generation in the pharmaceutical industry. However, fragment screening collections are often predominantly populated with flat, 2D molecules. Herein, we describe a workflow for the design and synthesis of 56 3D disubstituted pyrrolidine and piperidine fragments that occupy under‐represented areas of fragment space (as demonstrated by a principal moments of inertia (PMI) analysis). A key, and unique, underpinning
基于片段的药物发现现已广泛应用于制药行业的先导化合物开发。然而,片段筛选集合通常主要由扁平的二维分子组成。在此,我们描述了设计和合成 56 个 3D 二取代
吡咯烷和
哌啶片段的工作流程,这些片段占据了片段空间中代表性不足的区域(如主惯性矩 (PMI) 分析所示)。该片段集合的一个关键且独特的基础设计特征是在合成和合成之前对片段形状和构象多样性进行评估(通过考虑比全局最小能量构象异构体的能量高出高达 1.5 kcal mol -1的构象)。也用于选择合成目标。3D 片段被设计为包含合适的合成手柄,以供将来的片段精加工使用。最后,通过将我们的 3D 片段与六个商业图书馆进行比较,很明显我们的馆藏具有较高的三维度和形状多样性。