3'-O-acetyl-2'-azido-2'-deoxy-5'-O-(4,4'-dimethoxytrityl)uridine | 177980-09-5

• 分子结构分类: 有机化合物 - 苯类化合物 - 三苯基化合物
• 英文名称: 3'-O-acetyl-2'-azido-2'-deoxy-5'-O-(4,4'-dimethoxytrityl)uridine
• CAS: 177980-09-5
• 化学式: C₃₂H₃₁N₅O₈
• 分子量: 613.627
• InChiKey: ILBMBIDLDKVTGJ-PYYPWFDZSA-N

计算性质

• 辛醇/水分配系数(LogP)：
  4.07
• 重原子数：
  45.0
• 可旋转键数：
  11.0
• 环数：
  5.0
• sp3杂化的碳原子比例：
  0.28
• 拓扑面积：
  166.84
• 氢给体数：
  1.0
• 氢受体数：
  10.0

反应信息

• 作为反应物：
  描述：

  3'-O-acetyl-2'-azido-2'-deoxy-5'-O-(4,4'-dimethoxytrityl)uridine 在 二氯乙酸 作用下， 以 二氯甲烷 为溶剂， 反应 3.0h， 生成 2'-azido-2'-deoxy-3'-O-acetyluridine
  参考文献：
  名称：

  使用磷酸三酯化学合成包含2'-叠氮基和2'-氨基-2'-脱氧尿苷的寡核苷酸

  摘要：

  已显示寡核苷酸合成的磷酸三酯方法可用于组装包含多个内部2'-叠氮基取代基的低聚物。随后用三烷基膦还原叠氮基，提供了2'-氨基取代的寡核苷酸。

  DOI：

  10.1016/0040-4039(96)00536-9
• 作为产物：
  描述：

  2,2'-anhydro-5'-O-(4,4'-dimethoxytrityl)uridine 在 吡啶 、 叠氮化锂 作用下， 以 N,N-二甲基甲酰胺 为溶剂， 反应 31.0h， 生成 3'-O-acetyl-2'-azido-2'-deoxy-5'-O-(4,4'-dimethoxytrityl)uridine
  参考文献：
  名称：

  核苷酸。LVII部分。2'-氨基-2'-脱氧核糖核苷的亚磷酰胺结构单元的合成：寡核苷酸合成的新化合物†

  摘要：

  化学合成的尿嘧啶，胞嘧啶，腺嘌呤，鸟嘌呤和2'-氨基-2'-脱氧核糖核苷，和其转化为适当保护的3'-亚磷酰胺构建模块35 - 40用于寡核苷酸合成进行说明。使用2-（4-硝基苯基）乙氧羰基（npeoc）基团保护糖苷配基和2'-氨基官能团。3'- O-琥珀酰基（3' - O-（3-羧基丙酰基））取代的起始核苷41的合成描述了1,8-二氮杂双环[5.4.0]十一碳-7-烯（DBU）脱保护过程中预期迁移的溶液和固相行为，并对其进行了研究。使用新的结构单元制备了寡核苷酸，并通过紫外熔融技术研究了它们的杂交特性。

  DOI：

  10.1002/hlca.19980810556