(2R,3S,5R)-5-(4-(4-(((((9H-fluoren-9-yl)methoxy)carbonyl)amino)methyl)benzamido)-2-oxopyrimidin-1(2H)-yl)-2-((bis(4-methoxyphenyl)(phenyl)methoxy)methyl)tetrahydrofuran-3-yl 4-oxopentanoate | 1125650-99-8

• 分子结构分类: 有机化合物 - 苯类化合物 - 三苯基化合物
• 英文名称: (2R,3S,5R)-5-(4-(4-(((((9H-fluoren-9-yl)methoxy)carbonyl)amino)methyl)benzamido)-2-oxopyrimidin-1(2H)-yl)-2-((bis(4-methoxyphenyl)(phenyl)methoxy)methyl)tetrahydrofuran-3-yl 4-oxopentanoate
• CAS: 1125650-99-8
• 化学式: C₅₈H₅₄N₄O₁₁
• 分子量: 983.087
• InChiKey: GRULWVXTWFPWBE-CCCGGDKUSA-N

计算性质

• 辛醇/水分配系数(LogP)：
  9.13
• 重原子数：
  73.0
• 可旋转键数：
  19.0
• 环数：
  9.0
• sp3杂化的碳原子比例：
  0.24
• 拓扑面积：
  182.61
• 氢给体数：
  2.0
• 氢受体数：
  13.0

反应信息

• 作为反应物：
  描述：

  (2R,3S,5R)-5-(4-(4-(((((9H-fluoren-9-yl)methoxy)carbonyl)amino)methyl)benzamido)-2-oxopyrimidin-1(2H)-yl)-2-((bis(4-methoxyphenyl)(phenyl)methoxy)methyl)tetrahydrofuran-3-yl 4-oxopentanoate 在 吡啶 、 三乙基硅烷 、 N-羟基丁二酰亚胺 、 1,8-二氮杂双环[5.4.0]十一碳-7-烯 、 N,N'-二环己基碳二亚胺 作用下， 以 二氯甲烷 、 乙腈 为溶剂， 反应 2.67h， 生成 (2R,3S,5R)-5-(4-(4-((2-(4-(((2-((((9H-fluoren-9-yl)methoxy)carbonyl)(methyl)amino)ethoxy)carbonyl)oxy)phenyl)acetamido)methyl)benzamido)-2-oxopyrimidin-1(2H)-yl)-2-((bis(4-methoxyphenyl)(phenyl)methoxy)methyl)tetrahydrofuran-3-yl 4-oxopentanoate
  参考文献：
  名称：

  Amidite for synthesizing modified nucleic acid and method for synthesizing modified nucleic acid

  摘要：

  该披露提供了一种优良的胺酰胺，用于合成修饰的核酸，该胺酰胺使其中的保护基在适度条件下得以去除，从而稳定地产生含有羟基的修饰核酸。该披露还提供了一种使用该胺酰胺合成修饰核酸的方法。具体地，用于合成修饰核酸的胺酰胺由通式（I）表示：其中X代表一种碱基，Y代表一种取代基，Z代表用于保护取代基中的羟基的保护基，Q代表氢原子、羟基或由保护基保护的羟基中的一种，其中保护基可以在无极性溶剂中去除，当保护基被去除时，羟基出现在取代基中。

  公开号：

  US07910726B2
• 作为产物：
  描述：

  9H-fluoren-9-ylmethyl N-[(4-carbonochloridoylphenyl)methyl]carbamate 在 吡啶 、 4-二甲氨基吡啶 、 三甲基氯硅烷 、 N,N'-二环己基碳二亚胺 作用下， 反应 12.0h， 生成 (2R,3S,5R)-5-(4-(4-(((((9H-fluoren-9-yl)methoxy)carbonyl)amino)methyl)benzamido)-2-oxopyrimidin-1(2H)-yl)-2-((bis(4-methoxyphenyl)(phenyl)methoxy)methyl)tetrahydrofuran-3-yl 4-oxopentanoate
  参考文献：
  名称：

  Nucleic acid synthesizing dimer amidite and nucleic acid synthesizing method

  摘要：

  提供一种优质的二聚体酰胺，可进行纯化，最好是其保护基在温和条件下可被去除，并提供一种使用该二聚体酰胺合成核酸的方法，所述二聚体酰胺具有以下一般式（1）所代表的结构，以及包括对二聚体酰胺进行缩合反应的核酸合成方法： 在一般式（1）中，R1和R2分别独立地代表从一般式（2）到（4）和结构式（12）到（15）中选择的任一组，并且排除R1和R2分别代表结构式（12）的化合物： 并且在一般式（2）到（4）中，R3代表以下结构式（16）到（25）中所代表的任一组：

  公开号：

  US08889843B2