5'-O-[bis(4-methoxyphenyl)(phenyl)methyl]-3'-O-[(2R,5R)-3-methyl-5-phenyl-1,3,2-oxazaphospholidin-2-yl]thymidine | 896723-51-6

• 分子结构分类: 有机化合物 - 苯类化合物 - 三苯基化合物
• 英文名称: 5'-O-[bis(4-methoxyphenyl)(phenyl)methyl]-3'-O-[(2R,5R)-3-methyl-5-phenyl-1,3,2-oxazaphospholidin-2-yl]thymidine
• CAS: 896723-51-6
• 化学式: C₄₀H₄₂N₃O₈P
• 分子量: 723.763
• InChiKey: RDASMFGKEAQMOF-GWGOPYDMSA-N

计算性质

• 辛醇/水分配系数(LogP)：
  6.47
• 重原子数：
  52.0
• 可旋转键数：
  12.0
• 环数：
  7.0
• sp3杂化的碳原子比例：
  0.3
• 拓扑面积：
  113.48
• 氢给体数：
  1.0
• 氢受体数：
  10.0

反应信息

• 作为反应物：
  描述：

  5'-O-[bis(4-methoxyphenyl)(phenyl)methyl]-3'-O-[(2R,5R)-3-methyl-5-phenyl-1,3,2-oxazaphospholidin-2-yl]thymidine 在 N-氰甲基吡咯烷鎓三氟甲烷磺酸盐 作用下， 以 氘代乙腈 、 乙腈 为溶剂， 反应 4.0h， 生成 5'-O-[bis(4-methoxyphenyl)(phenyl)methyl]-3'-O-[(2S,5R)-3-methyl-5-phenyl-1,3,2-oxazaphospholidin-2-yl]thymidine
  参考文献：
  名称：

  以双环氧氮杂磷脂为单体单元固相合成立体规则寡聚脱氧核糖核苷硫代磷酸酯

  摘要：

  核苷 3'-O-双环 oxazaphospholidine 衍生物被设计为单体单元，用于固相合成有规立构寡脱氧核糖核苷硫代磷酸酯 (PS-ODNs)。适当设计的核苷 3'-O-双环 oxazaphospholidine 衍生物的反式异构体仅通过相应受保护核苷的 3'-OH 与 2-氯-1,3,2-oxazaphospholidine 衍生物之间的反应生成。得到的反式-氧氮杂磷脂异构体在构型上是稳定的，在固体载体上缩合过程中，在酸性活化剂存在下差向异构化不会损害它们的非对映纯度。因此，通过使用氧氮杂磷脂单体和酸性活化剂形成 (Rp)- 和 (Sp)-硫代磷酸酯核苷酸间键的过程中，非对映纯度没有任何损失（非对映选择性 > 或 = 99:1）。此外，从头分子轨道计算表明，氧氮杂磷脂衍生物的差向异构化最有可能通过 N-质子化加速的边缘反转过程进行。计算不仅合理化了本研究中观察到的环结构与 oxazaphospholidines

  DOI：

  10.1021/ja805780u
• 作为产物：
  描述：

  盐穗草碱 在 N-甲基吗啉 、 三乙胺 、 三氯化磷 作用下， 以 四氢呋喃 、 甲苯 为溶剂， 生成 5'-O-[bis(4-methoxyphenyl)(phenyl)methyl]-3'-O-[(2R,5R)-3-methyl-5-phenyl-1,3,2-oxazaphospholidin-2-yl]thymidine
  参考文献：
  名称：

  一种用于立体控制合成寡核苷硫代磷酸酯的氧氮杂磷脂方法

  摘要：

  描述了使用核苷 3'-O-oxazaphospholidine 衍生物作为单体单元的低聚脱氧核糖核苷硫代磷酸酯 (PS-ODNs) 的立体控制合成。2-Chloro-1,3,2-oxazaphospholidine 衍生物由六种对映纯的 1,2-氨基醇制备而成，用于 5'-O-保护核苷的磷酸化反应。对这些反应的详细研究表明，该反应的非对映选择性取决于对映体纯 1,2-氨基醇的结构、反应温度和用作 HCl 清除剂的胺。此外，还对 2-氯氧氮杂磷脂衍生物进行了从头算分子轨道计算，以阐明这些非对映选择性磷酸化反应的机理。发现磷原子上的 2-氯-5-苯基氧氮杂磷脂衍生物的 LUMO 几乎与 P-Cl 键正交。该 LUMO 可能参与主要保留 P 构型的磷酸化反应。开发了一系列二烷基（氰甲基）铵盐，并将其用作非对映纯核苷 3'-O-oxazaphospholidines 与 3'-O-保护的核苷的缩合

  DOI：

  10.1021/ja034502z

文献信息

• Stereoselective synthesis of dinucleoside boranophosphates by an oxazaphospholidine method
  作者：Takeshi Wada、Yukihiro Maizuru、Mamoru Shimizu、Natsuhisa Oka、Kazuhiko Saigo

  DOI：10.1016/j.bmcl.2006.03.076

  日期：2006.6

  A stereoselective synthesis of dinucleoside boranophosphates by using nucleoside 3'-oxazaphospholidine derivatives is described. The diastereoselectivity of the internucleotidic bond formation reactions varied with the nucleobase used. (Rp)- and (Sp)-dithymidine boranophosphates were synthesized with excellent diastereoselectivity both in solution and on a solid-support, whereas a loss of diastereopurity was observed for the 2'-deoxycytidine derivative having an unprotected nucleobase amino group. On the other hand, complete chemoselectivity of the 3'-oxazaphospholidine derivatives toward hydroxy groups over amino groups was serendipitously found during the study. This unique chemo selectivity of the 3'-oxazaphospholidine derivatives was investigated by comparing them with the conventional nucleoside 3'-phosphoramidite. (c) 2006 Elsevier Ltd. All rights reserved.