1-[3-(tert-butyldimethylsilanyloxymethyl)-5-(4,4'-dimethoxytrityloxymethyl)phenyl]cytosine | 867259-30-1

• 分子结构分类: 有机化合物 - 苯类化合物 - 三苯基化合物
• 英文名称: 1-[3-(tert-butyldimethylsilanyloxymethyl)-5-(4,4'-dimethoxytrityloxymethyl)phenyl]cytosine
• 英文别名: 4-Amino-1-[3-[[bis(4-methoxyphenyl)-phenylmethoxy]methyl]-5-[[tert-butyl(dimethyl)silyl]oxymethyl]phenyl]pyrimidin-2-one
• CAS: 867259-30-1
• 化学式: C₃₉H₄₅N₃O₅Si
• 分子量: 663.889
• InChiKey: JZTWCASHURQGEO-UHFFFAOYSA-N

计算性质

• 辛醇/水分配系数(LogP)：
  7.86
• 重原子数：
  48
• 可旋转键数：
  13
• 环数：
  5.0
• sp3杂化的碳原子比例：
  0.28
• 拓扑面积：
  95.6
• 氢给体数：
  1
• 氢受体数：
  5

反应信息

• 作为反应物：
  描述：

  1-[3-(tert-butyldimethylsilanyloxymethyl)-5-(4,4'-dimethoxytrityloxymethyl)phenyl]cytosine 在 吡啶 、 四丁基氟化铵 作用下， 以 四氢呋喃 为溶剂， 反应 20.0h， 生成 4-N-benzoyl-1-[3-(4,4'-dimethoxytrityloxymethyl)-5-(hydroxymethyl)phenyl]cytosine
  参考文献：
  名称：

  苯磷酸盐骨架的核酸类似物的合成及性质

  摘要：

  描述了由苯磷酸主链组成的核酸类似物的合成和性质。核酸类似物的结构单元由经由联芳基样轴连接至核碱基的双（羟甲基）苯残基组成。通过热变性研究双链体的稳定性。发现由苯磷酸主链组成的双链体的热稳定性高度依赖于它们的序列。具有由混合序列组成的苯磷酸盐主链的双链体在热稳定性上不如天然DNA双链体，而由高嘧啶和高嘌呤序列组成的双链体在热和热力学上比相应的天然DNA双链体更稳定。建议类似物在B型双链体而不是A型双链体中更有效地稳定双链体。因此，由苯磷酸主链组成的双链体，特别是由高嘧啶和高嘌呤序列组成的双链体，可以提供一种新颖的结构基序，可用于开发适用于生物技术和纳米技术领域的新型材料。

  DOI：

  10.1021/jo050635m
• 作为产物：
  描述：

  1-[3-(4,4'-dimethoxytrityloxymethyl)-5-(hydroxymethyl)phenyl]uracil 在 咪唑 、 4-二甲氨基吡啶 、 2,4,6-三异丙基苯磺酰氯 、 三乙胺 作用下， 以 N,N-二甲基甲酰胺 、 乙腈 为溶剂， 反应 21.0h， 生成 1-[3-(tert-butyldimethylsilanyloxymethyl)-5-(4,4'-dimethoxytrityloxymethyl)phenyl]cytosine
  参考文献：
  名称：

  苯磷酸盐骨架的核酸类似物的合成及性质

  摘要：

  描述了由苯磷酸主链组成的核酸类似物的合成和性质。核酸类似物的结构单元由经由联芳基样轴连接至核碱基的双（羟甲基）苯残基组成。通过热变性研究双链体的稳定性。发现由苯磷酸主链组成的双链体的热稳定性高度依赖于它们的序列。具有由混合序列组成的苯磷酸盐主链的双链体在热稳定性上不如天然DNA双链体，而由高嘧啶和高嘌呤序列组成的双链体在热和热力学上比相应的天然DNA双链体更稳定。建议类似物在B型双链体而不是A型双链体中更有效地稳定双链体。因此，由苯磷酸主链组成的双链体，特别是由高嘧啶和高嘌呤序列组成的双链体，可以提供一种新颖的结构基序，可用于开发适用于生物技术和纳米技术领域的新型材料。

  DOI：

  10.1021/jo050635m