2'-O-(pivaloyloxymethyl)-5'-O,N6-bis(4-methoxytrityl)adenosine | 1259402-33-9

• 分子结构分类: 有机化合物 - 苯类化合物 - 三苯基化合物
• 英文名称: 2'-O-(pivaloyloxymethyl)-5'-O,N6-bis(4-methoxytrityl)adenosine
• 英文别名: 2'-O-(pivaloyloxymethyl)-5'-O,N⁶-bis(4-methoxytrityl)adenosine
• CAS: 1259402-33-9
• 化学式: C₅₆H₅₅N₅O₈
• 分子量: 926.081
• InChiKey: XAYIREBHPXZDND-PDPADYNLSA-N

计算性质

• 辛醇/水分配系数(LogP)：
  9.45
• 重原子数：
  69.0
• 可旋转键数：
  17.0
• 环数：
  9.0
• sp3杂化的碳原子比例：
  0.25
• 拓扑面积：
  148.31
• 氢给体数：
  2.0
• 氢受体数：
  13.0

反应信息

• 作为产物：
  描述：

  腺苷 在 吡啶 、 sodium hydride 作用下， 以 四氢呋喃 为溶剂， 反应 6.0h， 生成 2'-O-(pivaloyloxymethyl)-5'-O,N6-bis(4-methoxytrityl)adenosine 、 5'-O,N⁶-bis(4-methoxytrityl)-3'-O-[(pivaloyloxy)methyl]adenosine
  参考文献：
  名称：

  2-5A的可生物降解和热保护的Dinucleoside-2'，5'-单磷酸盐前药模型的合成和脱保护。

  摘要：

  已准备好保护性的2'，5'-单磷酸二核苷，以开发2-5A的前药策略。在pH 7.5和37°C下，通过HPLC除去酶和热不稳定的4-（乙酰硫基）-2-（乙氧基羰基）-3-氧代-2-甲基丁基磷酸保护基和酶不稳定的3'-O-新戊酰氧基甲基基团完全保护的二聚腺苷2'，5'-单磷酸腺苷1用作2-5A的模型化合物。观察到所需的未保护的2'，3'-O-异丙基亚氨腺苷-2'，5'-单磷酸酯（9）作为主要产物积累。既未检测到2'，5'-竞争性异构化为3'，5'-键，也未检测到P-O5'键断裂。磷酸保护基的清除速度比3'-O-保护的清除速度快，因此，相邻3'-O的攻击速度更快

  DOI：

  10.1002/cbdv.201700220

文献信息

• Synthesis and Enzymatic Deprotection of Biodegradably Protected Dinucleoside-2′,5′-monophosphates: 3-(Acetyloxy)-2,2-bis(ethoxycarbonyl)propyl Phosphoesters of 3′-O-(Acyloxymethyl)adenylyl-2′,5′-adenosines
  作者：Emilia Kiuru、Mikko Ora、Leonid Beigelman、Lawrence Blatt、Harri Lönnberg

  DOI：10.1002/cbdv.201000288

  日期：2011.2

  first step towards a viable prodrug strategy for short oligoribonucleotides, such as 2-5A and its congeners, adenylyl-2',5'-adenosines bearing a 3-(acetyloxy)-2,2-bis(ethoxycarbonyl)propyl group at the phosphate moiety, and an (acetyloxy)methyl- or a (pivaloyloxy)methyl-protected 3'-OH group of the 2'-linked nucleoside have been prepared. The enzyme-triggered removal of these protecting groups by hog

  迈向针对短寡核糖核苷酸（例如2-5A及其同类物）的可行前药策略的第一步，是在末端带有3-（乙酰氧基）-2,2-双（乙氧基羰基）丙基的腺苷基2'，5'-腺苷制备磷酸酯部分，并制备2'-连接核苷的（乙酰氧基）甲基或（新戊酰氧基）甲基保护的3'-OH基。已经研究了通过猪肝脏羧酯酶在pH 7.5和37°下用酶触发的方法去除这些保护基。事实证明，（乙酰氧基）甲基对于3'-O-保护来说太不稳定了，它的去除速度比磷酸酯保护基要快，这导致2'，5'-到3'，5'-异构化。核苷间磷酸酯键。另外，原料意外地转化为5'-O-乙酰化衍生物。（新戊酰氧基）甲基似乎更适合该目的。完全脱保护的2'，5'-ApA作为主要产物积累，尽管即使在这种情况下，也会发生原料的异构化。