rhodamine B phosphoramidite | 435304-70-4

• 分子结构分类: 有机化合物 - 有机杂环化合物 - 苯并吡喃
• 英文名称: rhodamine B phosphoramidite
• 英文别名: [9-[2-[2-[2-Cyanoethoxy-[di(propan-2-yl)amino]phosphanyl]oxyethyl-methylcarbamoyl]phenyl]-6-(diethylamino)xanthen-3-ylidene]-diethylazanium
• CAS: 435304-70-4
• 化学式: C₄₀H₅₅N₅O₄P
• 分子量: 700.882
• InChiKey: MTFQVXAHCUXFQC-UHFFFAOYSA-N

计算性质

• 辛醇/水分配系数(LogP)：
  5.6
• 重原子数：
  50
• 可旋转键数：
  17
• 环数：
  4.0
• sp3杂化的碳原子比例：
  0.47
• 拓扑面积：
  81.3
• 氢给体数：
  0
• 氢受体数：
  7

反应信息

• 作为产物：
  描述：

  rhodamine B N-methylethanolamine amide 、 2-cyanoethyl bis(diisopropylamino)phosphite 在 四氮唑 作用下， 以 二氯甲烷 为溶剂， 反应 1.0h， 生成 rhodamine B phosphoramidite
  参考文献：
  名称：

  Rhodamine-based fluorophores useful as labeling reagents

  摘要：

  基于罗丹明的荧光染料被衍生化以形成标记的共轭物，当受到适当波长的光激发时会发出荧光。特别优选的实施例是某些单异构体形式的罗丹明磷酰胺。这些罗丹明磷酰胺通过固相法增强了合成罗丹明标记寡核苷酸的效率。该发明的共轭物实施例由于具有源自第3位羧酸的全取代酰胺连接，因此防止被转化为非荧光内酰胺形式。

  公开号：

  US06750357B1