2-(3-methyl-3H-diaziren-3-yl)ethanamine hydrochloride | 25055-95-2

• 分子结构分类: 有机化合物 - 有机杂环化合物 - 氮杂环化合物
• 英文名称: 2-(3-methyl-3H-diaziren-3-yl)ethanamine hydrochloride
• 英文别名: 2-(3-methyl-3H-diazirin-3-yl)ethan-1-amine hydrochloride；2-(3-methyl-3H-diazirine-3-yl)ethan-1-amine hydrochloride；2-(3-methyldiazirin-3-yl)ethanamine;hydrochloride
• CAS: 25055-95-2
• 化学式: C₄H₉N₃*ClH
• 分子量: 135.596
• InChiKey: FRFGUOSTTGCQSM-UHFFFAOYSA-N

计算性质

• 辛醇/水分配系数(LogP)：
  0.94
• 重原子数：
  8
• 可旋转键数：
  2
• 环数：
  1.0
• sp3杂化的碳原子比例：
  1.0
• 拓扑面积：
  50.7
• 氢给体数：
  2
• 氢受体数：
  3

反应信息

• 作为反应物：
  描述：

  5-[(1,2-二氢-2-氧代-3H-吲哚-3-基)甲基]-2,4-二甲基-1H-吡咯-3-丙酸 、 2-(3-methyl-3H-diaziren-3-yl)ethanamine hydrochloride 在 盐酸-N-乙基-Nˊ-(3-二甲氨基丙基)碳二亚胺 、 N,N-二异丙基乙胺 作用下， 以 乙酸乙酯 为溶剂， 反应 12.0h， 以53%的产率得到
  参考文献：
  名称：

  Characterization of Protein Kinase ULK3 Regulation by Phosphorylation and Inhibition by Small Molecule SU6668

  摘要：

  丝氨酸/苏氨酸蛋白激酶 ULK3 参与多种细胞过程，包括自噬、细胞分裂和 Sonic Hedgehog 通路的执行。然而，人们对如何控制其生物活性知之甚少。本研究的重点是揭示 ULK3 抑制和激活机制的生化见解。我们鉴定了 ULK3 中的新磷酸化位点，并表明自磷酸化对该蛋白的激酶活性没有影响。我们进一步证明，ULK3 激酶结构域中的两个残基被一种尚未鉴定的激酶磷酸化可能会完全消除其催化活性。我们发现，一种低分子量抑制剂 SU6668，被设计为酪氨酸激酶的 ATP 竞争性抑制剂，结合在 ULK3 的 ATP 口袋中，但以部分 ATP 非竞争性方式抑制 ULK3 激酶活性。最后，我们证明，计算机注释的 ULK3 激酶结构域不足以发挥其激酶活性，需要 271-300 区域中的额外氨基酸。

  DOI：

  10.1021/acs.biochem.8b00356
• 作为产物：
  描述：

  tert-butyl (2-(3-methyl-3H-diazirin-3-yl)ethyl)carbamate 在 盐酸 作用下， 以 1,4-二氧六环 、 甲醇 为溶剂， 反应 0.5h， 以100%的产率得到2-(3-methyl-3H-diaziren-3-yl)ethanamine hydrochloride
  参考文献：
  名称：

  绘制人类细胞中完全功能化小分子探针的蛋白质相互作用图谱

  摘要：

  表型筛选提供了一种发现干扰细胞生物过程的小分子的方法。然而，识别筛选命中所针对的蛋白质和生化途径在技术上仍然具有挑战性。我们最近描述了使用带有光反应基团和潜在亲和手柄的小分子作为用于综合表型筛选和目标识别的全功能化探针。这种探针的一般效用，或者就此而言，任何小分子筛选库，取决于它们在细胞中的蛋白质相互作用的范围，这个参数在很大程度上仍未被探索。在这里，我们描述了一个~60 个成员的全功能化探针库的合成，由 Ugi-叠氮化物缩合反应制备，以赋予结构多样性并分别引入二氮丙啶和炔烃官能团用于目标捕获和富集。基于质谱的深入分析揭示了人类细胞中的多种探针靶标，包括酶、通道、接头和支架蛋白，以及未表征功能的蛋白质。对于这些蛋白质中的许多，尚未描述配体。大多数探针-蛋白质相互作用在整个探针库中显示出明确定义的结构-活性关系，并被细胞中的小分子竞争者阻断。这些发现表明，完全功能化的小分子涵盖了人类蛋白质组

  DOI：

  10.1021/ja505517t

文献信息

• Discovery of a Class of Potent and Selective Non‐competitive Sentrin‐Specific Protease 1 Inhibitors
  作者：Urs Lindenmann、Michael Brand、Flavio Gall、David Frasson、Lukas Hunziker、Ivana Kroslakova、Martin Sievers、Rainer Riedl

  DOI：10.1002/cmdc.202000067

  日期：2020.4.20

  an overexpression of SENP1, which promotes prostate cancer progression as well as metastasis. Therefore, SENP1 has been identified as a novel drug target against prostate cancer. Herein, we report the discovery and biological evaluation of potent and selective SENP1 inhibitors. A structure-activity relationship (SAR) of the newly identified pyridone scaffold revealed allosteric inhibitors with very

  Sentrin特异性蛋白酶（SENP）负责小的泛素样修饰剂（SUMO）的成熟以及SUMO从其底物蛋白的脱结合。对前列腺癌的研究表明SENP1的过表达，可促进前列腺癌的进展以及转移。因此，SENP1已被确定为针对前列腺癌的新型药物靶标。在这里，我们报告了有效的和选择性的SENP1抑制剂的发现和生物学评估。新发现的吡啶酮支架的构效关系（SAR）显示出变构抑制剂具有极具吸引力的体外ADMET特性，涉及该挑战目标的血浆结合和血浆稳定性。该研究还强调了从头设计抑制剂的生化抑制研究模式的重要性。
• Mapping the Protein Interaction Landscape for Fully Functionalized Small-Molecule Probes in Human Cells
  作者：Tohru Kambe、Bruno E. Correia、Micah J. Niphakis、Benjamin F. Cravatt

  DOI：10.1021/ja505517t

  日期：2014.7.30

  Phenotypic screening provides a means to discover small molecules that perturb cell biological processes. Discerning the proteins and biochemical pathways targeted by screening hits, however, remains technically challenging. We recently described the use of small molecules bearing photoreactive groups and latent affinity handles as fully functionalized probes for integrated phenotypic screening and

  表型筛选提供了一种发现干扰细胞生物过程的小分子的方法。然而，识别筛选命中所针对的蛋白质和生化途径在技术上仍然具有挑战性。我们最近描述了使用带有光反应基团和潜在亲和手柄的小分子作为用于综合表型筛选和目标识别的全功能化探针。这种探针的一般效用，或者就此而言，任何小分子筛选库，取决于它们在细胞中的蛋白质相互作用的范围，这个参数在很大程度上仍未被探索。在这里，我们描述了一个~60 个成员的全功能化探针库的合成，由 Ugi-叠氮化物缩合反应制备，以赋予结构多样性并分别引入二氮丙啶和炔烃官能团用于目标捕获和富集。基于质谱的深入分析揭示了人类细胞中的多种探针靶标，包括酶、通道、接头和支架蛋白，以及未表征功能的蛋白质。对于这些蛋白质中的许多，尚未描述配体。大多数探针-蛋白质相互作用在整个探针库中显示出明确定义的结构-活性关系，并被细胞中的小分子竞争者阻断。这些发现表明，完全功能化的小分子涵盖了人类蛋白质组
• Characterization of Protein Kinase ULK3 Regulation by Phosphorylation and Inhibition by Small Molecule SU6668
  作者：Lagle Kasak、Mihkel Näks、Priit Eek、Alla Piirsoo、Rohit Bhadoria、Pavel Starkov、Merilin Saarma、Sergo Kasvandik、Marko Piirsoo

  DOI：10.1021/acs.biochem.8b00356

  日期：2018.9.18

  Serine/threonine protein kinase ULK3 is implicated in a variety of cellular processes, including autophagy, cell division, and execution of the Sonic hedgehog pathway. However, very little about how its biological activity could be controlled is known. This study focuses on unraveling biochemical insights into the mechanism of inhibition and activation of ULK3. We identify novel phosphorylation sites in ULK3 and show that autophosphorylation has no impact on the kinase activity of the protein. We further demonstrate that phosphorylation of two residues in the kinase domain of ULK3 by an as yet unidentified kinase may completely abolishes its catalytic activity. We show that a low-molecular weight inhibitor SU6668, designed as an ATP competitive inhibitor for tyrosine kinases, binds in the ATP pocket of ULK3 yet inhibits ULK3 kinase activity in a partially ATP noncompetitive manner. Finally, we demonstrate that the ULK3 kinase domain, annotated in silico, is not sufficient for its kinase activity, and additional amino acids in the 271–300 region are required.

  丝氨酸/苏氨酸蛋白激酶 ULK3 参与多种细胞过程，包括自噬、细胞分裂和 Sonic Hedgehog 通路的执行。然而，人们对如何控制其生物活性知之甚少。本研究的重点是揭示 ULK3 抑制和激活机制的生化见解。我们鉴定了 ULK3 中的新磷酸化位点，并表明自磷酸化对该蛋白的激酶活性没有影响。我们进一步证明，ULK3 激酶结构域中的两个残基被一种尚未鉴定的激酶磷酸化可能会完全消除其催化活性。我们发现，一种低分子量抑制剂 SU6668，被设计为酪氨酸激酶的 ATP 竞争性抑制剂，结合在 ULK3 的 ATP 口袋中，但以部分 ATP 非竞争性方式抑制 ULK3 激酶活性。最后，我们证明，计算机注释的 ULK3 激酶结构域不足以发挥其激酶活性，需要 271-300 区域中的额外氨基酸。