1-[(2R,4S,5R)-5-[(E)-2-[[(2R,3S,5R)-2-[[bis(4-methoxyphenyl)-phenylmethoxy]methyl]-5-(5-methyl-2,4-dioxopyrimidin-1-yl)oxolan-3-yl]oxy-(2-chlorophenoxy)-oxidophosphaniumyl]ethenyl]-4-hydroxyoxolan-2-yl]-5-methylpyrimidine-2,4-dione | 182810-28-2

• 分子结构分类: 有机化合物 - 苯类化合物 - 三苯基化合物
• 英文名称: 1-[(2R,4S,5R)-5-[(E)-2-[[(2R,3S,5R)-2-[[bis(4-methoxyphenyl)-phenylmethoxy]methyl]-5-(5-methyl-2,4-dioxopyrimidin-1-yl)oxolan-3-yl]oxy-(2-chlorophenoxy)-oxidophosphaniumyl]ethenyl]-4-hydroxyoxolan-2-yl]-5-methylpyrimidine-2,4-dione
• CAS: 182810-28-2
• 化学式: C₄₈H₄₈ClN₄O₁₃P
• 分子量: 955.355
• InChiKey: JBLAFJXPCZTFAS-NRERFRSWSA-N

计算性质

• 辛醇/水分配系数(LogP)：
  5.1
• 重原子数：
  67
• 可旋转键数：
  16
• 环数：
  8.0
• sp3杂化的碳原子比例：
  0.29
• 拓扑面积：
  207
• 氢给体数：
  3
• 氢受体数：
  13

反应信息

• 作为反应物：
  描述：

  2-cyanoethyl N,N-diisopropylchlorophosphoramidite 、 1-[(2R,4S,5R)-5-[(E)-2-[[(2R,3S,5R)-2-[[bis(4-methoxyphenyl)-phenylmethoxy]methyl]-5-(5-methyl-2,4-dioxopyrimidin-1-yl)oxolan-3-yl]oxy-(2-chlorophenoxy)-oxidophosphaniumyl]ethenyl]-4-hydroxyoxolan-2-yl]-5-methylpyrimidine-2,4-dione 生成
  参考文献：
  名称：

  5'-脱氧-5'-亚甲基膦酸酯连接的胸苷寡核苷酸的合成及初步生化研究

  摘要：

  合成具有5'-脱氧-5'-亚甲基膦酸酯膦酸酯间键的胸苷脱氧寡核苷酸。相对于天然DNA，这些寡聚体具有核酸酶抗性并形成稳定性降低的双链体。

  DOI：

  10.1016/0040-4039(96)01380-9
• 作为产物：
  描述：

  3'-O-(叔丁基二甲基硅烷基)胸苷 在 N-甲基咪唑 、 盐酸 、 2,4,6-三异丙基苯磺酰氯 、 四丁基高氯酸铵 、 四甲基胍 、 2-硝基苯甲醛肟 作用下， 以 吡啶 、 甲醇 、 二氯甲烷 为溶剂， 生成 1-[(2R,4S,5R)-5-[(E)-2-[[(2R,3S,5R)-2-[[bis(4-methoxyphenyl)-phenylmethoxy]methyl]-5-(5-methyl-2,4-dioxopyrimidin-1-yl)oxolan-3-yl]oxy-(2-chlorophenoxy)-oxidophosphaniumyl]ethenyl]-4-hydroxyoxolan-2-yl]-5-methylpyrimidine-2,4-dione
  参考文献：
  名称：

  5'-脱氧-5'-亚甲基膦酸酯连接的胸苷寡核苷酸的合成及初步生化研究

  摘要：

  合成具有5'-脱氧-5'-亚甲基膦酸酯膦酸酯间键的胸苷脱氧寡核苷酸。相对于天然DNA，这些寡聚体具有核酸酶抗性并形成稳定性降低的双链体。

  DOI：

  10.1016/0040-4039(96)01380-9

文献信息

• Synthesis and preliminary biochemical studies with 5′-deoxy-5′-methylidyne phosphonate linked thymidine oligonucleotides
  作者：Zhengyun Zhao、Marvin H. Caruthers

  DOI：10.1016/0040-4039(96)01380-9

  日期：1996.8

  Thymidine deoxyoligonucleotides having a 5′-deoxy-5′-methylidyne phosphonate internucleotide linkage were synthesized. Relative to natural DNA, these oligomers were nuclease resistant and formed duplexes with reduced stability.

  合成具有5'-脱氧-5'-亚甲基膦酸酯膦酸酯间键的胸苷脱氧寡核苷酸。相对于天然DNA，这些寡聚体具有核酸酶抗性并形成稳定性降低的双链体。