N-[[5-[6-(4-methylpiperazin-1-yl)-1H-benzimidazol-2-yl]-1H-benzimidazol-2-yl]methyl]-N'-[[6-[6-(4-methylpiperazin-1-yl)-1H-benzimidazol-2-yl]-1H-benzimidazol-2-yl]methyl]heptanediamide | 1072153-95-7

• 分子结构分类: 有机化合物 - 有机杂环化合物 - 二嗪烷类
• 英文名称: N-[[5-[6-(4-methylpiperazin-1-yl)-1H-benzimidazol-2-yl]-1H-benzimidazol-2-yl]methyl]-N'-[[6-[6-(4-methylpiperazin-1-yl)-1H-benzimidazol-2-yl]-1H-benzimidazol-2-yl]methyl]heptanediamide
• 英文别名: N,N'-bis[[6-[6-(4-methylpiperazin-1-yl)-1H-benzimidazol-2-yl]-1H-benzimidazol-2-yl]methyl]heptanediamide
• CAS: 1072153-95-7
• 化学式: C₄₇H₅₄N₁₄O₂
• 分子量: 847.038
• InChiKey: QLQUKABRBPSTSM-UHFFFAOYSA-N

计算性质

• 辛醇/水分配系数(LogP)：
  4.5
• 重原子数：
  63
• 可旋转键数：
  14
• 环数：
  10.0
• sp3杂化的碳原子比例：
  0.36
• 拓扑面积：
  186
• 氢给体数：
  6
• 氢受体数：
  10

反应信息

• 作为产物：
  描述：

  (6-(6-(4-methylpiperazin-1-yl)-1H-benzo[d]imidazol-2-yl)-1H-benzo[d]imidazol-2-yl)methylamine tetrahydrochloride 、 1,7-bis(pentafluorophenyl)heptanedioate 在 三乙胺 作用下， 以 N,N-二甲基甲酰胺 为溶剂， 以51%的产率得到N-[[5-[6-(4-methylpiperazin-1-yl)-1H-benzimidazol-2-yl]-1H-benzimidazol-2-yl]methyl]-N'-[[6-[6-(4-methylpiperazin-1-yl)-1H-benzimidazol-2-yl]-1H-benzimidazol-2-yl]methyl]heptanediamide
  参考文献：
  名称：

  Synthesis and properties of a symmetric dimeric bisbenzimidazole, a DNA-specific ligand

  摘要：

  合成的二聚双苯并咪唑 DB(5) 在 DNA 复合物内的蓝色光谱区域（λem 476 nm）中发出荧光。DB(5) 与双链 DNA 结合，可对人类和植物（亚麻）染色体进行不同染色。根据初步数据，与 DAPI 和 Hoechst 33258 染料相比，DB(5) 染色体染色的对比度更强。研究还发现，DB(5) 是 HIV-1 整合酶在 3′处理反应中的体外抑制剂。

  DOI：

  10.1134/s1068162008020180