N-(1-(2,2-difluorocyclooct-3-yn-1-yl)-2-oxo-7,10,13-trioxa-3-azahexadecan-16-yl)-5-((3aS,4S,6aR)-2-oxohexahydro-1H-thieno[3,4-d]imidazol-4-yl)pentanamide | 1047997-50-1

• 分子结构分类: 有机化合物 - 有机杂环化合物 - 生物素及其衍生物
• 英文名称: N-(1-(2,2-difluorocyclooct-3-yn-1-yl)-2-oxo-7,10,13-trioxa-3-azahexadecan-16-yl)-5-((3aS,4S,6aR)-2-oxohexahydro-1H-thieno[3,4-d]imidazol-4-yl)pentanamide
• CAS: 1047997-50-1
• 化学式: C₃₀H₄₈F₂N₄O₆S
• 分子量: 630.797
• InChiKey: VDQKDZLEWJLISL-YCZAKPCCSA-N

计算性质

• 辛醇/水分配系数(LogP)：
  2.99
• 重原子数：
  43.0
• 可旋转键数：
  21.0
• 环数：
  3.0
• sp3杂化的碳原子比例：
  0.83
• 拓扑面积：
  127.02
• 氢给体数：
  4.0
• 氢受体数：
  7.0

反应信息

• 作为产物：
  描述：

  、 N-(3-(2-(2-(3-氨基丙氧基)乙氧基)乙氧基)丙基)-5-((3AS,4S,6AR)-2-氧代六氢-1H-噻吩并[3,4-D]咪唑哌啶-4-基)戊酰胺 在 N,N-二异丙基乙胺 作用下， 以 N,N-二甲基甲酰胺 为溶剂， 反应 4.0h， 以6.4 mg的产率得到N-(1-(2,2-difluorocyclooct-3-yn-1-yl)-2-oxo-7,10,13-trioxa-3-azahexadecan-16-yl)-5-((3aS,4S,6aR)-2-oxohexahydro-1H-thieno[3,4-d]imidazol-4-yl)pentanamide
  参考文献：
  名称：

  用于无铜点击化学的第二代二氟环辛炔

  摘要：

  叠氮化物和活化炔烃的 1,3-偶极环加成已用于体外和体内生物分子的位点选择性标记。虽然铜催化已被广泛用于激活末端炔烃以进行 [3 + 2] 环加成，但由于金属的毒性，这种通常称为“点击化学”的方法目前与生命系统不相容。我们最近报道了一种二氟环辛炔 (DIFO) 试剂，它无需铜催化即可与活细胞中的叠氮化物快速反应。在这里，我们报告了一类用于无铜点击化学的新型 DIFO 试剂，它们在合成上更易于处理。新的类似物保持了与母体化合物相同的 [3 + 2] 环加成速率，并用于对活细胞上的聚糖进行成像。

  DOI：

  10.1021/ja803086r