3'-deoxy-5'-O-dimethoxytrityl-3'-S-(5-nitropyridyl-2-disulfanyl)thymidine | 195967-03-4

• 分子结构分类: 有机化合物 - 苯类化合物 - 三苯基化合物
• 英文名称: 3'-deoxy-5'-O-dimethoxytrityl-3'-S-(5-nitropyridyl-2-disulfanyl)thymidine
• 英文别名: 1-[(2R,4S,5R)-5-[[bis(4-methoxyphenyl)-phenylmethoxy]methyl]-4-[(5-nitropyridin-2-yl)disulfanyl]oxolan-2-yl]-5-methylpyrimidine-2,4-dione
• CAS: 195967-03-4
• 化学式: C₃₆H₃₄N₄O₈S₂
• 分子量: 714.82
• InChiKey: XJDLTGFBBLJNFH-IALKSABESA-N

计算性质

• 辛醇/水分配系数(LogP)：
  5.7
• 重原子数：
  50
• 可旋转键数：
  12
• 环数：
  6.0
• sp3杂化的碳原子比例：
  0.25
• 拓扑面积：
  196
• 氢给体数：
  1
• 氢受体数：
  11

反应信息

• 作为反应物：
  描述：

  3'-deoxy-5'-O-dimethoxytrityl-3'-S-(5-nitropyridyl-2-disulfanyl)thymidine 在 吡啶 、 2,4,6-三甲基苯磺酰氯 、 triethylamine tris(hydrogen fluoride) 、 三乙胺 作用下， 以 四氢呋喃 、 二氯甲烷 、 水 为溶剂， 反应 18.5h， 生成
  参考文献：
  名称：

  3'-5'和3'-6'二硫键连接的寡核苷酸的合成，动态组合化学和PCR扩增

  摘要：

  合成了通过3'-5'或3'-6'连接的二硫二胸苷，并通过磷酸三酯和亚磷酰胺固相寡核苷酸合成方法将其掺入寡核苷酸。在硫醇和寡核苷酸的存在下，二硫键被裂解并可逆地形成。在存在巯基乙醇的情况下，该链接显示出对指定模板的序列适应性。在聚合酶链反应（PCR）中，聚合酶可以耐受人工的3'-5'和3'-6'二硫键。通过使用测序分析，我们显示了单个突变经常在PCR的扩增产物中随机发生。

  DOI：

  10.1002/anie.201405761
• 作为产物：
  描述：

  1-(2'-deoxy-3'-O-mesyl-5'-O-4,4'-dimethoxytrityl-β-D-threo-pentofuranosyl)-thymine 在 sodium hydroxide 、 溶剂黄146 作用下， 以 二氯甲烷 、 N,N-二甲基甲酰胺 为溶剂， 生成 3'-deoxy-5'-O-dimethoxytrityl-3'-S-(5-nitropyridyl-2-disulfanyl)thymidine
  参考文献：
  名称：

  Dinucleoside Monophosphate Analogues Containing Disulfide Linkages

  摘要：

  Two dinucleoside monophosphate analogues containing disulfide linkages (1 and 2) have been prepared for incorporation into oligonucleotides. The modified oligomers will be tested for their potential as antisense agents.

  DOI：

  10.1080/07328319708006228