5-(Tritylamino)pentylmethoxymethylenemalononitrile | 129357-73-9

• 分子结构分类: 有机化合物 - 苯类化合物 - 三苯基化合物
• 英文名称: 5-(Tritylamino)pentylmethoxymethylenemalononitrile
• 英文别名: {1-Methoxy-6-[(triphenylmethyl)amino]hexylidene}propanedinitrile；2-[1-methoxy-6-(tritylamino)hexylidene]propanedinitrile
• CAS: 129357-73-9
• 化学式: C₂₉H₂₉N₃O
• 分子量: 435.569
• InChiKey: YXVQDQCNQROHKK-UHFFFAOYSA-N

计算性质

• 辛醇/水分配系数(LogP)：
  5.7
• 重原子数：
  33
• 可旋转键数：
  11
• 环数：
  3.0
• sp3杂化的碳原子比例：
  0.24
• 拓扑面积：
  68.8
• 氢给体数：
  1
• 氢受体数：
  4

反应信息

• 作为反应物：
  描述：

  5-(Tritylamino)pentylmethoxymethylenemalononitrile 以 甲醇 、 一水合肼 为溶剂， 以7.1 g (100%)的产率得到5-amino-3-[(5-tritylamino)pentyl]pyrazole-4-carbonitrile
  参考文献：
  名称：

  Crosslinking oligonucleotides

  摘要：

  寡核苷酸（ODNs）包括一个与单链RNA、单链或双链DNA中的目标序列互补的序列，以及一个烷基化功能，在杂交后烷基化目标序列。适用于烷基化单链RNA（如信使RNA）的ODNs在沃森-克里克意义上与目标序列互补。适用于烷基化双链DNA的ODNs至少具有两个烷基化功能，并且在胡格斯汀或反向胡格斯汀意义上与目标序列互补。使用这些ODNs，目标序列的两条链都会被烷基化。第三类ODNs具有至少大约26个核苷酸单元的连续序列，与双链DNA的目标序列互补，且烷基化功能共价连接到连续序列中的一个核苷酸单元上。在存在重组酶的情况下，使用这类ODNs进行烷基化或交联。

  公开号：

  US05849482A1
• 作为产物：
  描述：

  5-(Tritylamino)pentylhydroxymethylenemalononitrile 、 重氮甲烷 、 溶剂黄146 在 ice 、 silica gel 、 二氯甲烷 作用下， 以 methylene chloride diethyl ether 为溶剂， 反应 6.0h， 以to give 8.3 g (61%) of chromatographically pure product的产率得到5-(Tritylamino)pentylmethoxymethylenemalononitrile
  参考文献：
  名称：

  Cross-linking oligonucleotides

  摘要：

  本发明涉及具有交联臂的新型取代核苷酸碱基，其实现了寡核苷酸或寡脱氧核苷酸相邻链上特定位点的交联。本发明还涉及至少包含这些交联剂的寡核苷酸和使用所得到的新型寡核苷酸进行诊断和治疗的用途。本发明的交联剂具有以下式(I')：R.sub.1--B--(CH.sub.2).sub.q--(Y).sub.r--(CH.sub.2).sub.m--A'(I')，其中，R.sub.1是氢，或糖基或其类似物，其在其3'或5'位置可选地与通过氧原子连接到糖基的磷酸衍生物或其反应前体Q.sub.1 Q.sub.2和Q.sub.3基团或适合于核苷酸键形成的反应前体取代；Q.sub.1是羟基、磷酸酯或二磷酸酯；Q.sub.2是.dbd.O或.dbd.S；Q.sub.3是CH.sub.2--R'、S--R'、O--R'或N--R'R"，其中R'和R"各自独立地是氢或C.sub.1-6烷基；B是寡核苷酸的组成部分的核酸碱基或其类似物；Y是功能性连接基团；m和q各自独立地为0到8，包括0和8；r为0或1；A'为离去基团。本发明还涉及新型3,4-二取代和3,4-三取代吡唑并[3,4-d]嘧啶以及将这些核酸碱基用于寡核苷酸的制备的用途。本发明包括至少包含这些吡唑嘧啶的核苷酸和单核苷酸和寡核苷酸，并将所得到的新型寡核苷酸用于诊断目的。

  公开号：

  US05824796A1

文献信息

• Selective binding complementary oligonucleotides
  申请人：Epoch Pharmaceuticals, Inc.

  公开号：US05912340A1

  公开（公告）日：1999-06-15

  In a matched pair of oligonucleotides (ODNS) each member of the pair is complementary or substantially complementary in the Watson Crick sense to a target sequence of duplex nucleic acid where the two strands of the target sequence are themselves complementary to one another. The ODNs include modified bases of such nature that the modified base forms a stable hydrogen bonded base pair with the natural partner base, but does not form a stable hydrogen bonded base pair with its modified partner. This is accomplished when in a hybridized structure the modified base is capable of forming two or more hydrogen bonds with its natural complementary base, but only one hydrogen bond with its modified partner. Due to the lack of stable hydrogen bonding with each other, the matched pair of oligonucleotides have a melting temperature under physiological or substantially physiological conditions of approximately 40.degree. C. or less. However each of the matched ODN pair of the invention forms a substantially stable hybrid with the target sequence in each strand of the duplex nucleic acid. The hybrids of target duplex nucleic acids formed with the ODN pairs of the invention are useful for gene mapping and in diagnostic and therapeutic applications.

  在一对匹配的寡核苷酸（ODNS）中，每个成员都在Watson Crick意义上与双链核酸的靶序列互补或基本互补，其中靶序列的两条链本身是互补的。ODNS包括被修改的碱基，这种碱基与天然伴侣碱基形成稳定的氢键配对，但与其修改后的伴侣碱基不形成稳定的氢键配对。当在杂交结构中，修改的碱基能够与其天然互补碱基形成两个或更多氢键，但只能与其修改后的伴侣碱基形成一个氢键时，就能实现这一点。由于彼此之间缺乏稳定的氢键配对，在生理或基本生理条件下，匹配的寡核苷酸对的熔化温度约为40℃或更低。然而，本发明的每个匹配的ODN对都与双链核酸的每条链的靶序列形成基本稳定的杂交。使用本发明的ODN对形成的靶双链核酸的杂交物在基因组图谱绘制以及诊断和治疗应用中非常有用。
• USRE038416E1
  申请人：——

  公开号：——

  公开（公告）日：——
• CROSS-LINKING OLIGONUCLEOTIDES FOR ENZYME-MEDIATED TRIPLE STRAND FORMATION
  申请人：MICROPROBE CORPORATION

  公开号：EP0661979A1

  公开（公告）日：1995-07-12
• EP0661979A4
  申请人：——

  公开号：EP0661979A4

  公开（公告）日：1995-09-13
• CROSS-LINKING OLIGONUCLEOTIDES
  申请人：MICROPROBE CORPORATION

  公开号：EP0842186A1

  公开（公告）日：1998-05-20