N6-methyl AMP | 4229-50-9

• 分子结构分类: 有机化合物 - 核苷、核苷酸和类似物 - 嘌呤核苷酸
• 英文名称: N6-methyl AMP
• 英文别名: N⁶-methyladenosine 5'-monophosphate；N6-methyladenosine-5’-monophosphate；6-N-methyladenosine 5'-monophosphate；N6-methyl-5'-phosphoadenosine；N⁶-methyl-AMP；6-N-methyl AMP；N6-Methyladenosine-5'-monophosphate；[(2R,3S,4R,5R)-3,4-dihydroxy-5-[6-(methylamino)purin-9-yl]oxolan-2-yl]methyl dihydrogen phosphate
• CAS: 4229-50-9
• 化学式: C₁₁H₁₆N₅O₇P
• 分子量: 361.251
• InChiKey: WETVNPRPZIYMAC-IOSLPCCCSA-N

物化性质

• 溶解度：
  甲醇（微溶）、水（微溶）

计算性质

• 辛醇/水分配系数(LogP)：
  -2.9
• 重原子数：
  24
• 可旋转键数：
  5
• 环数：
  3.0
• sp3杂化的碳原子比例：
  0.55
• 拓扑面积：
  172
• 氢给体数：
  5
• 氢受体数：
  11

反应信息

• 作为反应物：
  描述：

  N6-methyl AMP 在 水 1,4-二巯基-2,3-丁二醇 作用下， 生成 5’-肌苷酸
  参考文献：
  名称：

  Human N6-Methyl-AMP/DAMP Aminohydrolase (Abacavir 5'-Monophosphate Deaminase) is Capable of Metabolizing N6-Substituted Purine Acyclic Nucleoside Phosphonates

  摘要：

  重组人阿巴卡韦单磷酸脱氨酶（hABC-MP deaminase）与最近描述的大鼠N6-甲基-AMP（meAMP）氨水解酶进行了比较。在非变性条件下，重组的hABC-MP deaminase是一个42 kDa的多肽，主要存在于单体形式。与大鼠酶类似，hABC-MP deaminase有效催化天然底物meAMP（5）、N6，N6-二甲基-AMP（13）和medAMP（6）的水解脱氨作用。抗白血病药物GS-9219的中间细胞内代谢产物脱环丙基-2,6-二氨基-9-[2-(磷酸甲氧基)乙基]嘌呤（cPrPMEDAP）（1）被hABC-MP deaminase有效地转化为相应的活性鸟嘌呤类似物。除了cPrPMEDAP（1）之外，许多其他生物活性的N6-取代嘌呤ANPs也是hABC-MP deaminase的替代底物。它们的脱氨效率取决于腺嘌呤和/或2,6-二氨基嘌呤环中N6-取代的性质。具有N6-环状取代基的ANPs比相同长度的脂肪取代基的相应化合物更容易脱氨。ANPs的脱氨也受到磷酸烷基侧链修饰的影响。在9-[2-(磷酸甲氧基)丙基] ANPs中，（S）-对映体比（R）-对映体更受欢迎。或者，存在扩展的9-[2-(磷酸乙氧基)乙基]基团会使反应速率与cPrPMEDAP（1）相比有适度的增加。在广泛的N6-取代底物上比较hABC-MP deaminase和大鼠meAMP氨水解酶，发现它们的底物特异性强相关。与大鼠meAMP氨水解酶类似，hABC-MP deaminase对脱氧可酶霉素单磷酸具有高度敏感性，但对cPrPMEDAP（1）脱氨产物的鸟嘌呤没有敏感性。这些数据表明，hABC-MP deaminase是人类meAMP氨水解酶，参与了生物活性N6-取代核苷酸类似物的细胞内激活。

  DOI：

  10.1135/cccc20080275
• 作为产物：
  描述：

  N⁶-methyladenosine 在 磷酸三乙酯 、 水 、 三氯氧磷 作用下， 反应 2.0h， 生成 N6-methyl AMP
  参考文献：
  名称：

  结核分枝杆菌腺苷5'-磷酸硫酸还原酶中关键配体结合决定因素的鉴定

  摘要：

  结核分枝杆菌5'-磷酸腺苷 (APS) 还原酶是一种铁硫蛋白，是开发新型抗结核药物的有效靶点，特别是用于治疗潜伏感染。为了促进 APS 还原酶的强效和特异性抑制剂的开发，我们通过一系列底物和产物类似物探索了作为结合和特异性基础的分子决定因素。我们的研究强调了特定取代基团对底物结合的重要性，并为配体特异性构象状态提供了功能证据。已为结核分枝杆菌APS 还原酶开发了一个活性位点模型，该模型与此处提供的结果以及铜绿假单胞菌报告的先前结构数据一致APS 还原酶和相关酶。该模型说明了 APS 还原酶与配体相互作用所需的功能特征，并为合理设计小分子作为人类病原体（包括结核分枝杆菌）中存在的 APS 还原酶的潜在抑制剂提供了药理学路线图。

  DOI：

  10.1021/jm900728u

文献信息

• An Improved One-Pot Synthesis of Nucleoside 5′-Triphosphate Analogues
  作者：Irina Gillerman、Bilha Fischer

  DOI：10.1080/15257771003709569

  日期：2010.4.20

  Nucleoside 5′-triphosphate (NTP) analogues are valuable tools for biochemical and medicinal research. Therefore, a facile and efficient synthesis of NTP analogues is required. Here, we report on an improved nucleoside 5′-triphosphorylation procedure to obtain pure products after liquid chromotagrpahy (LC) separation with no need for high performance liquid chromatography (HPLC) purification. To improve

  核苷5'-三磷酸（NTP）类似物是用于生物化学和药物研究的有价值的工具。因此，需要简便有效地合成NTP类似物。在这里，我们报告了一种改进的核苷5'-三磷酸化程序，可在液相色谱（LC）分离后获得纯产物，而无需进行高效液相色谱（HPLC）纯化。为了提高反应的选择性，我们尝试优化几个参数，例如溶剂，焦磷酸亲核性，反应时间和温度。最终，根据使用31监测随时间变化的产物分布，通过降低温度至-15°C并将反应时间增加至2小时来优化反应。1 H NMR。此外，在LC分离后，NTP以纯产物形式获得，这在原始的Ludwig程序中是不可能的。所有研究的天然和合成核苷均获得了良好的收率。
• MODIFIED NUCLEIC ACID MOLECULES AND USES THEREOF
  申请人：MODERNA THERAPEUTICS, INC.

  公开号：US20150307542A1

  公开（公告）日：2015-10-29

  The present disclosure provides modified nucleosides, nucleotides, and nucleic acids, and methods of using them.

  本公开提供了修改的核苷酸，核苷酸和核酸，以及使用它们的方法。
• Glycosylation site-specific antibodies and anti-cancer compounds
  申请人：Kim Hyesook

  公开号：US10317409B2

  公开（公告）日：2019-06-11

  A method of characterizing the protein O-GlcNAcylation site-specificity of an antibody. A method of detecting or quantitating the expression of site-specific O-GlcNAcylated proteins expressed in cells and biological samples. A method of diagnosing cancer in a host based on the cellular expression of site-specific O-GlcNAcylated proteins. A method of screening anti-cancer compounds according to their ability to increase a level O-GlcNAcylation of oncogene or tumor suppressor proteins. Methods of treating cancer in an animal host by administering compounds that increase a level of O-GlcNAcylated c-myc or p53 in cancer cells. A method of distinguishing subclasses of pancreatic cancer according to the sensitivity of pancreatic cancer cells to an imidazole derivative, and a method of personalized pancreatic cancer treatment delivered according to the sensitivity subclasses.

  一种鉴定抗体的蛋白质 O-GlcNAcylation 位点特异性的方法。一种检测或量化细胞和生物样本中表达的位点特异性 O-GlcNAcylated 蛋白表达的方法。一种根据细胞中表达的位点特异性 O-GlcNA 化蛋白诊断宿主癌症的方法。一种根据抗癌化合物提高癌基因或肿瘤抑制蛋白的 O-GlcNAcylation 水平的能力筛选抗癌化合物的方法。通过施用能提高癌细胞中 c-myc 或 p53 的 O-GlcNA 化水平的化合物来治疗动物宿主癌症的方法。根据胰腺癌细胞对咪唑衍生物的敏感性区分胰腺癌亚类的方法，以及根据敏感性亚类进行个性化胰腺癌治疗的方法。
• Methods for modulating taste receptors
  申请人：MARS, INCORPORATED

  公开号：US11185100B2

  公开（公告）日：2021-11-30

  Amino acids present in domains of an umami taste receptor are described herein, wherein the amino acids interact with at least one nucleotide derivative and/or at least one transmembrane compound that potentiates, modulates, increases, and/or enhances the activity of the umami receptor. Such compounds can be used in flavor compositions to enhance the umami taste and/or palatability of food products.

  本文描述了存在于鲜味受体结构域中的氨基酸，其中氨基酸与至少一种核苷酸衍生物和/或至少一种跨膜化合物相互作用，从而增强、调节、增加和/或提高鲜味受体的活性。此类化合物可用于调味组合物，以增强食品的鲜味和/或适口性。
• Aberrant Cyclization Affords a C-6 Modified Cyclic Adenosine 5′-Diphosphoribose Analogue with Biological Activity in Jurkat T Cells
  作者：Christelle Moreau、Tanja Kirchberger、Bo Zhang、Mark P. Thomas、Karin Weber、Andreas H. Guse、Barry V. L. Potter

  DOI：10.1021/jm201127y

  日期：2012.2.23

  Two nicotinamide adenine dinucleotide (NAD(+)) analogues modified at the 6 position of the purine ring were synthesized, and their substrate properties toward Aplysia californica ADP-ribosyl cyclase were investigated. 6-N-Methyl NAD(+) (6-N-methyl nicotinamide adenosine 5'-dinucleotide 10) hydrolyzes to give the linear 6-N-methyl ADPR (adenosine 5'-diphosphoribose, 11), whereas 6-thio NHD+ (nicotinamide 6-mercaptopurine 5'-dinucleotide, 17) generates a cyclic dinucleotide. Surprisingly, NMR correlation spectra confirm this compound to be the N1 cyclic product 6-thio N1-cIDPR (6-thio cyclic inosine 5'-diphosphoribose, 3), although the corresponding 6-oxo analogue is well-known to cyclize at N7. In Jurkat T cells, unlike the parent cyclic inosine 5'-diphosphoribose N1-cIDPR 2, 6-thio N1-cIDPR antagonizes both cADPR- and N1-cIDPR-induced Ca2+ release but possesses weak agonist activity at higher concentration. 3 is thus identified as the first C-6 modified cADPR (cyclic adenosine 5'-diphosphoribose) analogue antagonist; it represents the first example of a fluorescent N1-cyclized cADPR analogue and is a new pharmacological tool for intervention in the cADPR pathway of cellular signaling.