在
天然产物家族中,聚酮化合物在
天然产物类文库的组合
生物合成方面表现出最大的潜力。尽管该领域最近的研究提供了许多机制方面的启示,但在实现组合
生物合成的全部潜力之前,仍然需要对动力学和底物耐受性有基本的了解。我们开发了一套新的
化学探针,用于研究聚酮合酶的酮还原酶结构域。使用 pikromycin 模块 2 (PikKR2) 的酮还原酶作为模型系统验证了这种基于
化学工具的方法。三酮底物模拟物12和13旨在增加稳定性(结合不可
水解的
硫醚键)并最大限度地减少非必需的功能(截断
磷酸泛酰
巯基乙胺臂)。PikKR2 还原产物特性以及稳态动力学参数由合成标准品的 LC-MS/MS 分析和
NADPH 消耗测定的组合确定。的d -羟基产物是与互补的
生物化学和
分子生物学方法
生物信息学分析和结果相一致。与之前研究中广泛使用的底物双酮63和反式十酮64 相比,底物12和13 的K M低 2-10 倍值(分别为 2.4