唑衍生的2'-脱氧核苷5'- O-三磷酸酯（Benzi TP和BIM TP）的有效模板。该酶催化人工核苷酸Benzi相反的加合物的特异性掺入，对O 6 -MeG的催化效率比模板中的鸟嘌呤高150倍。此外，加入人工核苷酸的本齐的旁通期间所需的全长DNA合成ö 6 -CMG。与O 6相反的人工核苷酸的选择性掺入使用一种新的2'，3'-双脱氧衍生物-alkylguanine

  DOI：

  10.1093/nar/gkw589
• 作为产物：
  描述：

  2-羟基苯并咪唑 在 吡啶 、 sodium methylate 、 sodium hydride 作用下， 以 四氢呋喃 、 甲醇 为溶剂， 反应 9.25h， 生成 1-((2R,4S,5R)-5-((bis(4-methoxyphenyl)(phenyl)methoxy)methyl)-4-hydroxytetrahydrofuran-2-yl)-1H-benzo[d]imidazol-2(3H)-one
  参考文献：
  名称：

  氢键键合或堆叠相互作用，以区分含烷基化DNA的合成核苷探针的寡核苷酸的双链体稳定性。

  摘要：

  与修饰的DNA杂交的寡核苷酸是有用的化学工具，用于探测稳定DNA双链体的非共价相互作用。为了更好地理解影响杂交探针对O 6烷基鸟嘌呤损伤特异性的相互作用，我们就稳定由天然氨基酸组成的双链DNA的能力研究了一系列合成核苷类似物（BIM，Benzi和Peri）。或损坏的DNA寡核苷酸。碱基修饰的核苷类似物包含系统变化的氢键和π堆积性质。将核苷探针掺入DNA中并配对相反的规范碱基（A，T，C或G），O 6-甲基鸟嘌呤（O 6 -MeG），O6-苄基鸟嘌呤（O 6 -BnG）或稳定的无碱基位点类似物（四氢呋喃，THF）。根据双链体形成的自由能，当将Peri与O 6- MeG配对时，观察到最高的稳定度。热力学数据表明，较小的探针通过氢键使DNA双链体更稳定，而对π堆栈具有更大容量的较大的探针在碱基堆积的基础上对双链体的稳定做出了更大的贡献。这些结果表明，当BIM，Benzi或Peri与相反的含损伤DNA而不是未修饰的DNA（即O

  DOI：

  10.1002/chem.201204593

文献信息

• OLIGONUCLEOTIDE COMPOSITIONS AND METHODS OF USE THEREOF
  申请人：Wave Life Sciences Ltd.

  公开号：EP4022059A1

  公开（公告）日：2022-07-06
• [EN] OLIGONUCLEOTIDE COMPOSITIONS AND METHODS OF USE THEREOF<br/>[FR] COMPOSITIONS D'OLIGONUCLÉOTIDES ET LEURS PROCÉDÉS D'UTILISATION
  申请人：WAVE LIFE SCIENCES LTD

  公开号：WO2021071858A1

  公开（公告）日：2021-04-15

  Among other things, the present disclosure provides oligonucleotides and compositions thereof. In some embodiments, provided oligonucleotides and compositions are useful for adenosine modification. In some embodiments, the present disclosure provides methods for treating various conditions, disorders or diseases that can benefit from adenosine modification.