| 205313-95-7

• 分子结构分类: 有机化合物 - 核苷、核苷酸和类似物 - 2 '，5'-二脱氧核苷
• CAS: 205313-95-7
• 化学式: C₃₄H₅₇N₅O₉Si₂
• 分子量: 736.026
• InChiKey: BXZHFOWBAWAHFX-BUPPRGBLSA-N

计算性质

• 辛醇/水分配系数(LogP)：
  3.81
• 重原子数：
  50.0
• 可旋转键数：
  11.0
• 环数：
  4.0
• sp3杂化的碳原子比例：
  0.74
• 拓扑面积：
  175.74
• 氢给体数：
  3.0
• 氢受体数：
  11.0

反应信息

• 作为反应物：
  描述：

  在 吡啶 、 四丁基氟化铵 作用下， 以 四氢呋喃 为溶剂， 生成 2-((2S,3R,5R)-2-((bis(4-methoxyphenyl)(phenyl)methoxy)methyl)-5-(5-methyl-2,4-dioxo-3,4-dihydropyrimidin-1(2H)-yl)tetrahydrofuran-3-yl)-N-(((2R,3S,5R)-3-hydroxy-5-(5-methyl-2,4-dioxo-3,4-dihydropyrimidin-1(2H)-yl)tetrahydrofuran-2-yl)methyl)acetamide
  参考文献：
  名称：

  骨架修饰寡核苷酸的结构和稳定性分析：在催化模板合成中避免产物抑制的意义

  摘要：

  在 d(CpGpTNTpGpC) 之间形成的骨架修饰的 DNA 双链体 1 不稳定的结构和热力学起源，包含单个氨基乙基 (-CH2-CH2-NH2+-) 代替磷酸二酯 (-O-PO2-- O-) 中心 TT 二聚体的连接和 d(GpCpApApCpG) 进行了研究。对相应的天然双链体和双链体 1 的两个其他相关结构类似物的分析进行了比较。双链体 1 显示了与二态过程一致的协同热熔融转变。在 2 mM 浓度下，双链体 1 的解链温度比天然双链体降低了 17 °C，这种稳定性的降低进一步归因于 7 kcal mol-1 的焓降低和熵的有利增加15 eu mol-1。核磁共振结构分析表明，修饰后的双链体 1 仍采用经典的 B-DNA 构象，并保留了 Watson-Crick 碱基配对；然而，取代修饰骨架中的天然 PO2- 基团的 CH2 基团是灵活的...

  DOI：

  10.1021/ja972869w
• 作为产物：
  描述：

  [(2S,3R,5R)-2-(tert-Butyl-dimethyl-silanyloxymethyl)-5-(5-methyl-2,4-dioxo-3,4-dihydro-2H-pyrimidin-1-yl)-tetrahydro-furan-3-yl]-acetic acid 、 5'-amino-3'-tert-butyldimethylsilyl-5'-deoxythymidine 在 4-二甲氨基吡啶 、 对甲苯磺酸 、 盐酸-N-乙基-Nˊ-(3-二甲氨基丙基)碳二亚胺 作用下， 以 二氯甲烷 为溶剂， 反应 2.0h， 以68%的产率得到
  参考文献：
  名称：

  骨架修饰寡核苷酸的结构和稳定性分析：在催化模板合成中避免产物抑制的意义

  摘要：

  在 d(CpGpTNTpGpC) 之间形成的骨架修饰的 DNA 双链体 1 不稳定的结构和热力学起源，包含单个氨基乙基 (-CH2-CH2-NH2+-) 代替磷酸二酯 (-O-PO2-- O-) 中心 TT 二聚体的连接和 d(GpCpApApCpG) 进行了研究。对相应的天然双链体和双链体 1 的两个其他相关结构类似物的分析进行了比较。双链体 1 显示了与二态过程一致的协同热熔融转变。在 2 mM 浓度下，双链体 1 的解链温度比天然双链体降低了 17 °C，这种稳定性的降低进一步归因于 7 kcal mol-1 的焓降低和熵的有利增加15 eu mol-1。核磁共振结构分析表明，修饰后的双链体 1 仍采用经典的 B-DNA 构象，并保留了 Watson-Crick 碱基配对；然而，取代修饰骨架中的天然 PO2- 基团的 CH2 基团是灵活的...

  DOI：

  10.1021/ja972869w