N4-benzoyl-5'-O-(4,4'-dimethoxytrityl)-2'-methoxyoxalylamino-2'-deoxycytidine | 807370-92-9

• 分子结构分类: 有机化合物 - 苯类化合物 - 三苯基化合物
• 英文名称: N4-benzoyl-5'-O-(4,4'-dimethoxytrityl)-2'-methoxyoxalylamino-2'-deoxycytidine
• 英文别名: N⁴-benzoyl-5'-O-(4,4'-dimethoxytrityl)-2'-methoxyoxalylamino-2'-deoxycytidine
• CAS: 807370-92-9
• 化学式: C₄₀H₃₈N₄O₁₀
• 分子量: 734.763
• InChiKey: YDCPJZMFUFLNGP-SPBWOXKUSA-N

计算性质

• 辛醇/水分配系数(LogP)：
  3.44
• 重原子数：
  54.0
• 可旋转键数：
  12.0
• 环数：
  6.0
• sp3杂化的碳原子比例：
  0.23
• 拓扑面积：
  176.54
• 氢给体数：
  3.0
• 氢受体数：
  12.0

反应信息

• 作为反应物：
  描述：

  双(二异丙基氨基)(2-氰基乙氧基)膦 、 N4-benzoyl-5'-O-(4,4'-dimethoxytrityl)-2'-methoxyoxalylamino-2'-deoxycytidine 在 二异丙基铵盐四氮唑 作用下， 以 二氯甲烷 为溶剂， 反应 3.0h， 以60%的产率得到N⁴-benzoyl-5'-O-(4,4'-dimethoxytrityl)-2'-methoxyoxalylamino-3'-(2-cyanoethyl-N,N-diisopropylamino)phosphinyl-2'-deoxycytidine
  参考文献：
  名称：

  带有带有反应性残基的接头的用于寡核苷酸合成的单体：II。基于尿苷和胞嘧啶并在2'位含有甲氧基草酰胺基团的连接体合成亚磷酰胺

  摘要：

  开发了一种方便的 2'-氨基-2'-脱氧尿苷的制备合成方法。从 2'-氨基-2'-脱氧尿苷和 2'-氨基-2'-脱氧胞苷开始，获得了在 2' 位带有带有甲氧基草酰胺基团的接头的亚磷酰胺寡核苷酸合成单体。

  DOI：

  10.1023/b:rubi.0000030130.99454.ae
• 作为产物：
  描述：

  2'-amino-5'-O-(4,4'-dimethoxytrityl)-2'-deoxycytidine 在 三乙胺 作用下， 以 甲醇 、 N,N-二甲基甲酰胺 为溶剂， 反应 3.0h， 生成 N4-benzoyl-5'-O-(4,4'-dimethoxytrityl)-2'-methoxyoxalylamino-2'-deoxycytidine
  参考文献：
  名称：

  带有带有反应性残基的接头的用于寡核苷酸合成的单体：II。基于尿苷和胞嘧啶并在2'位含有甲氧基草酰胺基团的连接体合成亚磷酰胺

  摘要：

  开发了一种方便的 2'-氨基-2'-脱氧尿苷的制备合成方法。从 2'-氨基-2'-脱氧尿苷和 2'-氨基-2'-脱氧胞苷开始，获得了在 2' 位带有带有甲氧基草酰胺基团的接头的亚磷酰胺寡核苷酸合成单体。

  DOI：

  10.1023/b:rubi.0000030130.99454.ae