5′-O-dimethoxytrityl-3′-O-tert-butyldiphenylsilyl-thio-α,β,-D-CNA(S_c,R_P) | 943002-12-8

• 分子结构分类: 有机化合物 - 苯类化合物 - 三苯基化合物
• 英文名称: 5′-O-dimethoxytrityl-3′-O-tert-butyldiphenylsilyl-thio-α,β,-D-CNA(S_c,R_P)
• 英文别名: 1-[(2R,4S,5R)-5-[[bis(4-methoxyphenyl)-phenylmethoxy]methyl]-4-[[(2R,4S)-4-[(2S,3S,5R)-3-[tert-butyl(diphenyl)silyl]oxy-5-(5-methyl-2,4-dioxopyrimidin-1-yl)oxolan-2-yl]-2-sulfanylidene-1,3,2lambda5-dioxaphosphinan-2-yl]oxy]oxolan-2-yl]-5-methylpyrimidine-2,4-dione；1-[(2R,4S,5R)-5-[[bis(4-methoxyphenyl)-phenylmethoxy]methyl]-4-[[(2R,4S)-4-[(2S,3S,5R)-3-[tert-butyl(diphenyl)silyl]oxy-5-(5-methyl-2,4-dioxopyrimidin-1-yl)oxolan-2-yl]-2-sulfanylidene-1,3,2λ5-dioxaphosphinan-2-yl]oxy]oxolan-2-yl]-5-methylpyrimidine-2,4-dione
• CAS: 943002-12-8
• 化学式: C₅₉H₆₅N₄O₁₃PSSi
• 分子量: 1129.31
• InChiKey: GCCVVLOSRZJKOW-GKENUPNZSA-N

计算性质

• 辛醇/水分配系数(LogP)：
  7.66
• 重原子数：
  79
• 可旋转键数：
  18
• 环数：
  10.0
• sp3杂化的碳原子比例：
  0.36
• 拓扑面积：
  214
• 氢给体数：
  2
• 氢受体数：
  14

反应信息

• 作为反应物：
  描述：

  5′-O-dimethoxytrityl-3′-O-tert-butyldiphenylsilyl-thio-α,β,-D-CNA(S_c,R_P) 在 四丁基氟化铵 、 三氟乙酸 作用下， 以 四氢呋喃 、 二氯甲烷 为溶剂， 反应 0.33h， 以72%的产率得到
  参考文献：
  名称：

  具有非经典 α/β 扭转角组合 (α,β-CNA) 的构象限制性硫代-二氧杂-和氧-氧-氧硫杂磷烷二核苷酸的非对映选择性和区域选择性合成

  摘要：

  描述了对立体定义的 5'-C-甲苯磺酰氧基硫代磷酸酯二核苷酸单元的区域选择性环化的控制，以提供硫代-二氧杂-或氧代-氧硫杂磷烷类型的构象限制性二核苷酸。新合成的建筑单元的 NMR 结构分析表明，α 和 β 扭转角被限制为非规范值 {gauche(+), trans} 或 {anticlinal(–), trans}。(© Wiley-VCH Verlag GmbH & Co. KGaA，69451 魏因海姆，德国，2007）

  DOI：

  10.1002/ejoc.200601030
• 作为产物：
  描述：

  cyanoethyl 3'-O-(5'-O-dimethoxytrityl)thymidinyl-5'-C(S)-tosyloxyethyl-(3'-tert-butyldiphenylsilyl)thymidinyl thiophosphoric ester 在 potassium carbonate 、 cadmium(II) chloride 作用下， 以 N,N-二甲基甲酰胺 为溶剂， 反应 432.0h， 以95%的产率得到5′-O-dimethoxytrityl-3′-O-tert-butyldiphenylsilyl-thio-α,β,-D-CNA(S_c,R_P)
  参考文献：
  名称：

  具有非经典 α/β 扭转角组合 (α,β-CNA) 的构象限制性硫代-二氧杂-和氧-氧-氧硫杂磷烷二核苷酸的非对映选择性和区域选择性合成

  摘要：

  描述了对立体定义的 5'-C-甲苯磺酰氧基硫代磷酸酯二核苷酸单元的区域选择性环化的控制，以提供硫代-二氧杂-或氧代-氧硫杂磷烷类型的构象限制性二核苷酸。新合成的建筑单元的 NMR 结构分析表明，α 和 β 扭转角被限制为非规范值 {gauche(+), trans} 或 {anticlinal(–), trans}。(© Wiley-VCH Verlag GmbH & Co. KGaA，69451 魏因海姆，德国，2007）

  DOI：

  10.1002/ejoc.200601030

文献信息

• Thio- and Seleno-Dioxaphosphorinane-Constrained Dinucleotides (D-CNA): Synthesis and Conformational Study
  作者：Béatrice Gerland、Claudia Addamiano、Brice-Loïc Renard、Corinne Payrastre、Deshmukh Gopaul、Jean-Marc Escudier

  DOI：10.1002/ejoc.201601568

  日期：2017.3.17

  Thio- and seleno-α,β- and α,β,γ-CNA (Constrained Nucleic Acid) dinucleotides in which two or three torsional angles of the sugar/phosphate backbone are controlled within a dioxaphosphorinane structure have been prepared. Their structural determination have been carried out by means of NMR to show only slight variation on the torsional angle control in comparison with their oxo analogues. Unexpected

  已经制备了硫代-和硒-α,β-和α,β,γ-CNA（受限核酸）二核苷酸，其中糖/磷酸骨架的两个或三个扭转角被控制在二氧杂膦烷结构内。它们的结构测定是通过 NMR 进行的，与它们的氧代类似物相比，扭转角控制只有轻微的变化。已经指出了硒从硒代磷酸三酯部分到亚磷酰胺基团的意外硒迁移，但是使用 H-膦酸酯化学可以克服这个缺点。