5-(4-methylpiperazin-1-yl)-2-[2'-(4-{3-aminopropyloxy}-3-methoxyphenyl)-5'-benzimidazolyl]benzimidazole | 912816-65-0

• 分子结构分类: 有机化合物 - 有机杂环化合物 - 二嗪烷类
• 英文名称: 5-(4-methylpiperazin-1-yl)-2-[2'-(4-{3-aminopropyloxy}-3-methoxyphenyl)-5'-benzimidazolyl]benzimidazole
• CAS: 912816-65-0
• 化学式: C₂₉H₃₃N₇O₂
• 分子量: 511.627
• InChiKey: FCUJMGXRTNKBNQ-UHFFFAOYSA-N

计算性质

• 辛醇/水分配系数(LogP)：
  4.26
• 重原子数：
  38.0
• 可旋转键数：
  8.0
• 环数：
  6.0
• sp3杂化的碳原子比例：
  0.31
• 拓扑面积：
  108.32
• 氢给体数：
  3.0
• 氢受体数：
  7.0

反应信息

• 作为反应物：
  描述：

  5-(4-methylpiperazin-1-yl)-2-[2'-(4-{3-aminopropyloxy}-3-methoxyphenyl)-5'-benzimidazolyl]benzimidazole 、 4-(N-马来酰亚胺基甲基)环己烷-1-羧酸琥珀酰亚胺酯 在 N,N-二异丙基乙胺 作用下， 以 N,N-二甲基甲酰胺 为溶剂， 反应 1.5h， 生成 4-(2,5-Dioxo-2,5-dihydro-pyrrol-1-ylmethyl)-cyclohexanecarboxylic acid (3-{2-methoxy-4-[5-(4-methyl-piperazin-1-yl)-1H,1'H-[2,5']bibenzoimidazolyl-2'-yl]-phenoxy}-propyl)-amide
  参考文献：
  名称：

  通过马来酰亚胺-硫醇偶联化学合成的共价键连接的DNA-双苯并咪唑共轭物实现三重螺旋稳定化。

  摘要：

  利用DMF /水作为异双功能交联剂，通过异双功能交联剂琥珀酰亚胺基4-（N-马来酰亚胺基甲基）环己烷-1-甲酸琥珀酰亚胺酯将Hoechst 33258的类似物BBZPNH2与14个核苷酸长的DNA序列进行束缚。溶剂产生有效稳定三螺旋的缀合物。将上述缀合物与具有14bp长的聚嘌呤-聚嘧啶序列的26bp长的双链（ds）DNA杂交，以形成嘧啶基序三螺旋。上述共轭物增加了两个转变的热稳定性，即，由共轭TFO形成的三重螺旋比由非三元螺旋制成的三重螺旋形成的三重螺旋至双螺旋增加了12℃，并且三重螺旋向单链的转变增加了16℃。结合的TFO。

  DOI：

  10.1016/j.bmc.2006.05.034
• 作为产物：
  描述：

  4-[3-N-(tert-butyloxycarbonyl)propyloxy]-5-methoxybenzaldehyde 在 盐酸 、 sodium metabisulfite 作用下， 以 乙醇 、 水 为溶剂， 反应 7.17h， 生成 5-(4-methylpiperazin-1-yl)-2-[2'-(4-{3-aminopropyloxy}-3-methoxyphenyl)-5'-benzimidazolyl]benzimidazole
  参考文献：
  名称：

  通过马来酰亚胺-硫醇偶联化学合成的共价键连接的DNA-双苯并咪唑共轭物实现三重螺旋稳定化。

  摘要：

  利用DMF /水作为异双功能交联剂，通过异双功能交联剂琥珀酰亚胺基4-（N-马来酰亚胺基甲基）环己烷-1-甲酸琥珀酰亚胺酯将Hoechst 33258的类似物BBZPNH2与14个核苷酸长的DNA序列进行束缚。溶剂产生有效稳定三螺旋的缀合物。将上述缀合物与具有14bp长的聚嘌呤-聚嘧啶序列的26bp长的双链（ds）DNA杂交，以形成嘧啶基序三螺旋。上述共轭物增加了两个转变的热稳定性，即，由共轭TFO形成的三重螺旋比由非三元螺旋制成的三重螺旋形成的三重螺旋至双螺旋增加了12℃，并且三重螺旋向单链的转变增加了16℃。结合的TFO。

  DOI：

  10.1016/j.bmc.2006.05.034