5'-O-(4,4'-dimethoxytrityl)-N¹-(β-D-2'-deoxyribosyl)-5-methylpyrimidin-2-one | 125258-59-5

• 分子结构分类: 有机化合物 - 苯类化合物 - 三苯基化合物
• 英文名称: 5'-O-(4,4'-dimethoxytrityl)-N¹-(β-D-2'-deoxyribosyl)-5-methylpyrimidin-2-one
• 英文别名: 1-[5-O-(4,4'-dimethoxytrityl)-2-deoxy-β-D-ribofuranosyl]-5-methyl-2-pyrimidinone；1-[(2R,4S,5R)-5-[[bis(4-methoxyphenyl)-phenylmethoxy]methyl]-4-hydroxyoxolan-2-yl]-5-methylpyrimidin-2-one
• CAS: 125258-59-5
• 化学式: C₃₁H₃₂N₂O₆
• 分子量: 528.605
• InChiKey: ZZTYBTYDZNRSBW-ZGIBFIJWSA-N

物化性质

• 沸点：
  692.7±65.0 °C(Predicted)
• 密度：
  1.23±0.1 g/cm3(Predicted)

计算性质

• 辛醇/水分配系数(LogP)：
  4.23
• 重原子数：
  39.0
• 可旋转键数：
  9.0
• 环数：
  5.0
• sp3杂化的碳原子比例：
  0.29
• 拓扑面积：
  92.04
• 氢给体数：
  1.0
• 氢受体数：
  8.0

反应信息

• 作为反应物：
  描述：

  5'-O-(4,4'-dimethoxytrityl)-N¹-(β-D-2'-deoxyribosyl)-5-methylpyrimidin-2-one 在 4-二甲氨基吡啶 、 溶剂黄146 、 N,N'-二环己基碳二亚胺 作用下， 以 1,4-二氧六环 、 水 为溶剂， 反应 4.0h， 生成 1-(3-O-levulinyl-2-deoxy-β-D-ribofuranosyl)-5-methyl-2-pyrimidinone
  参考文献：
  名称：

  含（6–4）个光产物的DNA的碱降解机理†

  摘要：

  （6–4）光产物是紫外线在DNA中产生的主要受损碱基之一。已知该损伤是碱不稳定的，当用热碱处理紫外线照射的DNA时，在其部位会发生链断裂。我们已经分析了通过碱处理得到的产品。二磷酸核苷通过HPLC，NMR光谱和质谱分析，含有（6–4）个光产物。我们先前发现5'组分的N3-C4键通过弱碱处理而水解，并且本研究表明以下反应是3'组分上糖苷键的水解。即使不存在3'侧翼核苷酸，该成分的糖部分也会丢失。对于二聚体和三聚体，还观察到糖苷键水解。5-甲基-2-嘧啶酮，它被用作（6–4）光产物的3'成分的类似物，并阐明了其机理。最后，对四聚物d（GT（6–4）TC）进行碱处理，得到了2'-脱氧胞苷5'-单磷酸酯， 尽管 2'-脱氧鸟苷3'-单磷酸酯未检测到。该结果证明了（6–4）光产物3'组分上糖苷键的水解以及随后的β消除导致链断裂。还显示出，杜瓦价异构体3'组分的糖苷键比（6-4）光产物的碱不稳定。

  DOI：

  10.1039/c2ob06966k
• 作为产物：
  描述：

  3',5'-O-bis(triethylsilyl)-N¹-(β-D-2'-deoxyribosyl)-5-methylpyrimidin-2-one 在 吡啶 、 溶剂黄146 作用下， 以 四氢呋喃 为溶剂， 反应 9.0h， 生成 5'-O-(4,4'-dimethoxytrityl)-N¹-(β-D-2'-deoxyribosyl)-5-methylpyrimidin-2-one
  参考文献：
  名称：

  Facile Synthesis of a Fluorescent Deoxycytidine Analogue Suitable for Probing the RecA Nucleoprotein Filament

  摘要：

  We report the synthesis of the fluorescent 2'-deoxycytidine analogue 5-methylpyrimidin-2-one nucleoside, its incorporation at three specified sites in a single 60-nucleotide DNA molecule, and the use of its total and polarized intrinsic fluorescence to characterize RecA-DNA complexes. [reaction: see text]

  DOI：

  10.1021/ol0167863

文献信息

• CONNOLLY, BERNARD A.;NEWMAN, PATRICK C., NUCL. ACIDS RES., 17,(1989) N3, C. 4957-4974
  作者：CONNOLLY, BERNARD A.、NEWMAN, PATRICK C.

  DOI：——

  日期：——