N-[5-[(2S,3R,4S,5R)-5-[[bis(4-methoxyphenyl)-phenylmethoxy]methyl]-3,4-dihydroxyoxolan-2-yl]-6-sulfanylidene-1H-pyrimidin-2-yl]benzamide | 1263312-56-6

• 分子结构分类: 有机化合物 - 苯类化合物 - 三苯基化合物
• 英文名称: N-[5-[(2S,3R,4S,5R)-5-[[bis(4-methoxyphenyl)-phenylmethoxy]methyl]-3,4-dihydroxyoxolan-2-yl]-6-sulfanylidene-1H-pyrimidin-2-yl]benzamide
• CAS: 1263312-56-6
• 化学式: C₃₇H₃₅N₃O₇S
• 分子量: 665.767
• InChiKey: IAKZDIGWJSYOLT-IGUZCVLDSA-N

计算性质

• 辛醇/水分配系数(LogP)：
  3.9
• 重原子数：
  48
• 可旋转键数：
  11
• 环数：
  6.0
• sp3杂化的碳原子比例：
  0.22
• 拓扑面积：
  163
• 氢给体数：
  4
• 氢受体数：
  9

反应信息

• 作为反应物：
  描述：

  N-[5-[(2S,3R,4S,5R)-5-[[bis(4-methoxyphenyl)-phenylmethoxy]methyl]-3,4-dihydroxyoxolan-2-yl]-6-sulfanylidene-1H-pyrimidin-2-yl]benzamide 在 咪唑 、 N-甲基咪唑 、 2,4,6-三甲基吡啶 作用下， 以 四氢呋喃 为溶剂， 反应 4.67h， 生成 N-[5-[(2S,3S,4R,5R)-5-[[bis(4-methoxyphenyl)-phenylmethoxy]methyl]-3-[tert-butyl(dimethyl)silyl]oxy-4-[2-cyanoethoxy-[di(propan-2-yl)amino]phosphanyl]oxyoxolan-2-yl]-6-sulfanylidene-1H-pyrimidin-2-yl]benzamide
  参考文献：
  名称：

  Synthesis and triplex-forming properties of oligonucleotides containing thio-substituted C-nucleoside 4-thiopseudoisocytidine

  摘要：

  We synthesized the 3'-phosphoramidite building block of 4-thiopseudoisocytidine (s(4)psi iC) and incorporated it into triplex-forming oligonucleotides (TF05). The results of thermal denaturation of triplexes incorporating s(4)psi iC showed that s(4)psi iC could be used as a nucleoside component of TFOs to increase the thermal stability of triplexes at pH 7. (C) 2010 Elsevier Ltd. All rights reserved.

  DOI：

  10.1016/j.tetlet.2010.11.065
• 作为产物：
  描述：

  在 吡啶 、 四丁基氟化铵 作用下， 以 四氢呋喃 为溶剂， 反应 8.0h， 生成 N-[5-[(2S,3R,4S,5R)-5-[[bis(4-methoxyphenyl)-phenylmethoxy]methyl]-3,4-dihydroxyoxolan-2-yl]-6-sulfanylidene-1H-pyrimidin-2-yl]benzamide
  参考文献：
  名称：

  Synthesis and triplex-forming properties of oligonucleotides containing thio-substituted C-nucleoside 4-thiopseudoisocytidine

  摘要：

  We synthesized the 3'-phosphoramidite building block of 4-thiopseudoisocytidine (s(4)psi iC) and incorporated it into triplex-forming oligonucleotides (TF05). The results of thermal denaturation of triplexes incorporating s(4)psi iC showed that s(4)psi iC could be used as a nucleoside component of TFOs to increase the thermal stability of triplexes at pH 7. (C) 2010 Elsevier Ltd. All rights reserved.

  DOI：

  10.1016/j.tetlet.2010.11.065