rhodamine B N-methylethanolamine amide | 435304-67-9

• 分子结构分类: 有机化合物 - 有机杂环化合物 - 苯并吡喃
• 英文名称: rhodamine B N-methylethanolamine amide
• 英文别名: [6-(Diethylamino)-9-[2-[2-hydroxyethyl(methyl)carbamoyl]phenyl]xanthen-3-ylidene]-diethylazanium
• CAS: 435304-67-9
• 化学式: C₃₁H₃₈N₃O₃
• 分子量: 500.661
• InChiKey: VSEMVKZJKJXMES-UHFFFAOYSA-N

计算性质

• 辛醇/水分配系数(LogP)：
  3.6
• 重原子数：
  37
• 可旋转键数：
  9
• 环数：
  4.0
• sp3杂化的碳原子比例：
  0.35
• 拓扑面积：
  56
• 氢给体数：
  1
• 氢受体数：
  4

反应信息

• 作为反应物：
  描述：

  rhodamine B N-methylethanolamine amide 、 2-cyanoethyl bis(diisopropylamino)phosphite 在 四氮唑 作用下， 以 二氯甲烷 为溶剂， 反应 1.0h， 生成 rhodamine B phosphoramidite
  参考文献：
  名称：

  Rhodamine-based fluorophores useful as labeling reagents

  摘要：

  基于罗丹明的荧光染料被衍生化以形成标记的共轭物，当受到适当波长的光激发时会发出荧光。特别优选的实施例是某些单异构体形式的罗丹明磷酰胺。这些罗丹明磷酰胺通过固相法增强了合成罗丹明标记寡核苷酸的效率。该发明的共轭物实施例由于具有源自第3位羧酸的全取代酰胺连接，因此防止被转化为非荧光内酰胺形式。

  公开号：

  US06750357B1
• 作为产物：
  描述：

  N-甲基-2-羟基乙胺 、 罗丹明B 在 (benzotriazo-1-yloxy)tris(dimethylamino)phosphonium hexafluorophosphate 作用下， 以 二氯甲烷 为溶剂， 生成 rhodamine B N-methylethanolamine amide
  参考文献：
  名称：

  Rhodamine-based fluorophores useful as labeling reagents

  摘要：

  基于罗丹明的荧光染料被衍生化以形成标记的共轭物，当受到适当波长的光激发时会发出荧光。特别优选的实施例是某些单异构体形式的罗丹明磷酰胺。这些罗丹明磷酰胺通过固相法增强了合成罗丹明标记寡核苷酸的效率。该发明的共轭物实施例由于具有源自第3位羧酸的全取代酰胺连接，因此防止被转化为非荧光内酰胺形式。

  公开号：

  US06750357B1

文献信息

• XANTHENE DYES
  申请人：Reddington Mark

  公开号：US20080214811A1

  公开（公告）日：2008-09-04

  The invention provides a novel class of xanthene dyes, some of which are functionalized to allow their coupling to conjugation partners of interest, e.g. biomolecules, drugs, toxins and the like. Also provided are conjugates of the dyes, methods of preparing and using the dyes and their conjugates and kits including the dyes and their conjugates.

  本发明提供了一类新型的苏丹红染料，其中一些染料被功能化以允许它们与感兴趣的共轭伴侣（例如生物分子、药物、毒素等）耦合。还提供了这些染料的共轭物、制备和使用这些染料及其共轭物的方法以及包括这些染料及其共轭物的试剂盒。
• US7344701B2
  申请人：——

  公开号：US7344701B2

  公开（公告）日：2008-03-18
• Rhodamine-based fluorophores useful as labeling reagents
  申请人：SynGen, Inc.

  公开号：US06750357B1

  公开（公告）日：2004-06-15

  Fluorescent dyes based on rhodamine are derivatized to form labeled conjugates that fluoresce upon excitation with light of an appropriate wavelength. Particularly preferred embodiments are certain single isomer form rhodamine phosphoramidites. These rhodamine phosphoramidites enhance the efficiency of synthesizing rhodamine-labeled oligonucleotides by solid phase methods. Conjugate embodiments of the invention are prevented from being converted to a non-fluorescent lactam form due to having a fully substituted amide linkage derived from the 3-position carboxylate.

  基于罗丹明的荧光染料被衍生化以形成标记的共轭物，当受到适当波长的光激发时会发出荧光。特别优选的实施例是某些单异构体形式的罗丹明磷酰胺。这些罗丹明磷酰胺通过固相法增强了合成罗丹明标记寡核苷酸的效率。该发明的共轭物实施例由于具有源自第3位羧酸的全取代酰胺连接，因此防止被转化为非荧光内酰胺形式。