4-N-benzoyl-5-bromo-5'-O-(4,4'-dimethoxytrityl)-deoxycytidine | 100360-44-9

• 分子结构分类: 有机化合物 - 苯类化合物 - 三苯基化合物
• 英文名称: 4-N-benzoyl-5-bromo-5'-O-(4,4'-dimethoxytrityl)-deoxycytidine
• CAS: 100360-44-9
• 化学式: C₃₇H₃₄BrN₃O₇
• 分子量: 712.597
• InChiKey: QUWBDSIHSCSZED-WIHCDAFUSA-N

计算性质

• 辛醇/水分配系数(LogP)：
  5.93
• 重原子数：
  48.0
• 可旋转键数：
  11.0
• 环数：
  6.0
• sp3杂化的碳原子比例：
  0.22
• 拓扑面积：
  121.14
• 氢给体数：
  2.0
• 氢受体数：
  9.0

反应信息

• 作为反应物：
  描述：

  4-N-benzoyl-5-bromo-5'-O-(4,4'-dimethoxytrityl)-deoxycytidine 、 双(二异丙基氨基)(2-氰基乙氧基)膦 在 四氮唑 、 二异丙胺 作用下， 以 二氯甲烷 为溶剂， 反应 5.0h， 以86%的产率得到5-溴-dc cep
  参考文献：
  名称：

  DNA双链体和形成三链体的寡脱氧核苷酸结合了修饰的核苷，形成稳定且选择性的三链体†

  摘要：

  我们以前曾报道过含有非天然碱基三联体G-PPI·C3的DNA三链体，其中 生产者价格指数 是吲哚融合的 胞嘧啶 衍生物掺入DNA双链体中，C3是由三聚体形成的三链体形成寡核苷酸（TFO）的无碱基位点 丙烯链接器。在这项研究中，我们开发了一个新的非自然基础三合会A-ψ·C R1，其中ψ和C R1 是基本部分 2'-脱氧伪神经杜里定 和5-取代的 脱氧胞苷， 分别。我们检查了R1的几个吸电子取代基，发现5-溴胞嘧啶 （碳溴）可以选择性地识别ψ。此外，我们开发了新的生产者价格指数 衍生物， PPI我，在吲哚环上具有一个甲基，以便在结合了各种Watson-Crick碱基对的DNA双链体之间实现选择性的三链体形成，例如 TA， CG， -， 和 G-PPI我以及包含T，C， 碳溴和C3。我们使用紫外熔融和凝胶迁移率迁移分析研究了这些双链体和TFO之间的选择性三链体形成。

  DOI：

  10.1039/c1ob06411h
• 作为产物：
  描述：

  2'-脱氧胞嘧啶核苷 在 吡啶 、 N-溴代丁二酰亚胺(NBS) 、 溶剂黄146 作用下， 以 N,N-二甲基甲酰胺 为溶剂， 反应 20.33h， 生成 4-N-benzoyl-5-bromo-5'-O-(4,4'-dimethoxytrityl)-deoxycytidine
  参考文献：
  名称：

  DNA双链体和形成三链体的寡脱氧核苷酸结合了修饰的核苷，形成稳定且选择性的三链体†

  摘要：

  我们以前曾报道过含有非天然碱基三联体G-PPI·C3的DNA三链体，其中 生产者价格指数 是吲哚融合的 胞嘧啶 衍生物掺入DNA双链体中，C3是由三聚体形成的三链体形成寡核苷酸（TFO）的无碱基位点 丙烯链接器。在这项研究中，我们开发了一个新的非自然基础三合会A-ψ·C R1，其中ψ和C R1 是基本部分 2'-脱氧伪神经杜里定 和5-取代的 脱氧胞苷， 分别。我们检查了R1的几个吸电子取代基，发现5-溴胞嘧啶 （碳溴）可以选择性地识别ψ。此外，我们开发了新的生产者价格指数 衍生物， PPI我，在吲哚环上具有一个甲基，以便在结合了各种Watson-Crick碱基对的DNA双链体之间实现选择性的三链体形成，例如 TA， CG， -， 和 G-PPI我以及包含T，C， 碳溴和C3。我们使用紫外熔融和凝胶迁移率迁移分析研究了这些双链体和TFO之间的选择性三链体形成。

  DOI：

  10.1039/c1ob06411h