N-(3-(1-((R)-2-(4-(1-benzyl-1H-benzo[d]imidazol-2-yl)phenoxy)-1-(piperidin-4-yl)ethyl)-1H-benzo[d]imidazol-2-yl)benzyl)-1-(5-((3aS,4S,6aR)-2-oxohexahydro-1H-thieno[3,4-d]imidazol-4-yl)pentanamido)-3,6,9,12-tetraoxapentadecan-15-amide trifluoroacetate | 1639123-21-9

• 分子结构分类: 有机化合物 - 有机杂环化合物 - 生物素及其衍生物
• 英文名称: N-(3-(1-((R)-2-(4-(1-benzyl-1H-benzo[d]imidazol-2-yl)phenoxy)-1-(piperidin-4-yl)ethyl)-1H-benzo[d]imidazol-2-yl)benzyl)-1-(5-((3aS,4S,6aR)-2-oxohexahydro-1H-thieno[3,4-d]imidazol-4-yl)pentanamido)-3,6,9,12-tetraoxapentadecan-15-amide trifluoroacetate
• CAS: 1639123-21-9
• 化学式: C₂HF₃O₂*C₆₂H₇₅N₉O₈S
• 分子量: 1220.42
• InChiKey: FCUMNSIOIIQJEZ-KRFMVBJYSA-N

反应信息

• 作为产物：
  描述：

  、 三氟乙酸 、 21-[(3aS,4S,6aR)-六氢-2-氧代-1H-噻吩并[3,4-d]咪唑-4-基]-17-氧代-4,7,10,13-四氧杂-16-氮杂二十一烷酸 在 N,N-二异丙基乙胺 、 N-[(dimethylamino)-3-oxo-1H-1,2,3-triazolo[4,5-b]pyridin-1-yl-methylene]-N-methylmethanaminium hexafluorophosphate 、 盐酸 作用下， 以 1,4-二氧六环 、 二氯甲烷 、 甲醇 、 水 、 乙腈 为溶剂， 反应 21.0h， 以45%的产率得到N-(3-(1-((R)-2-(4-(1-benzyl-1H-benzo[d]imidazol-2-yl)phenoxy)-1-(piperidin-4-yl)ethyl)-1H-benzo[d]imidazol-2-yl)benzyl)-1-(5-((3aS,4S,6aR)-2-oxohexahydro-1H-thieno[3,4-d]imidazol-4-yl)pentanamido)-3,6,9,12-tetraoxapentadecan-15-amide trifluoroacetate
  参考文献：
  名称：

  针对PDEδ异戊二烯结合位点的高效苯并咪唑抑制剂的结构导向设计和动力学分析

  摘要：

  K-Ras是最常见的信号转导人类致癌基因之一。Ras信号传导活性需要GTPase的正确细胞定位。K-Ras的空间组织受到异戊二烯结合蛋白PDEδ的控制，异戊二烯结合蛋白PDEδ增强Ras在细胞质中的扩散。小分子抑制Ras–PDEδ相互作用会削弱Ras的定位和信号传导。在这里，我们详细描述了靶向Ras–PDEδ抑制剂的鉴定和结构指导的开发，该抑制剂靶向具有纳摩尔摩尔亲和力的PDEδ的法呢基结合袋。我们报道了表征最有效的小分子配体与PDEδ结合的动力学数据，并证明了它们与细胞裂解液中的内源PDEδ结合。

  DOI：

  10.1021/jm500632s