5'-O-{4,4'-dimethoxy-4''-[2-(N-succinimidyloxycarbonyl)ethyl]trityl}thymidine | 845273-58-7

• 分子结构分类: 有机化合物 - 苯类化合物 - 三苯基化合物
• 英文名称: 5'-O-{4,4'-dimethoxy-4''-[2-(N-succinimidyloxycarbonyl)ethyl]trityl}thymidine
• 英文别名: 5'-O-{4,4'-dimethoxy-4"-[2-(N-succinimidyloxycarbonyl)ethyl]trityl}thymidine；(2,5-dioxopyrrolidin-1-yl) 3-[4-[[(2R,3S,5R)-3-hydroxy-5-(5-methyl-2,4-dioxopyrimidin-1-yl)oxolan-2-yl]methoxy-bis(4-methoxyphenyl)methyl]phenyl]propanoate
• CAS: 845273-58-7
• 化学式: C₃₈H₃₉N₃O₁₁
• 分子量: 713.741
• InChiKey: VEVVAMIWFXPSLD-BEJSXWRTSA-N

物化性质

• 密度：
  1.42±0.1 g/cm3(Predicted)

计算性质

• 辛醇/水分配系数(LogP)：
  2.6
• 重原子数：
  52
• 可旋转键数：
  14
• 环数：
  6.0
• sp3杂化的碳原子比例：
  0.34
• 拓扑面积：
  170
• 氢给体数：
  2
• 氢受体数：
  11

反应信息

• 作为反应物：
  描述：

  5'-O-{4,4'-dimethoxy-4''-[2-(N-succinimidyloxycarbonyl)ethyl]trityl}thymidine 、 双(二异丙基氨基)(2-氰基乙氧基)膦 在 N,N-二异丙基乙胺 作用下， 以 二氯甲烷 为溶剂， 反应 2.0h， 生成 5'-O-{4,4'-dimethoxy-4''-[2-(N-succinimidyloxycarbonyl)ethyl]trityl}-3'-O-(diisopropylamino-2-cyanoethoxyphophinyl)thymidine
  参考文献：
  名称：

  Derivatised molecules for mass spectrometry

  摘要：

  式（IIa）的化合物如下所示： 其中： X是一个能够从α-碳原子上被切断以形成式（I'）离子的基团； C是带有单一正电荷或单一负电荷的碳原子； 本发明还提供了式（IIb）的化合物： 其中： X是C的对离子。 式（IIa）和（IIb）的化合物可以通过在式（IIa）的化合物中切断X和α-碳原子之间的C-X键，或在式（IIb）的化合物中解离X，形成式（I'）离子。

  公开号：

  EP1506959A2
• 作为产物：
  描述：

  3-{4-[chlorobis(4-methoxyphenyl)methyl]phenyl}propionic acid, N-oxysuccinimide ester 、 beta-胸苷 在 吡啶 作用下， 反应 4.0h， 以68%的产率得到5'-O-{4,4'-dimethoxy-4''-[2-(N-succinimidyloxycarbonyl)ethyl]trityl}thymidine
  参考文献：
  名称：

  Novel Mass Tags for Single Nucleotide Polymorphism Detection

  摘要：

  基于寡核苷酸探针延伸，一种适用于单核苷酸多态性检测和其他应用的新方法应运而生。该方法以质谱法为基础，利用单一表面对延伸探针进行亲和纯化，并对可裂解标签进行基质无关的解吸/电离。本研究采用了一种新的硫键激光可裂解三苯甲基标签系列，其飞行能力大大提高。同时还介绍了与自动寡核苷酸合成兼容的相应试剂。证明了这种方法在 SNP 基因分型中的实用性。

  DOI：

  10.1021/ac071291y