缬氨酰腺苷酸 | 52435-65-1

• 分子结构分类: 有机化合物 - 核苷、核苷酸和类似物 - 嘌呤核苷酸
• 中文名称: 缬氨酰腺苷酸
• 中文别名: 5'-O-[{[(2S)-2-氨基-3-甲基丁酰]氧代}(羟基)磷基]腺苷
• 英文名称: valinyl adenylate
• 英文别名: Val-O-AMP；Val-AMP；[5']adenylic acid L-valine anhydride；[5']Adenylsaeure-L-valin-anhydrid；Valyl adenylate；[[(2R,3S,4R,5R)-5-(6-aminopurin-9-yl)-3,4-dihydroxyoxolan-2-yl]methoxy-hydroxyphosphoryl] (2S)-2-amino-3-methylbutanoate
• CAS: 52435-65-1
• 化学式: C₁₅H₂₃N₆O₈P
• 分子量: 446.357
• InChiKey: KAVINRUMCQFLGF-NIXGFCADSA-N

计算性质

• 辛醇/水分配系数(LogP)：
  -4.8
• 重原子数：
  30
• 可旋转键数：
  8
• 环数：
  3.0
• sp3杂化的碳原子比例：
  0.6
• 拓扑面积：
  218
• 氢给体数：
  5
• 氢受体数：
  13

反应信息

• 作为产物：
  描述：

  在 三氟乙酸 作用下， 反应 0.5h， 生成 缬氨酰腺苷酸
  参考文献：
  名称：

  核苷酸的快速，潜在的原始氨基酰化。

  摘要：

  DOI：

  10.1002/anie.200501591

文献信息

• Partitioning of tRNA-dependent Editing between Pre- and Post-transfer Pathways in Class I Aminoacyl-tRNA Synthetases
  作者：Morana Dulic、Nevena Cvetesic、John J. Perona、Ita Gruic-Sovulj

  DOI：10.1074/jbc.m110.133553

  日期：2010.7

  Measurements of the microscopic rate constants for amino acid transfer to tRNA in IleRS and the related valyl-tRNA synthetase (ValRS) further suggest that pre-transfer editing in IleRS is an enzyme-catalyzed activity residing in the synthetic active site. In this model, the balance between pre-transfer and post-transfer editing pathways is controlled by kinetic partitioning of the noncognate aminoacyl-adenylate

  水解编辑活性存在于氨酰基-tRNA 合成酶中，在合成反应中具有降低的氨基酸歧视。I类编辑酶中错酰化tRNA的转移后水解发生在插入催化Rossmann折叠的空间分离域中，但错活氨基酸的转移前水解的位置和机制尚不确定。在这里，我们使用新的动力学方法来区分大肠杆菌异亮氨酰-tRNA 合成酶 (IleRS) 的三种预转移编辑模型。我们证明 IleRS 对非同源缬氨酰腺苷酸的 tRNA 依赖性水解在很大程度上对酶编辑域中的突变不敏感，并且释放后的非催化水解太慢而无法解释观察到的清除率。对 IleRS 中氨基酸转移到 tRNA 的微观速率常数和相关缬氨酰-tRNA 合成酶 (ValRS) 的测量进一步表明，IleRS 中的预转移编辑是一种存在于合成活性位点的酶催化​​活性。在该模型中，转移前和转移后编辑途径之间的平衡由非同源氨酰基腺苷酸的动力学分配控制。在 IleRS 中，非同源中间体的水解和转移的速率常数大致相等，而在
• Expeditious, Potentially Primordial, Aminoacylation of Nucleotides
  作者：Jean-Philippe Biron、Alastair L. Parkes、Robert Pascal、John D. Sutherland

  DOI：10.1002/anie.200501591

  日期：2005.10.21