2-[2-[2-[2-[2-[2-[[(2R,3S,4R,5R)-5-[6-[2-[2-[2-[5-[(3aS,4S,6aR)-2-oxo-1,3,3a,4,6,6a-hexahydrothieno[3,4-d]imidazol-4-yl]pentanoylamino]ethoxy]ethoxy]ethylamino]purin-9-yl]-3,4-dihydroxyoxolan-2-yl]methoxy-hydroxyphosphoryl]oxyethoxy]ethoxy]ethoxy]ethoxy]ethoxy]ethyl [(2R,3S,4R,5R)-5-(2-amino-6-oxo-1H-purin-9-yl)-3,4-dihydroxyoxolan-2-yl]methyl hydrogen phosphate | 1017598-30-9

• 分子结构分类: 有机化合物 - 核苷、核苷酸和类似物 - 嘌呤核苷酸
• 英文名称: 2-[2-[2-[2-[2-[2-[[(2R,3S,4R,5R)-5-[6-[2-[2-[2-[5-[(3aS,4S,6aR)-2-oxo-1,3,3a,4,6,6a-hexahydrothieno[3,4-d]imidazol-4-yl]pentanoylamino]ethoxy]ethoxy]ethylamino]purin-9-yl]-3,4-dihydroxyoxolan-2-yl]methoxy-hydroxyphosphoryl]oxyethoxy]ethoxy]ethoxy]ethoxy]ethoxy]ethyl [(2R,3S,4R,5R)-5-(2-amino-6-oxo-1H-purin-9-yl)-3,4-dihydroxyoxolan-2-yl]methyl hydrogen phosphate
• CAS: 1017598-30-9
• 化学式: C₄₈H₇₇N₁₃O₂₄P₂S
• 分子量: 1314.23
• InChiKey: ZPHFDZSVMBNDJD-NKXZSFLLSA-N

计算性质

• 辛醇/水分配系数(LogP)：
  -7.6
• 重原子数：
  88
• 可旋转键数：
  43
• 环数：
  8.0
• sp3杂化的碳原子比例：
  0.75
• 拓扑面积：
  512
• 氢给体数：
  12
• 氢受体数：
  30

反应信息

• 作为产物：
  描述：

  在 ammonium hydroxide 、 甲胺 作用下， 反应 1.5h， 以9.2 μmol的产率得到2-[2-[2-[2-[2-[2-[[(2R,3S,4R,5R)-5-[6-[2-[2-[2-[5-[(3aS,4S,6aR)-2-oxo-1,3,3a,4,6,6a-hexahydrothieno[3,4-d]imidazol-4-yl]pentanoylamino]ethoxy]ethoxy]ethylamino]purin-9-yl]-3,4-dihydroxyoxolan-2-yl]methoxy-hydroxyphosphoryl]oxyethoxy]ethoxy]ethoxy]ethoxy]ethoxy]ethyl [(2R,3S,4R,5R)-5-(2-amino-6-oxo-1H-purin-9-yl)-3,4-dihydroxyoxolan-2-yl]methyl hydrogen phosphate
  参考文献：
  名称：

  Synthesis of guanosine 5′-conjugates and their use as initiator molecules for transcription priming

  摘要：

  我们合成了两种与生物素化腺苷部分相连的鸟苷衍生物，采用了两种不同的策略，一种是在固相上进行合成步骤，另一种则完全在溶液中进行。合成的衍生物在转录引物实验中被证明可以作为引发分子使用。引入效率被确定为大约2%。尽管这个值相对较低，但在选择实验中使用其中任何一种分子似乎都是合理的。基本上，可以生成序列复杂度为10^15到10^16的RNA文库。用我们的引发分子标记这样的文库仍然可以产生10^13到10^14个标记/功能化序列，从而提供足够的序列空间用于选择。

  DOI：

  10.1039/b716151d