[(2R,3R,4R,5R)-2-[6-[2-[2-[2-[5-[(3aS,4S,6aR)-2-oxo-1,3,3a,4,6,6a-hexahydrothieno[3,4-d]imidazol-4-yl]pentanoylamino]ethoxy]ethoxy]ethylamino]purin-9-yl]-4-hydroxy-5-(hydroxymethyl)oxolan-3-yl] 2-[2-[2-[2-[2-[2-[[(2R,3S,4R,5R)-5-(2-amino-6-oxo-1H-purin-9-yl)-3,4-dihydroxyoxolan-2-yl]methoxy-hydroxyphosphoryl]oxyethoxy]ethoxy]ethoxy]ethoxy]ethoxy]ethyl hydrogen phosphate | 1017598-29-6

• 分子结构分类: 有机化合物 - 核苷、核苷酸和类似物 - 嘌呤核苷酸
• 英文名称: [(2R,3R,4R,5R)-2-[6-[2-[2-[2-[5-[(3aS,4S,6aR)-2-oxo-1,3,3a,4,6,6a-hexahydrothieno[3,4-d]imidazol-4-yl]pentanoylamino]ethoxy]ethoxy]ethylamino]purin-9-yl]-4-hydroxy-5-(hydroxymethyl)oxolan-3-yl] 2-[2-[2-[2-[2-[2-[[(2R,3S,4R,5R)-5-(2-amino-6-oxo-1H-purin-9-yl)-3,4-dihydroxyoxolan-2-yl]methoxy-hydroxyphosphoryl]oxyethoxy]ethoxy]ethoxy]ethoxy]ethoxy]ethyl hydrogen phosphate
• CAS: 1017598-29-6
• 化学式: C₄₈H₇₇N₁₃O₂₄P₂S
• 分子量: 1314.23
• InChiKey: HIICPAIIYYTNHZ-NKXZSFLLSA-N

计算性质

• 辛醇/水分配系数(LogP)：
  -7
• 重原子数：
  88
• 可旋转键数：
  43
• 环数：
  8.0
• sp3杂化的碳原子比例：
  0.75
• 拓扑面积：
  512
• 氢给体数：
  12
• 氢受体数：
  30

反应信息

• 作为产物：
  描述：

  2'-O-,3'-O-,N2-triisobutyrylguanosine (methyl-N,N-diisopropyl)phosphoramidite 、 、 生成 [(2R,3R,4R,5R)-2-[6-[2-[2-[2-[5-[(3aS,4S,6aR)-2-oxo-1,3,3a,4,6,6a-hexahydrothieno[3,4-d]imidazol-4-yl]pentanoylamino]ethoxy]ethoxy]ethylamino]purin-9-yl]-4-hydroxy-5-(hydroxymethyl)oxolan-3-yl] 2-[2-[2-[2-[2-[2-[[(2R,3S,4R,5R)-5-(2-amino-6-oxo-1H-purin-9-yl)-3,4-dihydroxyoxolan-2-yl]methoxy-hydroxyphosphoryl]oxyethoxy]ethoxy]ethoxy]ethoxy]ethoxy]ethyl hydrogen phosphate
  参考文献：
  名称：

  Synthesis of guanosine 5′-conjugates and their use as initiator molecules for transcription priming

  摘要：

  我们合成了两种与生物素化腺苷部分相连的鸟苷衍生物，采用了两种不同的策略，一种是在固相上进行合成步骤，另一种则完全在溶液中进行。合成的衍生物在转录引物实验中被证明可以作为引发分子使用。引入效率被确定为大约2%。尽管这个值相对较低，但在选择实验中使用其中任何一种分子似乎都是合理的。基本上，可以生成序列复杂度为10^15到10^16的RNA文库。用我们的引发分子标记这样的文库仍然可以产生10^13到10^14个标记/功能化序列，从而提供足够的序列空间用于选择。

  DOI：

  10.1039/b716151d

文献信息

• Synthesis of guanosine 5′-conjugates and their use as initiator molecules for transcription priming
  作者：Jörn Wolf、Valeska Dombos、Bettina Appel、Sabine Müller

  DOI：10.1039/b716151d

  日期：——

  We have synthesised two guanosine derivatives that are linked to biotinylated adenosine moieties by using two different strategies, one that includes synthetic steps on the solid phase and another one that is performed entirely in solution. The synthesised derivatives were shown to function as initiator molecules in transcription priming experiments. The incorporation efficiency was determined to be approximately 2%. Even though this value is rather low, the use of either molecule in selection experiments seems reasonable. Basically, RNA libraries with sequence complexities of 1015 to 1016 can be generated. Labelling of such a library with our initiator molecule would still produce 1013 to 1014 labelled/functionalised sequences, and thus sufficient sequence space for selection.

  我们合成了两种与生物素化腺苷部分相连的鸟苷衍生物，采用了两种不同的策略，一种是在固相上进行合成步骤，另一种则完全在溶液中进行。合成的衍生物在转录引物实验中被证明可以作为引发分子使用。引入效率被确定为大约2%。尽管这个值相对较低，但在选择实验中使用其中任何一种分子似乎都是合理的。基本上，可以生成序列复杂度为10^15到10^16的RNA文库。用我们的引发分子标记这样的文库仍然可以产生10^13到10^14个标记/功能化序列，从而提供足够的序列空间用于选择。