摘要:
Sigma-1 受体 (S1R) 由于能够与各种蛋白质和离子通道相互作用,因此参与多种生物功能。人 S1R 的晶体结构揭示了三聚体组织,其中每个原聚体包含配体结合口袋。本研究应用多步计算程序来开发药效团模型,该模型是通过对著名 S1R 配体的可用共晶结构进行分子动力学模拟而获得的。除了完善的正电离和疏水特征之外,所获得的模型还包括额外的特定疏水特征和不同的排除体积,从而增加了模型的选择性以及更详细地确定两个基本特征之间的距离。获得的药效团模型通过了活性和非活性S1R配体的受试者工作特征(ROC)曲线分析的验证测试。最后,通过新型 4-苯基哌嗪类化合物的合成和结合测定,对药效性能进行了实验研究。最活跃的新配体 2-(3-甲基-1-哌啶基)-1-(4-苯基哌嗪-1-基)乙酮 ( 3 ) 显示出接近参考化合物氟哌啶醇的 S1R 亲和力( K i值为 4.8 和 2.6分别为 nM)。所提出的药效团模型可以作为设计和发现新的有效